FuNGI

A0A1G4IMW8

Protein Details

Accession

A0A1G4IMW8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic
971-992	SRFSRHSNSTHNQPNPRKVWRG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 10, mito_nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVLEDTPQIVDGVALPIDYAGANPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAQIQNEERERALLEREDMGEIIDEGIRNKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWISFKLATDPGWKHLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRADPQYNPNTSHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRRRQRVQDTINMTEEEKQSISAQDAEKPFLWLHISVLREYLAVELLVPRLSFDFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRENSIDILVEIWKAILPRLKTYMTCDGVLNLESVELLLSQLGSREPELFKGRYLQEVRKQEAAKRRKMLKSNNNVTKGKTDRNFTMPLENMPVYDVSGTAADGSLNLSNRDFVKYRKEMNLANEGDDKSAAALRAQSTQNMKPQSQYTEEQVSSAVETANVANFSAAAIMKQKLLAKSLEKADEEVGTNGNPEKVNASEDKEGATKRTFDDVENGDSATPSVADEDSQTPASFQVVHTGLVSSGVIDTDEEVKLFEPGYHDRYYTAKFHVQERDIESLRRDLVKCYVEGVSWVLLYYYQGCASWDWYYPYHYAPFASDFKNIGSLEIAFEKGEPFLPFEQLMSVLPAASGHNLPEIFRTLMKNRDSEIIDFYPEEFPVDMNGKKMSWQGIALLPFIDEKRLLKVVRQQYEHLSEKERLRNVRKQEVLLISNRNANYEKFSKKLYGSTPVETIIFQHFKSGLSGKAIIDKEGFSLNSKLVSPVVGGGLPDISTNLFLKVGYCMPELPAPSKSVLLNGFIPPQMMLTPQDRDAIAYRYSHRWNAMDMKHNIVPTGSCSTTQYQRRVGGYKSFLFYQQAHSGPLPVASHGHTSYGNVRPLGSRYNDGKGNHRGYQSRYQGNTQNAPPVNQSRFSRHSNSTHNQPNPRKVWRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.58
7	0.57
8	0.54
9	0.46
10	0.41
11	0.34
12	0.29
13	0.26
14	0.19
15	0.13
16	0.1
17	0.1
18	0.11
19	0.1
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.07
25	0.06
26	0.08
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.12
34	0.1
35	0.11
36	0.12
37	0.12
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.09
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.18
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.43
61	0.37
62	0.31
63	0.27
64	0.21
65	0.15
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.78
107	0.77
108	0.75
109	0.75
110	0.72
111	0.65
112	0.7
113	0.66
114	0.6
115	0.56
116	0.48
117	0.39
118	0.35
119	0.33
120	0.24
121	0.23
122	0.21
123	0.18
124	0.19
125	0.2
126	0.2
127	0.18
128	0.17
129	0.13
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.09
135	0.16
136	0.17
137	0.17
138	0.19
139	0.24
140	0.28
141	0.33
142	0.4
143	0.4
144	0.44
145	0.5
146	0.51
147	0.45
148	0.39
149	0.36
150	0.3
151	0.24
152	0.19
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.17
161	0.17
162	0.16
163	0.18
164	0.17
165	0.15
166	0.15
167	0.15
168	0.19
169	0.2
170	0.21
171	0.27
172	0.28
173	0.3
174	0.34
175	0.34
176	0.29
177	0.29
178	0.31
179	0.23
180	0.25
181	0.22
182	0.17
183	0.17
184	0.16
185	0.14
186	0.1
187	0.1
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.3
201	0.32
202	0.37
203	0.43
204	0.46
205	0.45
206	0.52
207	0.51
208	0.53
209	0.54
210	0.47
211	0.46
212	0.42
213	0.41
214	0.31
215	0.25
216	0.21
217	0.19
218	0.18
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.29
243	0.3
244	0.33
245	0.34
246	0.39
247	0.41
248	0.45
249	0.44
250	0.42
251	0.5
252	0.53
253	0.53
254	0.54
255	0.55
256	0.52
257	0.53
258	0.51
259	0.42
260	0.37
261	0.32
262	0.26
263	0.19
264	0.17
265	0.15
266	0.15
267	0.16
268	0.15
269	0.16
270	0.19
271	0.21
272	0.22
273	0.22
274	0.23
275	0.21
276	0.18
277	0.19
278	0.13
279	0.14
280	0.15
281	0.16
282	0.15
283	0.15
284	0.14
285	0.13
286	0.12
287	0.11
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.1
301	0.1
302	0.11
303	0.11
304	0.12
305	0.11
306	0.12
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.13
325	0.11
326	0.11
327	0.15
328	0.19
329	0.19
330	0.18
331	0.19
332	0.18
333	0.18
334	0.17
335	0.13
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.1
346	0.11
347	0.13
348	0.17
349	0.19
350	0.18
351	0.24
352	0.3
353	0.28
354	0.28
355	0.26
356	0.23
357	0.22
358	0.22
359	0.17
360	0.09
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.08
375	0.09
376	0.13
377	0.17
378	0.17
379	0.18
380	0.22
381	0.22
382	0.27
383	0.31
384	0.33
385	0.36
386	0.42
387	0.44
388	0.45
389	0.46
390	0.44
391	0.5
392	0.52
393	0.52
394	0.53
395	0.58
396	0.59
397	0.66
398	0.71
399	0.71
400	0.73
401	0.76
402	0.76
403	0.76
404	0.7
405	0.64
406	0.61
407	0.55
408	0.51
409	0.45
410	0.4
411	0.36
412	0.39
413	0.4
414	0.34
415	0.35
416	0.28
417	0.25
418	0.25
419	0.22
420	0.18
421	0.15
422	0.14
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.09
439	0.09
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.21
444	0.24
445	0.28
446	0.3
447	0.33
448	0.33
449	0.35
450	0.42
451	0.34
452	0.32
453	0.31
454	0.27
455	0.24
456	0.21
457	0.18
458	0.09
459	0.1
460	0.08
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.12
465	0.12
466	0.15
467	0.18
468	0.2
469	0.25
470	0.27
471	0.26
472	0.24
473	0.26
474	0.26
475	0.26
476	0.25
477	0.23
478	0.24
479	0.24
480	0.22
481	0.2
482	0.17
483	0.13
484	0.12
485	0.09
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.09
502	0.11
503	0.11
504	0.13
505	0.15
506	0.15
507	0.18
508	0.2
509	0.21
510	0.19
511	0.19
512	0.18
513	0.17
514	0.16
515	0.13
516	0.11
517	0.08
518	0.09
519	0.08
520	0.09
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.11
526	0.12
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.16
531	0.17
532	0.16
533	0.17
534	0.17
535	0.14
536	0.14
537	0.18
538	0.17
539	0.16
540	0.2
541	0.2
542	0.21
543	0.2
544	0.19
545	0.15
546	0.14
547	0.13
548	0.08
549	0.06
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.06
555	0.07
556	0.09
557	0.1
558	0.1
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.08
563	0.07
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.1
572	0.05
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.03
577	0.04
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.08
587	0.12
588	0.16
589	0.16
590	0.17
591	0.17
592	0.2
593	0.22
594	0.22
595	0.23
596	0.23
597	0.24
598	0.29
599	0.34
600	0.33
601	0.33
602	0.35
603	0.36
604	0.33
605	0.33
606	0.29
607	0.25
608	0.25
609	0.25
610	0.22
611	0.18
612	0.23
613	0.23
614	0.22
615	0.22
616	0.21
617	0.16
618	0.16
619	0.16
620	0.1
621	0.09
622	0.08
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.07
631	0.08
632	0.1
633	0.11
634	0.11
635	0.13
636	0.14
637	0.17
638	0.17
639	0.19
640	0.18
641	0.17
642	0.16
643	0.14
644	0.18
645	0.19
646	0.19
647	0.19
648	0.18
649	0.18
650	0.22
651	0.21
652	0.17
653	0.14
654	0.13
655	0.12
656	0.12
657	0.13
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.1
663	0.09
664	0.11
665	0.11
666	0.13
667	0.13
668	0.12
669	0.12
670	0.11
671	0.11
672	0.09
673	0.08
674	0.07
675	0.06
676	0.07
677	0.07
678	0.08
679	0.08
680	0.07
681	0.09
682	0.1
683	0.1
684	0.11
685	0.13
686	0.13
687	0.14
688	0.18
689	0.19
690	0.26
691	0.29
692	0.29
693	0.28
694	0.32
695	0.32
696	0.29
697	0.31
698	0.25
699	0.24
700	0.23
701	0.23
702	0.18
703	0.16
704	0.16
705	0.1
706	0.09
707	0.11
708	0.14
709	0.13
710	0.14
711	0.15
712	0.14
713	0.16
714	0.18
715	0.18
716	0.15
717	0.15
718	0.16
719	0.18
720	0.19
721	0.18
722	0.15
723	0.13
724	0.14
725	0.13
726	0.13
727	0.1
728	0.1
729	0.14
730	0.19
731	0.19
732	0.21
733	0.3
734	0.38
735	0.44
736	0.46
737	0.44
738	0.45
739	0.52
740	0.53
741	0.46
742	0.42
743	0.41
744	0.44
745	0.49
746	0.49
747	0.5
748	0.53
749	0.58
750	0.61
751	0.65
752	0.62
753	0.56
754	0.57
755	0.54
756	0.5
757	0.47
758	0.45
759	0.37
760	0.39
761	0.37
762	0.33
763	0.3
764	0.27
765	0.29
766	0.31
767	0.33
768	0.3
769	0.33
770	0.34
771	0.34
772	0.39
773	0.36
774	0.39
775	0.38
776	0.39
777	0.38
778	0.34
779	0.33
780	0.27
781	0.26
782	0.23
783	0.22
784	0.19
785	0.2
786	0.2
787	0.2
788	0.23
789	0.23
790	0.18
791	0.19
792	0.22
793	0.19
794	0.26
795	0.26
796	0.24
797	0.23
798	0.21
799	0.19
800	0.2
801	0.2
802	0.15
803	0.17
804	0.16
805	0.17
806	0.17
807	0.16
808	0.14
809	0.14
810	0.11
811	0.1
812	0.11
813	0.09
814	0.09
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.07
819	0.07
820	0.06
821	0.08
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.09
827	0.12
828	0.13
829	0.14
830	0.15
831	0.14
832	0.16
833	0.19
834	0.21
835	0.21
836	0.21
837	0.2
838	0.2
839	0.22
840	0.2
841	0.21
842	0.21
843	0.21
844	0.21
845	0.21
846	0.22
847	0.2
848	0.21
849	0.16
850	0.16
851	0.13
852	0.13
853	0.14
854	0.15
855	0.18
856	0.19
857	0.21
858	0.2
859	0.22
860	0.24
861	0.24
862	0.23
863	0.23
864	0.26
865	0.31
866	0.35
867	0.37
868	0.38
869	0.36
870	0.39
871	0.44
872	0.46
873	0.49
874	0.47
875	0.49
876	0.48
877	0.47
878	0.42
879	0.33
880	0.28
881	0.23
882	0.26
883	0.21
884	0.19
885	0.22
886	0.27
887	0.35
888	0.42
889	0.44
890	0.44
891	0.49
892	0.53
893	0.54
894	0.53
895	0.53
896	0.51
897	0.5
898	0.46
899	0.42
900	0.4
901	0.39
902	0.37
903	0.35
904	0.35
905	0.32
906	0.32
907	0.31
908	0.31
909	0.27
910	0.29
911	0.23
912	0.17
913	0.18
914	0.17
915	0.21
916	0.2
917	0.21
918	0.18
919	0.21
920	0.27
921	0.31
922	0.33
923	0.29
924	0.3
925	0.31
926	0.33
927	0.37
928	0.34
929	0.34
930	0.35
931	0.4
932	0.45
933	0.45
934	0.5
935	0.53
936	0.55
937	0.54
938	0.56
939	0.55
940	0.56
941	0.64
942	0.64
943	0.64
944	0.61
945	0.61
946	0.63
947	0.65
948	0.65
949	0.58
950	0.58
951	0.51
952	0.5
953	0.5
954	0.51
955	0.48
956	0.48
957	0.49
958	0.48
959	0.52
960	0.57
961	0.57
962	0.56
963	0.6
964	0.62
965	0.65
966	0.67
967	0.71
968	0.73
969	0.76
970	0.79
971	0.81
972	0.79

A0A1G4IMW8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer