FuNGI

A0A1G4J7D7

Protein Details

Accession

A0A1G4J7D7

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-45	FLKSRLKKTGTPKPYVKKEDPE	Hydrophilic
541-562	KSGRRGSPTKKTKKGTPSGSRI	Basic
642-672	IKELKEKVAKHPSNKDRMKHLVKKLVKLKDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-286	KRGNVKRKT
543-556	GRRGSPTKKTKKGT
656-660	KDRMK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNPLKSSNSASPFIKREQLRRDFLKSRLKKTGTPKPYVKKEDPETYEERTNQLLNGGASGSGSSNGETKVKQENSTQYNEFPLRAVSHEHLENIRTHILKFQSKKKIDPQNDLHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKRNAEMEKAPNASLQVSGGSTSSTPASGIATPATQASAAPSAETSANSNPHATDEKSSSLPADGDATQSNSEPSGSKPSVPPLTRLEEAGVSEDPSKVGMVKYDGKEKLLDAESKEDPFADVAPDGGGRFKRGNVKRKTRSLKLLDENAKRLRFEEFYPWVLEDFDGLNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVENDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMEKNGKGIPRWLMKHLDDIGTTTTRYDRTQRRLRSVDARQRDEGDEDNRDDNSEIELDFDEEFADDEEAPIIDGDEKENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDGDGDDIDEDLFGEKKIDDEGERTMKALQKSDMAALYESDDEAKLNPYISESEPENQEEDKDKDKDESQENDKSGRRGSPTKKTKKGTPSGSRIHVKSIKDCQVILKADSSTLKNFPEGIWNPNTAQKATEKIDSDSFLPSVKDEDSDTHPDLLTEADIVNVVSGRTMTLKQLIKELKEKVAKHPSNKDRMKHLVKKLVKLKDGNLELKAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.51
3	0.48
4	0.52
5	0.58
6	0.64
7	0.66
8	0.67
9	0.72
10	0.7
11	0.73
12	0.75
13	0.73
14	0.73
15	0.75
16	0.72
17	0.71
18	0.74
19	0.77
20	0.74
21	0.75
22	0.76
23	0.76
24	0.82
25	0.84
26	0.81
27	0.8
28	0.79
29	0.8
30	0.75
31	0.71
32	0.66
33	0.62
34	0.62
35	0.54
36	0.49
37	0.42
38	0.38
39	0.31
40	0.28
41	0.25
42	0.18
43	0.17
44	0.15
45	0.12
46	0.11
47	0.11
48	0.1
49	0.08
50	0.09
51	0.08
52	0.1
53	0.12
54	0.15
55	0.15
56	0.18
57	0.26
58	0.29
59	0.31
60	0.36
61	0.43
62	0.46
63	0.52
64	0.51
65	0.42
66	0.47
67	0.45
68	0.39
69	0.31
70	0.28
71	0.23
72	0.22
73	0.26
74	0.21
75	0.24
76	0.25
77	0.27
78	0.26
79	0.27
80	0.27
81	0.26
82	0.28
83	0.24
84	0.24
85	0.27
86	0.31
87	0.37
88	0.42
89	0.48
90	0.54
91	0.57
92	0.63
93	0.67
94	0.72
95	0.7
96	0.73
97	0.7
98	0.7
99	0.71
100	0.69
101	0.61
102	0.54
103	0.48
104	0.44
105	0.48
106	0.4
107	0.41
108	0.45
109	0.5
110	0.55
111	0.65
112	0.68
113	0.67
114	0.67
115	0.67
116	0.63
117	0.58
118	0.56
119	0.47
120	0.38
121	0.29
122	0.32
123	0.3
124	0.34
125	0.37
126	0.32
127	0.31
128	0.31
129	0.34
130	0.36
131	0.38
132	0.41
133	0.38
134	0.4
135	0.45
136	0.46
137	0.42
138	0.4
139	0.4
140	0.35
141	0.39
142	0.38
143	0.32
144	0.32
145	0.32
146	0.29
147	0.21
148	0.16
149	0.11
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.09
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.07
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.16
181	0.16
182	0.17
183	0.16
184	0.18
185	0.21
186	0.19
187	0.19
188	0.19
189	0.21
190	0.21
191	0.21
192	0.19
193	0.16
194	0.15
195	0.13
196	0.13
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.1
208	0.17
209	0.17
210	0.18
211	0.19
212	0.25
213	0.32
214	0.32
215	0.34
216	0.3
217	0.35
218	0.34
219	0.33
220	0.28
221	0.21
222	0.21
223	0.19
224	0.15
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.1
235	0.17
236	0.18
237	0.26
238	0.26
239	0.26
240	0.27
241	0.25
242	0.26
243	0.23
244	0.23
245	0.17
246	0.21
247	0.21
248	0.22
249	0.21
250	0.17
251	0.14
252	0.12
253	0.12
254	0.08
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.08
261	0.08
262	0.1
263	0.1
264	0.13
265	0.23
266	0.3
267	0.4
268	0.48
269	0.58
270	0.64
271	0.73
272	0.78
273	0.74
274	0.76
275	0.72
276	0.7
277	0.65
278	0.66
279	0.64
280	0.59
281	0.59
282	0.55
283	0.51
284	0.42
285	0.38
286	0.32
287	0.25
288	0.24
289	0.26
290	0.23
291	0.23
292	0.24
293	0.24
294	0.21
295	0.19
296	0.17
297	0.11
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.08
334	0.08
335	0.1
336	0.12
337	0.15
338	0.19
339	0.27
340	0.36
341	0.37
342	0.39
343	0.38
344	0.38
345	0.36
346	0.34
347	0.28
348	0.2
349	0.17
350	0.18
351	0.17
352	0.16
353	0.14
354	0.14
355	0.12
356	0.15
357	0.2
358	0.17
359	0.22
360	0.27
361	0.32
362	0.32
363	0.34
364	0.35
365	0.37
366	0.39
367	0.36
368	0.35
369	0.3
370	0.33
371	0.32
372	0.28
373	0.21
374	0.21
375	0.2
376	0.16
377	0.15
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.13
382	0.2
383	0.26
384	0.35
385	0.44
386	0.49
387	0.55
388	0.57
389	0.59
390	0.61
391	0.62
392	0.62
393	0.61
394	0.6
395	0.53
396	0.52
397	0.49
398	0.42
399	0.36
400	0.3
401	0.25
402	0.23
403	0.23
404	0.21
405	0.2
406	0.19
407	0.15
408	0.13
409	0.1
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.07
431	0.12
432	0.13
433	0.14
434	0.15
435	0.15
436	0.18
437	0.23
438	0.3
439	0.35
440	0.37
441	0.4
442	0.42
443	0.45
444	0.51
445	0.5
446	0.44
447	0.37
448	0.34
449	0.32
450	0.32
451	0.28
452	0.19
453	0.14
454	0.12
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.05
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.16
476	0.19
477	0.19
478	0.2
479	0.22
480	0.25
481	0.26
482	0.27
483	0.23
484	0.21
485	0.22
486	0.24
487	0.22
488	0.19
489	0.17
490	0.15
491	0.15
492	0.12
493	0.11
494	0.1
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.1
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.1
503	0.13
504	0.14
505	0.16
506	0.16
507	0.19
508	0.21
509	0.22
510	0.23
511	0.2
512	0.21
513	0.23
514	0.24
515	0.28
516	0.27
517	0.27
518	0.29
519	0.32
520	0.36
521	0.37
522	0.4
523	0.4
524	0.45
525	0.45
526	0.48
527	0.48
528	0.44
529	0.41
530	0.38
531	0.38
532	0.41
533	0.47
534	0.52
535	0.6
536	0.68
537	0.75
538	0.76
539	0.79
540	0.8
541	0.82
542	0.81
543	0.8
544	0.78
545	0.76
546	0.78
547	0.76
548	0.67
549	0.67
550	0.62
551	0.55
552	0.54
553	0.55
554	0.56
555	0.51
556	0.5
557	0.45
558	0.47
559	0.46
560	0.4
561	0.34
562	0.26
563	0.27
564	0.3
565	0.29
566	0.25
567	0.26
568	0.26
569	0.23
570	0.24
571	0.22
572	0.28
573	0.28
574	0.3
575	0.3
576	0.31
577	0.32
578	0.36
579	0.38
580	0.29
581	0.29
582	0.26
583	0.29
584	0.3
585	0.34
586	0.31
587	0.32
588	0.34
589	0.34
590	0.32
591	0.28
592	0.25
593	0.21
594	0.19
595	0.17
596	0.16
597	0.15
598	0.15
599	0.14
600	0.17
601	0.22
602	0.28
603	0.29
604	0.29
605	0.28
606	0.27
607	0.25
608	0.22
609	0.17
610	0.11
611	0.09
612	0.07
613	0.08
614	0.07
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.09
622	0.11
623	0.13
624	0.2
625	0.25
626	0.25
627	0.34
628	0.39
629	0.41
630	0.47
631	0.49
632	0.5
633	0.53
634	0.55
635	0.56
636	0.62
637	0.64
638	0.66
639	0.73
640	0.73
641	0.76
642	0.82
643	0.78
644	0.76
645	0.79
646	0.81
647	0.8
648	0.8
649	0.8
650	0.78
651	0.82
652	0.82
653	0.81
654	0.78
655	0.73
656	0.68
657	0.67
658	0.68
659	0.63

A0A1G4J7D7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer