FuNGI

A0A161HH06

Protein Details

Accession

A0A161HH06

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-92	SESNAANGKKKSKKQHRNKVHQKSEAGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
72-99	GKKKSKKQHRNKVHQKSEAGSDKAGEKH

Subcellular Location(s)

cyto 17, cyto_nucl 13.166, cyto_mito 11.332, nucl 6, mito_nucl 5.832

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR045209 Rrp5 IPR022967 S1_dom IPR003029 S1_domain IPR002792 TRAM_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	slb:AWJ20_4019 -
Pfam	View protein in Pfam PF00575 S1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1 PS50926 TRAM
CDD	cd05693 S1_Rrp5_repeat_hs1_sc1

Amino Acid Sequences

MSFKRKRDEESAGVAPVSQPPSALRMEDTAFPRGGASTVLTPLEIKQATNEATRDLFTVRFYWASESNAANGKKKSKKQHRNKVHQKSEAGSDKAGEKHKIKVESLSFGKLTAGSVVLGQVVQINTLDIALSLPNNLLGYVPITNISAKLSERISKAEDDDESGSEDEDNEDSDLPQLSQLFKVGQWLRALVVENEKVNNKKRIELSIDPLQVNEEIETDDLVAGIAVQGSVQSVEDHGIIVDIGRDDVSGFLSNKELSHAGIEASSLGVGQVLLLTILSKSANGRTVTLTASATAKKMTIVKAVTLNKSLLAGTLVEVLITDIRSNGLVGKVFGSIDATIDIVHSGIYDRAVLEQNFKEGKVVKGRVIYSPPAAVSESDDENSTKVFVSLLETTIELKVAEDGDALPIGQILEAKVKIVDANGLYVDIGTKSLGFVHVSRVADKRIEDLSIEEAYSVGTTHPARILNYNYADNLYIVSTEKSVIEQKYLRVEDVSVGEKVTGTVDRILPKGGVLIKLWEGFSGIANDIHLSDIKLAHPEKKFKPGMKVTARVSSIICFKVDCGYLRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.33
3	0.3
4	0.27
5	0.19
6	0.16
7	0.16
8	0.19
9	0.21
10	0.21
11	0.17
12	0.18
13	0.2
14	0.26
15	0.28
16	0.28
17	0.27
18	0.26
19	0.25
20	0.22
21	0.2
22	0.15
23	0.14
24	0.12
25	0.14
26	0.15
27	0.14
28	0.14
29	0.15
30	0.21
31	0.19
32	0.17
33	0.17
34	0.22
35	0.24
36	0.27
37	0.27
38	0.23
39	0.23
40	0.24
41	0.23
42	0.2
43	0.19
44	0.16
45	0.17
46	0.17
47	0.17
48	0.17
49	0.2
50	0.21
51	0.23
52	0.25
53	0.24
54	0.25
55	0.31
56	0.33
57	0.34
58	0.36
59	0.43
60	0.49
61	0.56
62	0.64
63	0.68
64	0.77
65	0.83
66	0.89
67	0.91
68	0.93
69	0.96
70	0.96
71	0.94
72	0.91
73	0.84
74	0.75
75	0.73
76	0.7
77	0.61
78	0.5
79	0.41
80	0.38
81	0.39
82	0.41
83	0.39
84	0.33
85	0.38
86	0.44
87	0.46
88	0.44
89	0.45
90	0.43
91	0.44
92	0.45
93	0.41
94	0.35
95	0.31
96	0.3
97	0.23
98	0.2
99	0.13
100	0.11
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.06
106	0.06
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.04
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.12
137	0.14
138	0.18
139	0.19
140	0.21
141	0.23
142	0.23
143	0.24
144	0.24
145	0.22
146	0.2
147	0.2
148	0.18
149	0.17
150	0.16
151	0.14
152	0.12
153	0.11
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.09
162	0.07
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.17
171	0.18
172	0.2
173	0.2
174	0.2
175	0.19
176	0.2
177	0.21
178	0.15
179	0.18
180	0.17
181	0.17
182	0.18
183	0.22
184	0.25
185	0.29
186	0.36
187	0.32
188	0.36
189	0.37
190	0.4
191	0.43
192	0.41
193	0.42
194	0.42
195	0.44
196	0.38
197	0.36
198	0.32
199	0.25
200	0.23
201	0.17
202	0.09
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.04
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.02
215	0.02
216	0.02
217	0.02
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.03
231	0.04
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.02
258	0.02
259	0.02
260	0.02
261	0.02
262	0.02
263	0.02
264	0.02
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.06
270	0.11
271	0.11
272	0.12
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.15
277	0.13
278	0.1
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.11
286	0.11
287	0.14
288	0.13
289	0.14
290	0.21
291	0.24
292	0.24
293	0.24
294	0.23
295	0.19
296	0.19
297	0.17
298	0.11
299	0.08
300	0.07
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.07
339	0.1
340	0.1
341	0.14
342	0.14
343	0.18
344	0.19
345	0.18
346	0.19
347	0.18
348	0.21
349	0.25
350	0.27
351	0.26
352	0.29
353	0.31
354	0.31
355	0.33
356	0.31
357	0.24
358	0.23
359	0.2
360	0.17
361	0.17
362	0.14
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.13
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.1
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.11
408	0.08
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.09
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.13
425	0.18
426	0.19
427	0.22
428	0.24
429	0.25
430	0.26
431	0.26
432	0.24
433	0.2
434	0.2
435	0.18
436	0.17
437	0.18
438	0.16
439	0.16
440	0.12
441	0.11
442	0.1
443	0.1
444	0.08
445	0.05
446	0.09
447	0.09
448	0.11
449	0.14
450	0.16
451	0.17
452	0.22
453	0.26
454	0.28
455	0.3
456	0.31
457	0.28
458	0.28
459	0.27
460	0.22
461	0.19
462	0.13
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.12
470	0.17
471	0.17
472	0.22
473	0.23
474	0.26
475	0.34
476	0.35
477	0.34
478	0.29
479	0.29
480	0.26
481	0.27
482	0.26
483	0.18
484	0.17
485	0.16
486	0.15
487	0.15
488	0.14
489	0.12
490	0.11
491	0.14
492	0.17
493	0.2
494	0.21
495	0.22
496	0.2
497	0.19
498	0.22
499	0.21
500	0.2
501	0.18
502	0.2
503	0.21
504	0.23
505	0.23
506	0.19
507	0.17
508	0.15
509	0.16
510	0.15
511	0.14
512	0.12
513	0.12
514	0.13
515	0.12
516	0.13
517	0.12
518	0.1
519	0.11
520	0.13
521	0.13
522	0.2
523	0.22
524	0.29
525	0.35
526	0.43
527	0.45
528	0.54
529	0.61
530	0.59
531	0.67
532	0.68
533	0.72
534	0.72
535	0.75
536	0.69
537	0.7
538	0.65
539	0.57
540	0.49
541	0.43
542	0.4
543	0.34
544	0.3
545	0.22
546	0.22
547	0.25
548	0.27

A0A161HH06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer