Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161HH86

Protein Details
Accession A0A161HH86    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-376GRRSGGHGRRRDRGDRRDRGDRGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-378DRSRSPRSNPPSGPRGGRRSGGHGRRRDRGDRRDRGDRGDRG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034156  Hrp1_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG slb:AWJ20_2927  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12577  RRM1_Hrp1p  
Amino Acid Sequences MFIGGLNWETTDESLKAYFSKYGQVLECNIMRDNVTGRSRGFGFLTFDSVEAVNKVVSQSEHYLDGKIIDPKRAIPREEQNKTAKIFVGGVGSDVNDRDFKSFFEKYGVVIDAQLMLDKDTGRPRGFGFVTFDSDEAVEKILSEHVLILKNKAIEVKRAEPRGGKGGNMGDHSGRNDYQGNAYGRNALGRGGNVGYGGHGEQSSQNNYMAGMNPAMMSQYYSWYMNAMRQQQMQLQGQGGNSPGGDQTQNPAMAAMFSMMQQQQQQQQQQQVQAGGSASPPALPGSGSPGLPQPRPYEDVEGNGDDDRHGYRDRDDDSRGRYSGSYRDDRGGNWSRDRSRSPRSNPPSGPRGGRRSGGHGRRRDRGDRRDRGDRGDRGDRGDRGGDSSYSGYQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.17
5 0.2
6 0.17
7 0.24
8 0.23
9 0.27
10 0.29
11 0.3
12 0.31
13 0.33
14 0.34
15 0.3
16 0.29
17 0.25
18 0.24
19 0.23
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.27
24 0.26
25 0.29
26 0.3
27 0.3
28 0.28
29 0.23
30 0.25
31 0.22
32 0.25
33 0.22
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.17
38 0.13
39 0.12
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.13
46 0.16
47 0.17
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.22
53 0.21
54 0.25
55 0.25
56 0.25
57 0.25
58 0.31
59 0.4
60 0.44
61 0.43
62 0.43
63 0.51
64 0.58
65 0.61
66 0.62
67 0.59
68 0.59
69 0.58
70 0.53
71 0.43
72 0.34
73 0.3
74 0.25
75 0.2
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.19
89 0.2
90 0.19
91 0.22
92 0.22
93 0.21
94 0.23
95 0.23
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.11
107 0.15
108 0.21
109 0.2
110 0.22
111 0.22
112 0.27
113 0.27
114 0.26
115 0.25
116 0.22
117 0.25
118 0.24
119 0.23
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.11
124 0.1
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.21
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.31
144 0.34
145 0.36
146 0.38
147 0.35
148 0.37
149 0.39
150 0.34
151 0.27
152 0.24
153 0.24
154 0.24
155 0.22
156 0.21
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.14
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.07
189 0.1
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.17
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.22
218 0.24
219 0.3
220 0.28
221 0.24
222 0.21
223 0.2
224 0.19
225 0.19
226 0.16
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.14
250 0.2
251 0.25
252 0.3
253 0.31
254 0.38
255 0.4
256 0.41
257 0.41
258 0.36
259 0.3
260 0.26
261 0.22
262 0.16
263 0.12
264 0.1
265 0.08
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.19
277 0.23
278 0.24
279 0.27
280 0.24
281 0.27
282 0.3
283 0.32
284 0.32
285 0.29
286 0.32
287 0.32
288 0.29
289 0.26
290 0.23
291 0.21
292 0.15
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.22
300 0.25
301 0.28
302 0.32
303 0.35
304 0.38
305 0.43
306 0.4
307 0.36
308 0.34
309 0.33
310 0.35
311 0.37
312 0.37
313 0.35
314 0.39
315 0.38
316 0.38
317 0.44
318 0.45
319 0.43
320 0.44
321 0.5
322 0.51
323 0.56
324 0.62
325 0.61
326 0.62
327 0.67
328 0.67
329 0.7
330 0.72
331 0.76
332 0.76
333 0.76
334 0.73
335 0.69
336 0.7
337 0.67
338 0.67
339 0.62
340 0.61
341 0.56
342 0.58
343 0.63
344 0.64
345 0.65
346 0.67
347 0.69
348 0.72
349 0.77
350 0.79
351 0.78
352 0.79
353 0.81
354 0.82
355 0.83
356 0.85
357 0.8
358 0.79
359 0.78
360 0.74
361 0.71
362 0.7
363 0.65
364 0.61
365 0.65
366 0.58
367 0.52
368 0.5
369 0.42
370 0.37
371 0.37
372 0.3
373 0.26
374 0.27