FuNGI

A0A1G4IS78

Protein Details

Accession

A0A1G4IS78

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-53	VDPLNSAPAKRKSRKDYQVCIATE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MTVNSSGLELYHLTLQRQSNYVHSCVGHFVDPLNSAPAKRKSRKDYQVCIATETHVELFNVEEGEFQRLTSVPIFATITAMQSLPVETNYSYLVLVTDAGNLSLLQFVNDMGTIRLHSLFNEPFSRSGLRRVAPQRYLQVDPQGRCLFLSATERNRLCYQTDFKNNTLNVSSPLEFRKPNCITIATAVCDVAFDNPVYACLEIDCADQSRHLAFYMLDVGLNHIIQQQQYAVPQDTNFIFTVPNLEKYGINTRPSSHKNDFDDMINPFVIMATTDRLLLQDARGLFKLQVMLPVRSTSVTIISAAVHKLKKEFFMLLQAHNGDLYKVKIVPNEAESLVPLLSVSFFDNIEPSSKLHIFRNGLLMALQEYSGYKLYEFESLGDDANVATSNEHSKVLELPPSPSNLENLSIIQYSKNLNPIVSVSVSETTPLTILAQSKNGLQQLTSGIDFEELITSPLPPNAAGIWSIRFALDSLHRLVFLKLPKATMILQIDEGTLEELAESNNHFKTDGDTTIFVGLMGKRSIVQVCENCMLQVDYDLNTGLMNLKNEWLPPAGIRVLHASCSLSQLALALSNNEIVYFEIDTSSGLETLNEAQSRIELPERITALSLPQCLRSDFLAVGCADSSVKVIQLRGSDEDNFLEVVSIQVLLSSPYSLNLASSNNALLLHIGLDSGVYIRSSVDKVNGQLFDTRTKYIGPKPVKISALSQIDYKSMSLEEDDDDEASERIDQISCAVLHCEKTWLSYEIGDLLCVKPIVLPRNISLEAIADFKTSDLKSNGCCAISSRGSLMIGRFGHFTELEKWFHQEEINTDEDSTEIGSNFNSRFILPDSSDGKVAFVVENHSVAKKCRISICRSGSLLEINSDAAKYLLIDGTCLSAQISRFGTNDCYLVLASNTMKLQTFSVSFKNENGKRIADIKLLHETSVGEKVHAMAAFRDKLLVPIANNLVLYAMGRKQLLKKSISTTPPSITKIVHICQWEDRRIAIGDIHESVTLLLFDKRLNQFISVADDVVKRHVTAVEFLDKSTVIGGDRFGNIWALRVPQSIEKMLDEEYIFFLSKFLGHSQSDIPRNIMECPCKWELVSHFYANDIPTSFRVLKNLNMSDRACVIYTGLQGTIACLVPLITKGEVEFMHKLEDGIRDSDETFFMEAEANRAADARDEFGPERPPNSQSKLSPRPLVEGAFSLVGRDHVAYRSYYVPVKGVVDGDMCEQFLHLYPSEQEFLVKKLKLKNVSQIKSRLAEVRTNHV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.29
3	0.3
4	0.32
5	0.32
6	0.34
7	0.37
8	0.38
9	0.36
10	0.33
11	0.31
12	0.32
13	0.33
14	0.26
15	0.22
16	0.21
17	0.2
18	0.21
19	0.21
20	0.22
21	0.21
22	0.21
23	0.3
24	0.38
25	0.46
26	0.53
27	0.61
28	0.65
29	0.75
30	0.84
31	0.85
32	0.85
33	0.84
34	0.84
35	0.75
36	0.7
37	0.6
38	0.51
39	0.43
40	0.36
41	0.28
42	0.2
43	0.19
44	0.15
45	0.16
46	0.15
47	0.15
48	0.12
49	0.13
50	0.13
51	0.17
52	0.17
53	0.15
54	0.15
55	0.15
56	0.18
57	0.17
58	0.17
59	0.12
60	0.15
61	0.16
62	0.14
63	0.17
64	0.15
65	0.15
66	0.14
67	0.14
68	0.12
69	0.12
70	0.13
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.11
75	0.12
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.08
82	0.09
83	0.08
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.08
89	0.08
90	0.11
91	0.1
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.1
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.11
102	0.13
103	0.13
104	0.14
105	0.19
106	0.21
107	0.24
108	0.28
109	0.27
110	0.26
111	0.3
112	0.33
113	0.28
114	0.34
115	0.36
116	0.34
117	0.42
118	0.49
119	0.54
120	0.54
121	0.58
122	0.58
123	0.56
124	0.58
125	0.52
126	0.54
127	0.53
128	0.49
129	0.53
130	0.47
131	0.42
132	0.38
133	0.36
134	0.27
135	0.23
136	0.3
137	0.27
138	0.31
139	0.4
140	0.4
141	0.43
142	0.46
143	0.44
144	0.39
145	0.4
146	0.4
147	0.41
148	0.51
149	0.52
150	0.5
151	0.56
152	0.54
153	0.5
154	0.46
155	0.38
156	0.31
157	0.31
158	0.3
159	0.26
160	0.3
161	0.31
162	0.32
163	0.32
164	0.39
165	0.37
166	0.39
167	0.38
168	0.36
169	0.33
170	0.36
171	0.37
172	0.29
173	0.27
174	0.24
175	0.2
176	0.19
177	0.17
178	0.12
179	0.1
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.09
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.12
200	0.1
201	0.12
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.11
206	0.13
207	0.14
208	0.14
209	0.12
210	0.11
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.12
215	0.12
216	0.14
217	0.17
218	0.17
219	0.17
220	0.17
221	0.2
222	0.19
223	0.2
224	0.18
225	0.15
226	0.13
227	0.12
228	0.19
229	0.17
230	0.2
231	0.18
232	0.2
233	0.2
234	0.24
235	0.33
236	0.31
237	0.32
238	0.3
239	0.32
240	0.39
241	0.44
242	0.48
243	0.46
244	0.48
245	0.5
246	0.53
247	0.52
248	0.45
249	0.44
250	0.37
251	0.33
252	0.25
253	0.2
254	0.15
255	0.14
256	0.12
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.12
268	0.12
269	0.15
270	0.16
271	0.16
272	0.15
273	0.16
274	0.18
275	0.14
276	0.21
277	0.21
278	0.22
279	0.22
280	0.23
281	0.22
282	0.2
283	0.2
284	0.14
285	0.12
286	0.11
287	0.11
288	0.1
289	0.1
290	0.12
291	0.12
292	0.17
293	0.16
294	0.17
295	0.2
296	0.21
297	0.22
298	0.23
299	0.23
300	0.19
301	0.26
302	0.28
303	0.26
304	0.29
305	0.27
306	0.24
307	0.23
308	0.22
309	0.14
310	0.13
311	0.12
312	0.11
313	0.12
314	0.14
315	0.15
316	0.17
317	0.19
318	0.2
319	0.21
320	0.2
321	0.18
322	0.16
323	0.16
324	0.13
325	0.1
326	0.08
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.15
340	0.18
341	0.2
342	0.22
343	0.28
344	0.28
345	0.28
346	0.32
347	0.27
348	0.24
349	0.22
350	0.2
351	0.14
352	0.12
353	0.11
354	0.06
355	0.06
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.09
361	0.1
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.13
366	0.13
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.06
374	0.05
375	0.06
376	0.09
377	0.1
378	0.11
379	0.1
380	0.1
381	0.13
382	0.15
383	0.19
384	0.17
385	0.19
386	0.2
387	0.22
388	0.23
389	0.2
390	0.2
391	0.16
392	0.17
393	0.14
394	0.14
395	0.13
396	0.12
397	0.12
398	0.11
399	0.12
400	0.13
401	0.13
402	0.18
403	0.16
404	0.15
405	0.16
406	0.16
407	0.17
408	0.15
409	0.14
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.1
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.06
419	0.07
420	0.09
421	0.1
422	0.12
423	0.12
424	0.13
425	0.16
426	0.17
427	0.15
428	0.13
429	0.13
430	0.13
431	0.15
432	0.14
433	0.11
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.08
438	0.07
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.07
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.08
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.09
459	0.1
460	0.12
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.15
465	0.16
466	0.18
467	0.18
468	0.2
469	0.18
470	0.19
471	0.18
472	0.2
473	0.2
474	0.2
475	0.19
476	0.15
477	0.15
478	0.15
479	0.15
480	0.13
481	0.12
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.07
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.09
495	0.12
496	0.14
497	0.15
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.15
502	0.14
503	0.11
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.14
514	0.13
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.16
519	0.16
520	0.15
521	0.1
522	0.1
523	0.07
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.09
536	0.1
537	0.11
538	0.09
539	0.08
540	0.08
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.12
549	0.11
550	0.1
551	0.12
552	0.12
553	0.08
554	0.08
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.09
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.08
588	0.09
589	0.12
590	0.13
591	0.13
592	0.12
593	0.11
594	0.12
595	0.13
596	0.14
597	0.11
598	0.13
599	0.14
600	0.14
601	0.15
602	0.13
603	0.13
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.09
608	0.09
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.04
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.08
619	0.09
620	0.11
621	0.12
622	0.13
623	0.13
624	0.13
625	0.13
626	0.12
627	0.11
628	0.09
629	0.07
630	0.05
631	0.05
632	0.04
633	0.04
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.05
654	0.05
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.04
666	0.05
667	0.06
668	0.07
669	0.09
670	0.1
671	0.11
672	0.15
673	0.15
674	0.15
675	0.17
676	0.18
677	0.2
678	0.21
679	0.2
680	0.18
681	0.18
682	0.21
683	0.22
684	0.3
685	0.29
686	0.32
687	0.35
688	0.39
689	0.39
690	0.37
691	0.35
692	0.32
693	0.32
694	0.28
695	0.25
696	0.21
697	0.2
698	0.2
699	0.18
700	0.11
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.07
709	0.07
710	0.08
711	0.07
712	0.07
713	0.06
714	0.05
715	0.05
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.1
725	0.1
726	0.12
727	0.1
728	0.11
729	0.14
730	0.14
731	0.14
732	0.13
733	0.13
734	0.14
735	0.14
736	0.12
737	0.11
738	0.09
739	0.09
740	0.09
741	0.09
742	0.07
743	0.11
744	0.15
745	0.17
746	0.18
747	0.18
748	0.23
749	0.24
750	0.22
751	0.18
752	0.15
753	0.14
754	0.14
755	0.13
756	0.08
757	0.07
758	0.07
759	0.11
760	0.1
761	0.13
762	0.13
763	0.15
764	0.16
765	0.19
766	0.21
767	0.17
768	0.17
769	0.16
770	0.2
771	0.19
772	0.19
773	0.16
774	0.15
775	0.15
776	0.16
777	0.14
778	0.14
779	0.14
780	0.14
781	0.14
782	0.13
783	0.14
784	0.14
785	0.16
786	0.15
787	0.18
788	0.19
789	0.19
790	0.21
791	0.2
792	0.21
793	0.19
794	0.16
795	0.14
796	0.17
797	0.18
798	0.16
799	0.15
800	0.14
801	0.13
802	0.12
803	0.11
804	0.08
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.09
809	0.09
810	0.1
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.13
815	0.16
816	0.14
817	0.19
818	0.2
819	0.21
820	0.22
821	0.2
822	0.18
823	0.15
824	0.15
825	0.1
826	0.08
827	0.1
828	0.1
829	0.11
830	0.11
831	0.13
832	0.14
833	0.15
834	0.22
835	0.22
836	0.24
837	0.3
838	0.34
839	0.39
840	0.47
841	0.52
842	0.49
843	0.48
844	0.46
845	0.39
846	0.37
847	0.31
848	0.22
849	0.16
850	0.12
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.06
855	0.06
856	0.05
857	0.06
858	0.07
859	0.06
860	0.07
861	0.07
862	0.09
863	0.09
864	0.09
865	0.08
866	0.08
867	0.09
868	0.12
869	0.14
870	0.14
871	0.15
872	0.16
873	0.19
874	0.17
875	0.18
876	0.14
877	0.13
878	0.11
879	0.11
880	0.1
881	0.09
882	0.08
883	0.1
884	0.1
885	0.1
886	0.11
887	0.11
888	0.12
889	0.11
890	0.13
891	0.14
892	0.18
893	0.21
894	0.21
895	0.24
896	0.34
897	0.35
898	0.36
899	0.37
900	0.34
901	0.33
902	0.35
903	0.34
904	0.29
905	0.27
906	0.27
907	0.31
908	0.3
909	0.28
910	0.25
911	0.23
912	0.21
913	0.26
914	0.23
915	0.15
916	0.15
917	0.15
918	0.17
919	0.17
920	0.16
921	0.11
922	0.17
923	0.18
924	0.17
925	0.18
926	0.15
927	0.16
928	0.18
929	0.18
930	0.13
931	0.16
932	0.18
933	0.17
934	0.17
935	0.15
936	0.13
937	0.11
938	0.11
939	0.09
940	0.09
941	0.1
942	0.11
943	0.14
944	0.2
945	0.26
946	0.32
947	0.32
948	0.34
949	0.37
950	0.44
951	0.48
952	0.47
953	0.44
954	0.42
955	0.44
956	0.43
957	0.4
958	0.33
959	0.32
960	0.32
961	0.3
962	0.3
963	0.27
964	0.27
965	0.33
966	0.39
967	0.38
968	0.34
969	0.33
970	0.31
971	0.3
972	0.29
973	0.23
974	0.18
975	0.17
976	0.17
977	0.17
978	0.14
979	0.13
980	0.12
981	0.11
982	0.09
983	0.08
984	0.08
985	0.08
986	0.09
987	0.16
988	0.18
989	0.21
990	0.22
991	0.22
992	0.22
993	0.23
994	0.28
995	0.22
996	0.2
997	0.19
998	0.19
999	0.18
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.14
1003	0.15
1004	0.17
1005	0.16
1006	0.17
1007	0.2
1008	0.24
1009	0.24
1010	0.24
1011	0.24
1012	0.21
1013	0.2
1014	0.18
1015	0.15
1016	0.08
1017	0.09
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.14
1024	0.13
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.15
1028	0.16
1029	0.16
1030	0.18
1031	0.19
1032	0.23
1033	0.24
1034	0.24
1035	0.22
1036	0.22
1037	0.21
1038	0.22
1039	0.18
1040	0.16
1041	0.15
1042	0.15
1043	0.14
1044	0.13
1045	0.12
1046	0.1
1047	0.11
1048	0.12
1049	0.13
1050	0.16
1051	0.16
1052	0.18
1053	0.24
1054	0.31
1055	0.36
1056	0.35
1057	0.34
1058	0.31
1059	0.32
1060	0.35
1061	0.35
1062	0.33
1063	0.29
1064	0.34
1065	0.35
1066	0.34
1067	0.32
1068	0.33
1069	0.31
1070	0.33
1071	0.37
1072	0.32
1073	0.3
1074	0.3
1075	0.32
1076	0.28
1077	0.25
1078	0.19
1079	0.16
1080	0.15
1081	0.22
1082	0.23
1083	0.22
1084	0.26
1085	0.26
1086	0.31
1087	0.37
1088	0.42
1089	0.4
1090	0.43
1091	0.43
1092	0.4
1093	0.4
1094	0.36
1095	0.28
1096	0.22
1097	0.19
1098	0.17
1099	0.18
1100	0.17
1101	0.15
1102	0.14
1103	0.13
1104	0.14
1105	0.15
1106	0.11
1107	0.09
1108	0.08
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.1
1112	0.12
1113	0.1
1114	0.1
1115	0.11
1116	0.14
1117	0.14
1118	0.18
1119	0.2
1120	0.18
1121	0.2
1122	0.2
1123	0.21
1124	0.2
1125	0.24
1126	0.22
1127	0.21
1128	0.22
1129	0.2
1130	0.21
1131	0.22
1132	0.2
1133	0.17
1134	0.15
1135	0.13
1136	0.12
1137	0.14
1138	0.13
1139	0.15
1140	0.16
1141	0.14
1142	0.13
1143	0.14
1144	0.14
1145	0.14
1146	0.15
1147	0.15
1148	0.15
1149	0.19
1150	0.2
1151	0.24
1152	0.32
1153	0.3
1154	0.32
1155	0.32
1156	0.36
1157	0.38
1158	0.44
1159	0.47
1160	0.46
1161	0.54
1162	0.61
1163	0.64
1164	0.67
1165	0.61
1166	0.6
1167	0.56
1168	0.51
1169	0.43
1170	0.34
1171	0.3
1172	0.25
1173	0.23
1174	0.18
1175	0.16
1176	0.15
1177	0.14
1178	0.14
1179	0.13
1180	0.14
1181	0.16
1182	0.16
1183	0.19
1184	0.21
1185	0.23
1186	0.26
1187	0.25
1188	0.24
1189	0.25
1190	0.25
1191	0.24
1192	0.22
1193	0.2
1194	0.18
1195	0.17
1196	0.18
1197	0.17
1198	0.15
1199	0.14
1200	0.13
1201	0.12
1202	0.13
1203	0.16
1204	0.13
1205	0.15
1206	0.17
1207	0.21
1208	0.23
1209	0.22
1210	0.24
1211	0.21
1212	0.25
1213	0.31
1214	0.31
1215	0.33
1216	0.4
1217	0.48
1218	0.53
1219	0.56
1220	0.62
1221	0.65
1222	0.69
1223	0.72
1224	0.7
1225	0.68
1226	0.63
1227	0.62
1228	0.58
1229	0.51
1230	0.51

A0A1G4IS78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer