Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161HKN1

Protein Details
Accession A0A161HKN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-74DSGRGGRGSEKKSRKRKKGANGFDDKSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-65RGGRGSEKKSRKRKKG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG slb:AWJ20_578  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSKRFRENRYDERGSRGRYDSGSVQLNYDDEEEGGSDRVEEELATGDSGRGGRGSEKKSRKRKKGANGFDDKSEGANTAGEIDLDAGQRSVFPGIPQNISAPSAGGPPLSALEYIQSVRFEARSRPSVVSVVPAAVGDDLESVENMEINGMECEELDPTTDHISHGSVVEAVVDVEKTSAVSVVSPVGIDLEWHTEFSEKMKSIREVWSADESREGQAGGKTAASTTAKPQSLKEWRLYLMNCLPTPLNVRSVSLPDALFILSHCHKWMTPNLAPELSRWVFALLTRLPPVLNGDDISLLREAARKTHIARNDQQRSPDAATKFTADIISSVAASFYGQTDLLYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.65
3 0.59
4 0.53
5 0.45
6 0.48
7 0.42
8 0.4
9 0.42
10 0.36
11 0.33
12 0.3
13 0.29
14 0.26
15 0.23
16 0.18
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.06
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.08
38 0.09
39 0.15
40 0.22
41 0.28
42 0.37
43 0.47
44 0.57
45 0.68
46 0.78
47 0.82
48 0.85
49 0.89
50 0.91
51 0.91
52 0.92
53 0.9
54 0.89
55 0.81
56 0.72
57 0.64
58 0.53
59 0.43
60 0.33
61 0.24
62 0.15
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.14
81 0.17
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.19
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.05
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.12
108 0.15
109 0.2
110 0.22
111 0.26
112 0.26
113 0.27
114 0.27
115 0.25
116 0.23
117 0.18
118 0.14
119 0.11
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.15
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.18
190 0.21
191 0.25
192 0.26
193 0.23
194 0.25
195 0.3
196 0.28
197 0.26
198 0.26
199 0.23
200 0.2
201 0.19
202 0.17
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.15
214 0.21
215 0.23
216 0.24
217 0.25
218 0.31
219 0.38
220 0.41
221 0.4
222 0.36
223 0.35
224 0.39
225 0.39
226 0.35
227 0.32
228 0.33
229 0.29
230 0.28
231 0.27
232 0.24
233 0.29
234 0.24
235 0.24
236 0.2
237 0.21
238 0.21
239 0.24
240 0.24
241 0.21
242 0.19
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.09
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.19
255 0.25
256 0.28
257 0.3
258 0.34
259 0.36
260 0.37
261 0.37
262 0.34
263 0.36
264 0.28
265 0.26
266 0.21
267 0.19
268 0.17
269 0.17
270 0.22
271 0.15
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.18
276 0.18
277 0.22
278 0.18
279 0.17
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.17
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.2
292 0.22
293 0.26
294 0.34
295 0.4
296 0.44
297 0.52
298 0.59
299 0.65
300 0.65
301 0.64
302 0.61
303 0.6
304 0.58
305 0.56
306 0.47
307 0.41
308 0.39
309 0.37
310 0.33
311 0.29
312 0.24
313 0.18
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.08