Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161HL18

Protein Details
Accession A0A161HL18    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-283RLQHQGHSREREKRTKERQELQILVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG slb:AWJ20_4838  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MSSNPPAPLSPEEQARHLEESLQFIRQQEHQMRKCLETKGKLLDAIRHASTFLAELRSSVLTPKQYYELYIAVFDALRHLGDFLREDHPNHHLADIYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTAYMSVPDAPVREIMKDMMEMCRGVQHPIRGLFLRYYLSQGTRDYLPSGEDVNGTNGGVITAAVATTSSDDSAAGPGETKNVADTRSNTSNGNGSETTITGPGSASAVTSAPVIDPELRGNLKDSIQFIITNFIEMNKLWVRLQHQGHSREREKRTKERQELQILVGSNLVRLSQLEGIDKEYYKESILPAILEQVTST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.38
4 0.33
5 0.33
6 0.26
7 0.31
8 0.31
9 0.3
10 0.28
11 0.26
12 0.29
13 0.28
14 0.36
15 0.37
16 0.46
17 0.48
18 0.55
19 0.57
20 0.59
21 0.61
22 0.6
23 0.6
24 0.55
25 0.56
26 0.54
27 0.53
28 0.52
29 0.48
30 0.46
31 0.43
32 0.42
33 0.37
34 0.3
35 0.29
36 0.25
37 0.23
38 0.18
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.21
50 0.22
51 0.24
52 0.23
53 0.24
54 0.25
55 0.22
56 0.18
57 0.17
58 0.15
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.2
75 0.23
76 0.24
77 0.23
78 0.2
79 0.18
80 0.16
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.12
127 0.12
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.17
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.12
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.12
188 0.14
189 0.2
190 0.23
191 0.25
192 0.24
193 0.24
194 0.27
195 0.25
196 0.26
197 0.19
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.12
203 0.11
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.16
233 0.2
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.19
241 0.15
242 0.17
243 0.16
244 0.2
245 0.23
246 0.3
247 0.34
248 0.36
249 0.42
250 0.48
251 0.55
252 0.61
253 0.65
254 0.66
255 0.71
256 0.73
257 0.74
258 0.77
259 0.8
260 0.82
261 0.84
262 0.84
263 0.85
264 0.84
265 0.79
266 0.7
267 0.63
268 0.53
269 0.44
270 0.37
271 0.28
272 0.19
273 0.16
274 0.14
275 0.1
276 0.09
277 0.12
278 0.13
279 0.14
280 0.18
281 0.18
282 0.22
283 0.25
284 0.25
285 0.24
286 0.23
287 0.22
288 0.2
289 0.21
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.19
294 0.17
295 0.22
296 0.2