Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4JHY6

Protein Details
Accession A0A1G4JHY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
546-576SQAFHGTRSNRKKFAKAQQKVENRNRQNQSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-277KIKKRKKLSGPNVSSKRS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAQQVSLSIEETNKLRLSLGLKPIEVEVSHKETNSADDNDSVPLSEHESTSKSNATADKLSRLRWNLKRAQSKLQSDVLVGGLKDDDDKDWLNKVGAKKRRQNGPALRKNYQEMDRETFENDEFDPKVKVVHEMSQMTPGSDVILTLQESELDSEGKGDVLVNEGALQDAQQAKNVNLKRLNQARRLGKISVSKGSYEEGSDDNKESGPSLYMVEGRLVGPESPENSPKAPDNRMTTSIYRDTEEKEGDISGPSDFAPVKIKKRKKLSGPNVSSKRSKPVPQNIKVELVDEDSVDAADAADQELEEFLKIQHSANAGERKAQKSAEEIVKEIEEEKRDRSARDATIAGARGFIVDENSVFLSKLQSSLLTKTDPVKFERIDLTPASTIGNAIKGDSVLFSEGEQKKEEEGGDQGDHFDGESNQANFQDGLASTLNFLRDHNAIPPLGVNSAKNGEKSKELEELALKQMIEARVSRERFAQELSEGKVRYTPDELDKIQRLHEQQVSNRNHVLQRERLVSYNPEVKLSYKDSHGNELTTKEAYKKLSQAFHGTRSNRKKFAKAQQKVENRNRQNQSYIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.21
4 0.24
5 0.29
6 0.36
7 0.35
8 0.34
9 0.34
10 0.35
11 0.33
12 0.3
13 0.26
14 0.23
15 0.26
16 0.28
17 0.27
18 0.28
19 0.26
20 0.3
21 0.32
22 0.3
23 0.24
24 0.25
25 0.26
26 0.26
27 0.25
28 0.21
29 0.16
30 0.14
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.19
36 0.21
37 0.23
38 0.25
39 0.21
40 0.24
41 0.26
42 0.29
43 0.33
44 0.33
45 0.39
46 0.39
47 0.42
48 0.46
49 0.49
50 0.54
51 0.55
52 0.62
53 0.62
54 0.69
55 0.76
56 0.73
57 0.77
58 0.76
59 0.74
60 0.7
61 0.66
62 0.57
63 0.47
64 0.44
65 0.35
66 0.27
67 0.21
68 0.16
69 0.12
70 0.11
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.18
78 0.2
79 0.2
80 0.24
81 0.31
82 0.37
83 0.44
84 0.52
85 0.58
86 0.65
87 0.73
88 0.73
89 0.75
90 0.77
91 0.79
92 0.79
93 0.78
94 0.74
95 0.67
96 0.67
97 0.63
98 0.58
99 0.53
100 0.49
101 0.47
102 0.46
103 0.44
104 0.41
105 0.36
106 0.31
107 0.26
108 0.21
109 0.19
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.15
114 0.17
115 0.16
116 0.19
117 0.18
118 0.22
119 0.27
120 0.28
121 0.29
122 0.33
123 0.32
124 0.28
125 0.26
126 0.2
127 0.15
128 0.13
129 0.12
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.24
162 0.26
163 0.29
164 0.31
165 0.33
166 0.4
167 0.48
168 0.54
169 0.54
170 0.6
171 0.59
172 0.59
173 0.6
174 0.53
175 0.48
176 0.48
177 0.44
178 0.42
179 0.37
180 0.32
181 0.29
182 0.29
183 0.25
184 0.18
185 0.16
186 0.12
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.12
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.17
215 0.2
216 0.23
217 0.24
218 0.27
219 0.3
220 0.32
221 0.35
222 0.37
223 0.33
224 0.34
225 0.35
226 0.31
227 0.27
228 0.24
229 0.23
230 0.23
231 0.22
232 0.18
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.14
245 0.17
246 0.26
247 0.35
248 0.42
249 0.48
250 0.58
251 0.64
252 0.66
253 0.74
254 0.76
255 0.77
256 0.77
257 0.8
258 0.77
259 0.74
260 0.68
261 0.58
262 0.54
263 0.47
264 0.46
265 0.45
266 0.49
267 0.55
268 0.58
269 0.63
270 0.58
271 0.57
272 0.51
273 0.44
274 0.34
275 0.25
276 0.18
277 0.13
278 0.11
279 0.07
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.16
302 0.21
303 0.2
304 0.25
305 0.28
306 0.28
307 0.29
308 0.28
309 0.23
310 0.21
311 0.27
312 0.26
313 0.23
314 0.22
315 0.21
316 0.2
317 0.2
318 0.18
319 0.15
320 0.13
321 0.14
322 0.15
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.25
327 0.28
328 0.26
329 0.27
330 0.26
331 0.2
332 0.22
333 0.23
334 0.19
335 0.14
336 0.13
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.07
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.13
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.2
359 0.24
360 0.24
361 0.26
362 0.28
363 0.27
364 0.28
365 0.3
366 0.26
367 0.25
368 0.23
369 0.23
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.12
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.16
388 0.19
389 0.2
390 0.21
391 0.21
392 0.21
393 0.23
394 0.22
395 0.14
396 0.14
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.14
401 0.12
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.07
406 0.09
407 0.13
408 0.14
409 0.14
410 0.15
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.13
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.12
421 0.14
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.14
427 0.16
428 0.18
429 0.16
430 0.16
431 0.17
432 0.15
433 0.16
434 0.16
435 0.13
436 0.13
437 0.18
438 0.2
439 0.21
440 0.23
441 0.23
442 0.27
443 0.3
444 0.3
445 0.3
446 0.29
447 0.29
448 0.29
449 0.3
450 0.28
451 0.28
452 0.24
453 0.19
454 0.23
455 0.21
456 0.21
457 0.18
458 0.21
459 0.27
460 0.29
461 0.3
462 0.3
463 0.31
464 0.3
465 0.31
466 0.28
467 0.23
468 0.25
469 0.28
470 0.29
471 0.27
472 0.26
473 0.28
474 0.27
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.26
479 0.32
480 0.34
481 0.38
482 0.42
483 0.41
484 0.4
485 0.43
486 0.4
487 0.4
488 0.44
489 0.43
490 0.44
491 0.53
492 0.55
493 0.53
494 0.53
495 0.5
496 0.48
497 0.48
498 0.48
499 0.45
500 0.46
501 0.47
502 0.46
503 0.44
504 0.44
505 0.42
506 0.42
507 0.42
508 0.37
509 0.34
510 0.33
511 0.33
512 0.35
513 0.36
514 0.33
515 0.3
516 0.37
517 0.37
518 0.44
519 0.45
520 0.42
521 0.39
522 0.37
523 0.36
524 0.31
525 0.3
526 0.25
527 0.28
528 0.3
529 0.33
530 0.38
531 0.42
532 0.45
533 0.48
534 0.54
535 0.54
536 0.57
537 0.61
538 0.58
539 0.62
540 0.67
541 0.72
542 0.71
543 0.72
544 0.74
545 0.75
546 0.81
547 0.82
548 0.8
549 0.81
550 0.82
551 0.87
552 0.89
553 0.9
554 0.9
555 0.87
556 0.88
557 0.86
558 0.8