Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4JIB5

Protein Details
Accession A0A1G4JIB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-372PTYVRPKQPDTPPRAKRQSNEPNPFLKRRKPPSRPKPLNASTQPVHLPQEKKPGRVKLKSTKIKRSTKSSIFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-341PPRAKRQSNEPNPFLKRRKPPSRPKPLNAST
343-365PVHLPQEKKPGRVKLKSTKIKRS
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 8, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MKVIVNHCQYNIIAIKSRTIGAYSPLIIHIQQQKMNEERLKVSSLRSICEVSLMRNHLAITNVANVPYRLIRNVLMKLKVDHLCKLEETNVLLIFEDEEIWRNLLAMDFPLHVGEAFQRKRDEIMAFYVSFVELHDPGILRDADLMRGFLRFAIKKDPESQKYRVPSRMLYFQYQEEMLRKQELSTQRLRMRMQELHDEKQKNQIVALEDPVFCEKRVNSTSKISERSSPFVKSFKEHQKRQQHFKSGGFDITKRPVKRVAFGGQVGSLGVHNCSKNEAKVVPAASGTAMTQTSTAVRKPTYVRPKQPDTPPRAKRQSNEPNPFLKRRKPPSRPKPLNASTQPVHLPQEKKPGRVKLKSTKIKRSTKSSIFTTPSPQDQIFDKGKDRPNAYIFDSPQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.31
4 0.32
5 0.27
6 0.24
7 0.22
8 0.19
9 0.22
10 0.2
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.24
16 0.29
17 0.3
18 0.32
19 0.34
20 0.39
21 0.41
22 0.49
23 0.47
24 0.42
25 0.41
26 0.41
27 0.42
28 0.37
29 0.35
30 0.35
31 0.32
32 0.31
33 0.3
34 0.29
35 0.25
36 0.29
37 0.28
38 0.23
39 0.28
40 0.3
41 0.28
42 0.27
43 0.27
44 0.23
45 0.24
46 0.22
47 0.17
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.17
53 0.18
54 0.21
55 0.21
56 0.17
57 0.18
58 0.2
59 0.25
60 0.31
61 0.35
62 0.35
63 0.35
64 0.36
65 0.41
66 0.43
67 0.4
68 0.38
69 0.34
70 0.33
71 0.32
72 0.32
73 0.27
74 0.24
75 0.23
76 0.21
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.1
102 0.18
103 0.19
104 0.23
105 0.24
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.27
110 0.2
111 0.23
112 0.22
113 0.21
114 0.21
115 0.2
116 0.16
117 0.14
118 0.12
119 0.1
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.14
138 0.13
139 0.15
140 0.23
141 0.24
142 0.27
143 0.35
144 0.42
145 0.44
146 0.48
147 0.5
148 0.47
149 0.52
150 0.55
151 0.52
152 0.46
153 0.44
154 0.41
155 0.45
156 0.42
157 0.38
158 0.34
159 0.3
160 0.28
161 0.25
162 0.23
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.18
170 0.22
171 0.25
172 0.28
173 0.34
174 0.36
175 0.41
176 0.41
177 0.39
178 0.38
179 0.37
180 0.34
181 0.37
182 0.37
183 0.37
184 0.43
185 0.41
186 0.37
187 0.42
188 0.42
189 0.32
190 0.29
191 0.27
192 0.23
193 0.22
194 0.24
195 0.17
196 0.15
197 0.16
198 0.18
199 0.16
200 0.13
201 0.14
202 0.12
203 0.16
204 0.2
205 0.23
206 0.24
207 0.28
208 0.34
209 0.37
210 0.41
211 0.36
212 0.38
213 0.38
214 0.39
215 0.36
216 0.33
217 0.31
218 0.31
219 0.31
220 0.28
221 0.34
222 0.41
223 0.47
224 0.51
225 0.58
226 0.65
227 0.71
228 0.78
229 0.78
230 0.75
231 0.7
232 0.69
233 0.64
234 0.55
235 0.52
236 0.44
237 0.37
238 0.32
239 0.36
240 0.38
241 0.33
242 0.34
243 0.36
244 0.36
245 0.38
246 0.4
247 0.36
248 0.34
249 0.34
250 0.33
251 0.26
252 0.24
253 0.2
254 0.15
255 0.11
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.14
262 0.16
263 0.16
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.21
268 0.22
269 0.18
270 0.16
271 0.16
272 0.12
273 0.12
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.1
281 0.12
282 0.13
283 0.15
284 0.16
285 0.19
286 0.24
287 0.33
288 0.42
289 0.49
290 0.57
291 0.62
292 0.69
293 0.74
294 0.79
295 0.79
296 0.77
297 0.79
298 0.77
299 0.79
300 0.81
301 0.78
302 0.72
303 0.73
304 0.75
305 0.76
306 0.77
307 0.71
308 0.71
309 0.72
310 0.78
311 0.74
312 0.72
313 0.72
314 0.74
315 0.8
316 0.81
317 0.86
318 0.88
319 0.92
320 0.92
321 0.89
322 0.89
323 0.83
324 0.83
325 0.77
326 0.73
327 0.63
328 0.58
329 0.53
330 0.46
331 0.45
332 0.41
333 0.4
334 0.38
335 0.48
336 0.48
337 0.52
338 0.57
339 0.63
340 0.66
341 0.71
342 0.75
343 0.74
344 0.81
345 0.84
346 0.86
347 0.86
348 0.86
349 0.88
350 0.86
351 0.84
352 0.83
353 0.82
354 0.79
355 0.73
356 0.72
357 0.67
358 0.62
359 0.61
360 0.56
361 0.52
362 0.5
363 0.45
364 0.38
365 0.37
366 0.42
367 0.4
368 0.39
369 0.39
370 0.42
371 0.5
372 0.56
373 0.56
374 0.56
375 0.54
376 0.54
377 0.55
378 0.55