Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1G4IP42

Protein Details
Accession A0A1G4IP42    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-107EADAPKSTPKRQGLRRKKQVDYISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-101RRAVTKRKMEEADAPKSTPKRQGLRRKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041070  JHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140680  F:histone H3K36me/H3K36me2 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17811  JHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
CDD cd15517  PHD_TCF19_like  
Amino Acid Sequences MTSDICSICSTDDPDKALWVQCEICGQWDHVTCVPLESLTDEDGLKTVKYPTSSRQIKRYSCSKHEEPVLELRRRAVTKRKMEEADAPKSTPKRQGLRRKKQVDYISLNEGEAKRLKDEHPHVAPFLACFKQWENTTNVMRSSELEQQFEDIKNPLKVLDPENSGMQVPLGPEGRLLTVDGVTKFLGDEYPVDVMDVQSQQNSNWTMLQWNDYFTHQTSDTRDRIRNVISLEVSDVGKFSKELRRPQIVESKDLVNLVWDRIPDDTERPKVTKYVLMSVKNAYTDFHLDFAGTSVYYKVVSGGKKFILFPPTAHNLHAYTQWCASTHQNLIFLGDELENGIAMELKAGDLFMIPCGYIHAVYTPEDSLVIGGNFLTLRDLETQLQIVEIERRTKVPKKFTFPQFDVVMGKTAEWLLTCGDEDAARLSSTQLEVLIDFLSDARAKYRPVKFSTKRDVVKGLKTELEKKAKDSTNPC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.3
4 0.32
5 0.28
6 0.26
7 0.24
8 0.22
9 0.25
10 0.23
11 0.23
12 0.21
13 0.22
14 0.24
15 0.26
16 0.29
17 0.27
18 0.28
19 0.25
20 0.24
21 0.23
22 0.17
23 0.15
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.16
36 0.2
37 0.23
38 0.28
39 0.38
40 0.48
41 0.51
42 0.57
43 0.64
44 0.66
45 0.7
46 0.73
47 0.71
48 0.69
49 0.73
50 0.68
51 0.65
52 0.66
53 0.62
54 0.56
55 0.57
56 0.58
57 0.54
58 0.5
59 0.46
60 0.46
61 0.47
62 0.49
63 0.49
64 0.5
65 0.56
66 0.61
67 0.66
68 0.62
69 0.63
70 0.67
71 0.64
72 0.62
73 0.54
74 0.49
75 0.47
76 0.48
77 0.49
78 0.48
79 0.49
80 0.5
81 0.58
82 0.68
83 0.73
84 0.81
85 0.87
86 0.86
87 0.83
88 0.82
89 0.79
90 0.76
91 0.72
92 0.64
93 0.6
94 0.52
95 0.47
96 0.43
97 0.36
98 0.31
99 0.28
100 0.25
101 0.21
102 0.23
103 0.25
104 0.3
105 0.35
106 0.4
107 0.41
108 0.42
109 0.4
110 0.39
111 0.37
112 0.29
113 0.28
114 0.21
115 0.15
116 0.16
117 0.17
118 0.21
119 0.22
120 0.25
121 0.24
122 0.29
123 0.33
124 0.33
125 0.32
126 0.28
127 0.27
128 0.25
129 0.25
130 0.27
131 0.25
132 0.24
133 0.23
134 0.24
135 0.26
136 0.25
137 0.22
138 0.16
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.2
146 0.22
147 0.22
148 0.22
149 0.22
150 0.22
151 0.19
152 0.17
153 0.14
154 0.1
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.13
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.16
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.16
201 0.14
202 0.16
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.23
207 0.26
208 0.29
209 0.31
210 0.3
211 0.32
212 0.32
213 0.3
214 0.24
215 0.23
216 0.18
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.12
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.14
228 0.2
229 0.27
230 0.32
231 0.39
232 0.4
233 0.44
234 0.49
235 0.43
236 0.41
237 0.37
238 0.32
239 0.26
240 0.25
241 0.21
242 0.15
243 0.14
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.09
251 0.14
252 0.18
253 0.21
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.25
258 0.25
259 0.24
260 0.21
261 0.25
262 0.28
263 0.29
264 0.3
265 0.3
266 0.29
267 0.27
268 0.25
269 0.17
270 0.13
271 0.15
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.11
287 0.13
288 0.15
289 0.17
290 0.19
291 0.2
292 0.21
293 0.22
294 0.22
295 0.21
296 0.2
297 0.23
298 0.27
299 0.27
300 0.26
301 0.25
302 0.22
303 0.23
304 0.27
305 0.22
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.19
311 0.2
312 0.2
313 0.22
314 0.22
315 0.23
316 0.22
317 0.22
318 0.2
319 0.18
320 0.15
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.05
364 0.07
365 0.1
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.11
374 0.14
375 0.16
376 0.18
377 0.19
378 0.22
379 0.29
380 0.37
381 0.44
382 0.49
383 0.55
384 0.6
385 0.69
386 0.75
387 0.78
388 0.73
389 0.71
390 0.62
391 0.56
392 0.49
393 0.41
394 0.34
395 0.25
396 0.22
397 0.16
398 0.15
399 0.13
400 0.11
401 0.11
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.13
416 0.13
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.1
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.12
429 0.15
430 0.19
431 0.28
432 0.36
433 0.42
434 0.47
435 0.58
436 0.64
437 0.71
438 0.78
439 0.79
440 0.76
441 0.73
442 0.76
443 0.71
444 0.71
445 0.66
446 0.6
447 0.56
448 0.56
449 0.59
450 0.59
451 0.63
452 0.56
453 0.54
454 0.6
455 0.59