FuNGI

A0A1G4JN79

Protein Details

Accession

A0A1G4JN79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-34	ALPGQNKGSGRKRNGAKKNNAPMDFE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-23	RKRNG

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFFGFDTALPGQNKGSGRKRNGAKKNNAPMDFEDTYQGLGEYENEEDDYLNAETFGDGTELGADFDFGYGRGNLDANTSSAGHVEQPALNRSYASAAASAGPGALNAGYSLPSAHTMDEGMDFTPMESLWTNQSAVIPQQQPQNPIPQVLSMGEIERQQFQQQQQQQQHGYMNMPPMPPMGYGYPPHAYGPPGVNNTGYQGLPQDFSQSVPQGYPQGLPQGGPMAMPMHMAPMGPPQHYQPIPVPMQQHEQQTPQQAHHQAPASLPQEASPAPVLSREPSESPSSVQPQEVVRADQFSSVGVPEQAFAQEMRPPHNAPGNRGQAIIPDQVMREIAPRETRRGSMRKPQEPLSSEELKKLRIRQAKVDKILRHSGVMTPRDKDFITRYQLSQIVTDDPYNEDFYFQVYKIIQRGGIVGESNKGLIARAYLEHSGHRLGGRYKRADVALQRMQSQVEKAVTVAKERPQKSRENLDGAKEGVLGKISSARNSKAPRRQLQIPLQKEEEDEVTSQAIEDVVQSMNGVELSSSKARRRSSYAFRSVDQRAVLSRSGGRKFVLSLIETVYSEVLELEAQLRSGQDTDSSALWETLHISDDAYEVSPFISILSFDKGVKIMPRIFNFLNKEQKLKLLYCFFSELSHLNIIVTSSYKTNPDPSDSQLKKLELFQSVFLKIIVSFLSSSAEFLEVLGLLLALVKNNNVSFISTSKIGLNLITVLISRAALIKQDVSRGNVLSSMEASTWNEIYDKLFTALETKLAVVFPPDEYSSRVVATSSSGTVTSATVGQSSKHQFYDQSYIWQFLASLALSGKLNHQRVIIDEIREEIFGTISRAEQLSSTAPVEEQQIALYQRDKLYQDLNLFLNVMGLVARDGEISELK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.35
3	0.43
4	0.46
5	0.52
6	0.61
7	0.69
8	0.74
9	0.81
10	0.83
11	0.84
12	0.85
13	0.89
14	0.89
15	0.81
16	0.75
17	0.68
18	0.66
19	0.57
20	0.47
21	0.39
22	0.3
23	0.28
24	0.24
25	0.2
26	0.12
27	0.1
28	0.11
29	0.09
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.11
36	0.13
37	0.11
38	0.1
39	0.1
40	0.09
41	0.09
42	0.09
43	0.09
44	0.06
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.06
56	0.08
57	0.08
58	0.09
59	0.1
60	0.11
61	0.1
62	0.13
63	0.14
64	0.13
65	0.15
66	0.14
67	0.13
68	0.13
69	0.14
70	0.12
71	0.13
72	0.14
73	0.14
74	0.17
75	0.22
76	0.23
77	0.23
78	0.21
79	0.21
80	0.21
81	0.2
82	0.17
83	0.13
84	0.12
85	0.13
86	0.13
87	0.12
88	0.09
89	0.08
90	0.06
91	0.06
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.06
97	0.06
98	0.07
99	0.07
100	0.1
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.1
105	0.11
106	0.12
107	0.12
108	0.1
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.09
115	0.08
116	0.09
117	0.12
118	0.14
119	0.14
120	0.14
121	0.15
122	0.15
123	0.17
124	0.23
125	0.22
126	0.23
127	0.31
128	0.34
129	0.38
130	0.38
131	0.45
132	0.39
133	0.39
134	0.36
135	0.29
136	0.27
137	0.23
138	0.23
139	0.14
140	0.14
141	0.14
142	0.15
143	0.16
144	0.17
145	0.18
146	0.19
147	0.24
148	0.26
149	0.34
150	0.4
151	0.48
152	0.52
153	0.58
154	0.56
155	0.54
156	0.54
157	0.46
158	0.4
159	0.33
160	0.32
161	0.28
162	0.26
163	0.23
164	0.2
165	0.2
166	0.18
167	0.18
168	0.15
169	0.15
170	0.16
171	0.2
172	0.21
173	0.21
174	0.22
175	0.21
176	0.19
177	0.19
178	0.22
179	0.23
180	0.24
181	0.24
182	0.24
183	0.23
184	0.24
185	0.24
186	0.19
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.15
191	0.15
192	0.16
193	0.13
194	0.15
195	0.18
196	0.17
197	0.16
198	0.15
199	0.17
200	0.16
201	0.16
202	0.16
203	0.13
204	0.16
205	0.16
206	0.16
207	0.15
208	0.15
209	0.14
210	0.13
211	0.13
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.13
221	0.16
222	0.16
223	0.17
224	0.18
225	0.25
226	0.25
227	0.27
228	0.24
229	0.28
230	0.3
231	0.32
232	0.33
233	0.28
234	0.34
235	0.35
236	0.37
237	0.32
238	0.34
239	0.34
240	0.39
241	0.39
242	0.34
243	0.37
244	0.36
245	0.35
246	0.36
247	0.35
248	0.28
249	0.27
250	0.32
251	0.27
252	0.24
253	0.22
254	0.18
255	0.18
256	0.17
257	0.18
258	0.12
259	0.11
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.16
268	0.19
269	0.19
270	0.2
271	0.23
272	0.25
273	0.24
274	0.23
275	0.23
276	0.2
277	0.25
278	0.24
279	0.21
280	0.17
281	0.18
282	0.18
283	0.16
284	0.15
285	0.11
286	0.1
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.09
298	0.1
299	0.15
300	0.17
301	0.18
302	0.2
303	0.26
304	0.27
305	0.29
306	0.37
307	0.38
308	0.36
309	0.35
310	0.33
311	0.28
312	0.3
313	0.26
314	0.18
315	0.13
316	0.12
317	0.12
318	0.12
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.11
323	0.18
324	0.2
325	0.24
326	0.25
327	0.28
328	0.33
329	0.39
330	0.41
331	0.44
332	0.52
333	0.53
334	0.55
335	0.57
336	0.57
337	0.52
338	0.52
339	0.49
340	0.46
341	0.4
342	0.42
343	0.39
344	0.36
345	0.36
346	0.36
347	0.38
348	0.39
349	0.41
350	0.45
351	0.54
352	0.58
353	0.62
354	0.64
355	0.58
356	0.56
357	0.59
358	0.5
359	0.4
360	0.33
361	0.3
362	0.3
363	0.32
364	0.28
365	0.25
366	0.25
367	0.26
368	0.25
369	0.24
370	0.21
371	0.22
372	0.26
373	0.26
374	0.26
375	0.28
376	0.3
377	0.28
378	0.25
379	0.2
380	0.16
381	0.16
382	0.15
383	0.13
384	0.12
385	0.12
386	0.13
387	0.12
388	0.1
389	0.09
390	0.11
391	0.12
392	0.11
393	0.12
394	0.1
395	0.12
396	0.13
397	0.13
398	0.12
399	0.1
400	0.11
401	0.09
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.07
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.1
423	0.11
424	0.14
425	0.2
426	0.25
427	0.25
428	0.26
429	0.27
430	0.27
431	0.28
432	0.26
433	0.27
434	0.27
435	0.26
436	0.26
437	0.24
438	0.24
439	0.22
440	0.2
441	0.15
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.12
446	0.12
447	0.14
448	0.15
449	0.18
450	0.26
451	0.28
452	0.34
453	0.34
454	0.41
455	0.43
456	0.49
457	0.47
458	0.47
459	0.46
460	0.42
461	0.4
462	0.34
463	0.29
464	0.22
465	0.18
466	0.11
467	0.1
468	0.07
469	0.06
470	0.12
471	0.12
472	0.15
473	0.17
474	0.18
475	0.24
476	0.3
477	0.37
478	0.39
479	0.48
480	0.5
481	0.53
482	0.58
483	0.6
484	0.64
485	0.66
486	0.62
487	0.57
488	0.52
489	0.47
490	0.41
491	0.34
492	0.26
493	0.18
494	0.14
495	0.11
496	0.1
497	0.09
498	0.08
499	0.07
500	0.06
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.04
511	0.03
512	0.04
513	0.07
514	0.11
515	0.14
516	0.18
517	0.24
518	0.26
519	0.29
520	0.36
521	0.4
522	0.46
523	0.52
524	0.58
525	0.55
526	0.53
527	0.56
528	0.51
529	0.47
530	0.37
531	0.29
532	0.21
533	0.21
534	0.2
535	0.16
536	0.18
537	0.22
538	0.23
539	0.24
540	0.22
541	0.21
542	0.21
543	0.22
544	0.21
545	0.15
546	0.14
547	0.14
548	0.15
549	0.14
550	0.14
551	0.11
552	0.08
553	0.07
554	0.06
555	0.05
556	0.04
557	0.04
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.07
568	0.09
569	0.09
570	0.1
571	0.09
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.09
594	0.1
595	0.1
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.14
600	0.17
601	0.2
602	0.25
603	0.27
604	0.31
605	0.32
606	0.37
607	0.4
608	0.43
609	0.47
610	0.43
611	0.45
612	0.4
613	0.44
614	0.42
615	0.38
616	0.37
617	0.33
618	0.32
619	0.31
620	0.33
621	0.28
622	0.25
623	0.25
624	0.2
625	0.17
626	0.17
627	0.15
628	0.12
629	0.12
630	0.11
631	0.1
632	0.1
633	0.08
634	0.09
635	0.1
636	0.12
637	0.14
638	0.19
639	0.2
640	0.25
641	0.26
642	0.29
643	0.39
644	0.38
645	0.41
646	0.4
647	0.4
648	0.36
649	0.38
650	0.38
651	0.32
652	0.32
653	0.31
654	0.3
655	0.29
656	0.28
657	0.24
658	0.2
659	0.15
660	0.14
661	0.11
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.1
666	0.09
667	0.09
668	0.09
669	0.1
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.06
674	0.06
675	0.05
676	0.04
677	0.03
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.06
683	0.08
684	0.08
685	0.1
686	0.09
687	0.11
688	0.12
689	0.13
690	0.15
691	0.14
692	0.15
693	0.15
694	0.15
695	0.14
696	0.12
697	0.12
698	0.1
699	0.09
700	0.08
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.09
709	0.1
710	0.14
711	0.14
712	0.2
713	0.22
714	0.24
715	0.26
716	0.25
717	0.25
718	0.23
719	0.22
720	0.17
721	0.16
722	0.14
723	0.12
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.13
728	0.13
729	0.12
730	0.12
731	0.13
732	0.14
733	0.14
734	0.13
735	0.13
736	0.13
737	0.15
738	0.15
739	0.14
740	0.13
741	0.12
742	0.11
743	0.11
744	0.11
745	0.11
746	0.11
747	0.11
748	0.13
749	0.15
750	0.15
751	0.17
752	0.2
753	0.19
754	0.19
755	0.18
756	0.15
757	0.14
758	0.15
759	0.15
760	0.13
761	0.13
762	0.12
763	0.12
764	0.13
765	0.12
766	0.11
767	0.1
768	0.1
769	0.11
770	0.11
771	0.12
772	0.19
773	0.25
774	0.27
775	0.27
776	0.29
777	0.29
778	0.34
779	0.41
780	0.35
781	0.38
782	0.36
783	0.36
784	0.35
785	0.32
786	0.27
787	0.2
788	0.2
789	0.11
790	0.11
791	0.09
792	0.11
793	0.11
794	0.12
795	0.19
796	0.26
797	0.28
798	0.29
799	0.3
800	0.29
801	0.32
802	0.39
803	0.35
804	0.29
805	0.27
806	0.28
807	0.27
808	0.26
809	0.24
810	0.16
811	0.13
812	0.12
813	0.13
814	0.12
815	0.11
816	0.13
817	0.13
818	0.13
819	0.12
820	0.14
821	0.15
822	0.17
823	0.17
824	0.15
825	0.15
826	0.16
827	0.19
828	0.17
829	0.15
830	0.13
831	0.16
832	0.18
833	0.2
834	0.21
835	0.22
836	0.23
837	0.28
838	0.29
839	0.28
840	0.3
841	0.33
842	0.34
843	0.34
844	0.33
845	0.29
846	0.28
847	0.25
848	0.22
849	0.16
850	0.13
851	0.08
852	0.07
853	0.06
854	0.06
855	0.07
856	0.06
857	0.06

A0A1G4JN79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer