Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F223

Protein Details
Accession A0A0C4F223    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSNTKKKSSSSEKKASQKPTSSSHydrophilic
41-84IKEKIDKKSGEKEKKDKNSTDKKSSEKKKTDKKSDDKKTTDAKPBasic
87-107AKEKVEKSSKKTKDDKPKTAABasic
109-130TATPKKPDSKAKAKPTESKKTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-137LPPGIKEKIDKKSGEKEKKDKNSTDKKSSEKKKTDKKSDDKKTTDAKPSPAKEKVEKSSKKTKDDKPKTAAATATPKKPDSKAKAKPTESKKTAPIPPKPK
238-257KATPAKATPAKATPAKAAPK
310-311RK
519-581GGRGGGGGFGGRDGGRGGRGGFGDRGGRGGFGDRGRGGGRGFGGDRGGGRGRGGGGRGRGGGD
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MSNTKKKSSSSEKKASQKPTSSSQPATKTKPAAPQTLPPGIKEKIDKKSGEKEKKDKNSTDKKSSEKKKTDKKSDDKKTTDAKPSPAKEKVEKSSKKTKDDKPKTAAATATPKKPDSKAKAKPTESKKTAPIPPKPKSDSGSDSSSDEEDAKPAKEESKASAVKTAKPTSKPTESSSDSGSDSPSDEDDAKPTKEESKASAVKTAKPTTKPAESSSDESESDSDVPKPSPAAKATPAKATPAKATPAKATPAKAAPKPQANGKAAAPVASSSEDSSEDGDDSSDSSESDEDEVPTPPTTDALPASNDKKRKNEGPDPTPKKAKAEEEGIKSVFVGGLSWNVDNEWLKSEFESCGTVLAARVIYDRMTEKSKGFGYVDFETSEAAKKAVETKSGSELDGRTLKVDLSTPKPERAPAEKRDFSKEQLSEPSTTLFIGNVPFSATQDAVWEIFAEFGDVNSVRLPTDPETQRIKGFGYVEYATLDSAKAAVEKGRGEGLQIDGRQVRLDFSQPRSNNDRGGGGRGGGGGFGGRDGGRGGRGGFGDRGGRGGFGDRGRGGGRGFGGDRGGGRGRGGGGRGRGGGDAGWGARAKVNGSVVESAGTKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.85
4 0.82
5 0.76
6 0.74
7 0.75
8 0.72
9 0.69
10 0.67
11 0.67
12 0.67
13 0.69
14 0.68
15 0.64
16 0.62
17 0.66
18 0.63
19 0.62
20 0.58
21 0.58
22 0.58
23 0.62
24 0.57
25 0.5
26 0.5
27 0.44
28 0.45
29 0.46
30 0.47
31 0.46
32 0.53
33 0.55
34 0.55
35 0.64
36 0.7
37 0.73
38 0.74
39 0.75
40 0.79
41 0.86
42 0.88
43 0.86
44 0.86
45 0.86
46 0.85
47 0.85
48 0.82
49 0.8
50 0.82
51 0.84
52 0.84
53 0.83
54 0.85
55 0.85
56 0.89
57 0.91
58 0.91
59 0.92
60 0.92
61 0.93
62 0.92
63 0.87
64 0.84
65 0.81
66 0.78
67 0.77
68 0.71
69 0.68
70 0.68
71 0.68
72 0.69
73 0.67
74 0.65
75 0.63
76 0.66
77 0.67
78 0.68
79 0.7
80 0.69
81 0.73
82 0.75
83 0.76
84 0.78
85 0.78
86 0.79
87 0.82
88 0.85
89 0.8
90 0.8
91 0.74
92 0.68
93 0.59
94 0.53
95 0.53
96 0.49
97 0.49
98 0.46
99 0.45
100 0.45
101 0.49
102 0.54
103 0.52
104 0.58
105 0.61
106 0.68
107 0.75
108 0.77
109 0.82
110 0.81
111 0.82
112 0.77
113 0.72
114 0.68
115 0.66
116 0.68
117 0.67
118 0.68
119 0.67
120 0.69
121 0.72
122 0.71
123 0.68
124 0.63
125 0.6
126 0.56
127 0.51
128 0.48
129 0.4
130 0.36
131 0.32
132 0.3
133 0.24
134 0.2
135 0.16
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.18
143 0.2
144 0.21
145 0.28
146 0.3
147 0.29
148 0.35
149 0.35
150 0.37
151 0.43
152 0.46
153 0.42
154 0.44
155 0.5
156 0.5
157 0.55
158 0.52
159 0.49
160 0.5
161 0.48
162 0.46
163 0.41
164 0.36
165 0.31
166 0.28
167 0.25
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.15
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.21
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.28
185 0.33
186 0.33
187 0.39
188 0.36
189 0.39
190 0.44
191 0.47
192 0.43
193 0.41
194 0.46
195 0.44
196 0.47
197 0.44
198 0.4
199 0.41
200 0.39
201 0.4
202 0.38
203 0.35
204 0.29
205 0.28
206 0.25
207 0.19
208 0.17
209 0.15
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.16
217 0.16
218 0.18
219 0.22
220 0.28
221 0.3
222 0.34
223 0.32
224 0.32
225 0.33
226 0.32
227 0.29
228 0.25
229 0.28
230 0.25
231 0.27
232 0.25
233 0.25
234 0.28
235 0.28
236 0.27
237 0.25
238 0.28
239 0.32
240 0.31
241 0.35
242 0.35
243 0.38
244 0.38
245 0.41
246 0.43
247 0.4
248 0.4
249 0.34
250 0.33
251 0.27
252 0.26
253 0.21
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.15
292 0.19
293 0.24
294 0.27
295 0.31
296 0.34
297 0.39
298 0.44
299 0.49
300 0.53
301 0.56
302 0.64
303 0.66
304 0.66
305 0.66
306 0.58
307 0.53
308 0.48
309 0.43
310 0.36
311 0.36
312 0.37
313 0.36
314 0.38
315 0.35
316 0.31
317 0.27
318 0.24
319 0.16
320 0.1
321 0.07
322 0.04
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.09
352 0.1
353 0.14
354 0.16
355 0.15
356 0.19
357 0.19
358 0.2
359 0.2
360 0.19
361 0.2
362 0.2
363 0.21
364 0.17
365 0.17
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.08
373 0.14
374 0.15
375 0.18
376 0.18
377 0.2
378 0.26
379 0.27
380 0.26
381 0.23
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.21
386 0.16
387 0.16
388 0.15
389 0.14
390 0.16
391 0.16
392 0.19
393 0.27
394 0.29
395 0.32
396 0.33
397 0.35
398 0.37
399 0.41
400 0.43
401 0.43
402 0.51
403 0.53
404 0.54
405 0.59
406 0.57
407 0.52
408 0.52
409 0.45
410 0.39
411 0.4
412 0.4
413 0.35
414 0.33
415 0.31
416 0.23
417 0.22
418 0.18
419 0.12
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.1
429 0.08
430 0.1
431 0.11
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.09
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.09
447 0.1
448 0.13
449 0.13
450 0.22
451 0.24
452 0.29
453 0.35
454 0.36
455 0.37
456 0.36
457 0.33
458 0.28
459 0.27
460 0.23
461 0.21
462 0.2
463 0.19
464 0.19
465 0.18
466 0.14
467 0.13
468 0.12
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.09
475 0.11
476 0.12
477 0.14
478 0.16
479 0.16
480 0.16
481 0.17
482 0.18
483 0.21
484 0.2
485 0.23
486 0.22
487 0.23
488 0.23
489 0.22
490 0.2
491 0.16
492 0.23
493 0.25
494 0.3
495 0.39
496 0.39
497 0.45
498 0.5
499 0.51
500 0.48
501 0.44
502 0.43
503 0.35
504 0.39
505 0.33
506 0.27
507 0.25
508 0.21
509 0.19
510 0.13
511 0.12
512 0.07
513 0.06
514 0.05
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.11
522 0.12
523 0.13
524 0.14
525 0.17
526 0.17
527 0.18
528 0.2
529 0.19
530 0.21
531 0.18
532 0.18
533 0.16
534 0.18
535 0.2
536 0.18
537 0.23
538 0.21
539 0.23
540 0.24
541 0.25
542 0.22
543 0.21
544 0.2
545 0.2
546 0.21
547 0.19
548 0.2
549 0.19
550 0.19
551 0.21
552 0.23
553 0.19
554 0.19
555 0.19
556 0.2
557 0.21
558 0.23
559 0.23
560 0.24
561 0.26
562 0.27
563 0.26
564 0.24
565 0.22
566 0.19
567 0.16
568 0.15
569 0.12
570 0.14
571 0.13
572 0.14
573 0.16
574 0.17
575 0.16
576 0.18
577 0.21
578 0.19
579 0.22
580 0.23
581 0.21
582 0.22
583 0.22
584 0.2
585 0.22