FuNGI

A0A161HLH5

Protein Details

Accession

A0A161HLH5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-113	NDPRRRGRTGRDRERDRDRDRD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-144	GRGNDPRRRGRTGRDRERDRDRDRDRDRRGGGGRDRDRDRGRDGGRERDGGRNRDR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, pero 3, mito 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025742 CSTF2_hinge IPR026896 CSTF_C IPR038192 CSTF_C_sf IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing
KEGG	slb:AWJ20_5158 -
Pfam	View protein in Pfam PF14327 CSTF2_hinge PF14304 CSTF_C PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MAATSRTLFLGDIPYGVTEDDVAKVLRGAGQVSIRLVDRGRDRSKGSYGFVDFPNHDAAARALGTMTGLMLGGKVLRPEFSTKPLAGEGRGNDPRRRGRTGRDRERDRDRDRDRDRRGGGGRDRDRDRGRDGGRERDGGRNRDRDREQDHRMDPRMDPRMDPRMDPRMDPRMDPRMDPRMDPRMDPRMDPRMDSRMDSRDPRNDPRNAYPDPYGQSSNNNNYNNNYNSNNNNNYNNNNYNSSNNNYNNSNDQRQPSPYGNQTTPQPAVSTSTLPSNLIVDDNISRTLSHLAPLELLEVISSVKKLLATNNGAAKAYELLHSNTTLVYGIVQALLLMGLVDANVVTQAVQGDSQDQQPQQMEQQFTQRQLEQQQHHQPQQQSYHTPPPPPPPSSGGLNTALASLDPQQAALVKQVLDLTDEQISFLPEDQRTTIYDLRDRYRRGIFT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.13
4	0.12
5	0.08
6	0.09
7	0.1
8	0.11
9	0.11
10	0.1
11	0.11
12	0.11
13	0.13
14	0.13
15	0.13
16	0.15
17	0.17
18	0.18
19	0.19
20	0.2
21	0.18
22	0.19
23	0.19
24	0.22
25	0.26
26	0.34
27	0.38
28	0.41
29	0.44
30	0.47
31	0.54
32	0.52
33	0.48
34	0.45
35	0.45
36	0.44
37	0.42
38	0.42
39	0.35
40	0.33
41	0.33
42	0.27
43	0.23
44	0.19
45	0.18
46	0.16
47	0.15
48	0.13
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.08
53	0.07
54	0.04
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.05
60	0.06
61	0.08
62	0.08
63	0.1
64	0.12
65	0.18
66	0.2
67	0.25
68	0.29
69	0.27
70	0.29
71	0.31
72	0.31
73	0.27
74	0.29
75	0.25
76	0.3
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.46
81	0.54
82	0.55
83	0.61
84	0.56
85	0.59
86	0.65
87	0.73
88	0.76
89	0.77
90	0.79
91	0.8
92	0.86
93	0.85
94	0.8
95	0.8
96	0.75
97	0.76
98	0.77
99	0.79
100	0.76
101	0.75
102	0.71
103	0.68
104	0.66
105	0.64
106	0.62
107	0.62
108	0.62
109	0.6
110	0.62
111	0.62
112	0.61
113	0.56
114	0.53
115	0.51
116	0.47
117	0.48
118	0.49
119	0.5
120	0.49
121	0.49
122	0.47
123	0.48
124	0.52
125	0.5
126	0.53
127	0.54
128	0.53
129	0.58
130	0.58
131	0.56
132	0.57
133	0.58
134	0.57
135	0.56
136	0.58
137	0.56
138	0.57
139	0.53
140	0.47
141	0.47
142	0.48
143	0.41
144	0.38
145	0.36
146	0.41
147	0.4
148	0.4
149	0.37
150	0.38
151	0.38
152	0.38
153	0.38
154	0.38
155	0.38
156	0.38
157	0.38
158	0.38
159	0.38
160	0.38
161	0.38
162	0.38
163	0.38
164	0.38
165	0.38
166	0.38
167	0.38
168	0.38
169	0.38
170	0.38
171	0.38
172	0.38
173	0.38
174	0.38
175	0.38
176	0.37
177	0.35
178	0.32
179	0.31
180	0.31
181	0.29
182	0.25
183	0.28
184	0.31
185	0.32
186	0.34
187	0.38
188	0.44
189	0.48
190	0.47
191	0.48
192	0.49
193	0.51
194	0.45
195	0.42
196	0.37
197	0.33
198	0.31
199	0.3
200	0.25
201	0.2
202	0.24
203	0.26
204	0.29
205	0.33
206	0.33
207	0.31
208	0.31
209	0.35
210	0.32
211	0.31
212	0.27
213	0.23
214	0.25
215	0.29
216	0.33
217	0.31
218	0.32
219	0.32
220	0.32
221	0.35
222	0.34
223	0.31
224	0.29
225	0.28
226	0.26
227	0.27
228	0.28
229	0.29
230	0.27
231	0.28
232	0.26
233	0.26
234	0.31
235	0.32
236	0.33
237	0.3
238	0.3
239	0.3
240	0.31
241	0.34
242	0.3
243	0.3
244	0.31
245	0.32
246	0.3
247	0.3
248	0.29
249	0.3
250	0.28
251	0.24
252	0.2
253	0.15
254	0.18
255	0.17
256	0.16
257	0.13
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.14
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.13
274	0.11
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.08
282	0.08
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.07
291	0.08
292	0.11
293	0.17
294	0.2
295	0.24
296	0.28
297	0.28
298	0.27
299	0.26
300	0.24
301	0.19
302	0.16
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.14
307	0.14
308	0.14
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.08
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.03
322	0.03
323	0.02
324	0.02
325	0.02
326	0.02
327	0.02
328	0.02
329	0.02
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.08
338	0.1
339	0.12
340	0.16
341	0.16
342	0.19
343	0.2
344	0.21
345	0.25
346	0.29
347	0.3
348	0.27
349	0.36
350	0.37
351	0.39
352	0.41
353	0.37
354	0.35
355	0.39
356	0.46
357	0.42
358	0.48
359	0.55
360	0.59
361	0.64
362	0.66
363	0.64
364	0.63
365	0.66
366	0.62
367	0.57
368	0.56
369	0.6
370	0.57
371	0.56
372	0.54
373	0.57
374	0.58
375	0.55
376	0.53
377	0.47
378	0.47
379	0.48
380	0.46
381	0.4
382	0.36
383	0.34
384	0.3
385	0.26
386	0.22
387	0.16
388	0.15
389	0.13
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.13
394	0.15
395	0.16
396	0.18
397	0.17
398	0.13
399	0.15
400	0.16
401	0.16
402	0.17
403	0.17
404	0.16
405	0.18
406	0.17
407	0.17
408	0.17
409	0.18
410	0.16
411	0.17
412	0.21
413	0.18
414	0.21
415	0.22
416	0.23
417	0.23
418	0.29
419	0.3
420	0.3
421	0.35
422	0.38
423	0.44
424	0.51
425	0.52
426	0.53

A0A161HLH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer