Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161HJ29

Protein Details
Accession A0A161HJ29    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70EYQGRKRKEYEEALRRNRLNHydrophilic
587-606AKERARKIFQRAWNRFKQTDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4.5, cyto_mito 4.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG slb:AWJ20_4122  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13174  TPR_6  
Amino Acid Sequences MNSERTARVKNKAVAPLQITAEQILLEAFERRDDGLKVPEQRITDSEELKEYQGRKRKEYEEALRRNRLNFGQWMRYAQWEIDQREMERARSVFERALDVDSTNVPLWIRYIQCELKERNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWFNYVSVEEMLSNIPGCRQVFERWMAWRPNPPAWNAYINLEKRYGEYDRARDIFERFTAAYPQSENWIKWARFEEEVGTAENVRDVYTLAVDTILAIGGEEFLDEKILANWAKWEARQKEWERARAIYKFGLERLSKSKSENLYNSYTAFEKQYGDKDGIDDVILSKRRIKYEDQVTSDPFDYDAWFSYLTLMEETSSDDVDSVRDVYERAIANVPQIEEKRYWRRYIFLWIRYAVYEELTNNDVERTREIYNQCIKTIPHKKFSFDKIWLLYAKFEIRQGNLQRARKILGQGLGLSGKPKIYKGYIELEKELKEFDRCRKLYEKFLENYPDLPLGWIEYATLEQQLGDDDRARAIYELAIEQPEMEMPELVWKRYIEFETEVGEYDRARKLFETLVEKTNHVKVWCSYATFELSVPGEDSDDEDHAGYNEDDEDEEREIVVTEEAKERARKIFQRAWNRFKQTDQKEDRVVLNNTWIEFEKTYGTPETLSTVEKQAPSMVKKRRRLPDGSFEEYFDYVFPTDEDNSMAKLLEAARKFKERQAAAASSSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.59
3 0.55
4 0.49
5 0.44
6 0.37
7 0.29
8 0.26
9 0.2
10 0.16
11 0.11
12 0.09
13 0.08
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.17
20 0.18
21 0.21
22 0.25
23 0.31
24 0.37
25 0.39
26 0.42
27 0.4
28 0.41
29 0.39
30 0.39
31 0.37
32 0.33
33 0.33
34 0.32
35 0.32
36 0.32
37 0.36
38 0.32
39 0.36
40 0.42
41 0.46
42 0.48
43 0.55
44 0.58
45 0.61
46 0.68
47 0.69
48 0.71
49 0.77
50 0.79
51 0.8
52 0.78
53 0.71
54 0.67
55 0.59
56 0.54
57 0.52
58 0.5
59 0.49
60 0.48
61 0.5
62 0.46
63 0.46
64 0.43
65 0.35
66 0.35
67 0.35
68 0.36
69 0.37
70 0.38
71 0.35
72 0.42
73 0.43
74 0.37
75 0.35
76 0.33
77 0.3
78 0.3
79 0.32
80 0.26
81 0.25
82 0.27
83 0.23
84 0.25
85 0.23
86 0.21
87 0.19
88 0.17
89 0.19
90 0.15
91 0.15
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.22
99 0.25
100 0.29
101 0.37
102 0.38
103 0.42
104 0.49
105 0.48
106 0.52
107 0.58
108 0.57
109 0.53
110 0.56
111 0.49
112 0.45
113 0.48
114 0.38
115 0.29
116 0.27
117 0.26
118 0.23
119 0.21
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.18
124 0.19
125 0.18
126 0.19
127 0.23
128 0.29
129 0.26
130 0.26
131 0.27
132 0.26
133 0.25
134 0.22
135 0.19
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.07
142 0.08
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.18
148 0.22
149 0.26
150 0.28
151 0.29
152 0.35
153 0.38
154 0.38
155 0.43
156 0.43
157 0.47
158 0.46
159 0.44
160 0.39
161 0.38
162 0.39
163 0.32
164 0.3
165 0.31
166 0.31
167 0.3
168 0.29
169 0.26
170 0.24
171 0.27
172 0.26
173 0.25
174 0.29
175 0.31
176 0.36
177 0.37
178 0.38
179 0.35
180 0.35
181 0.31
182 0.26
183 0.24
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.17
190 0.17
191 0.2
192 0.22
193 0.2
194 0.23
195 0.3
196 0.29
197 0.31
198 0.34
199 0.31
200 0.3
201 0.3
202 0.27
203 0.21
204 0.22
205 0.19
206 0.16
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.24
243 0.24
244 0.28
245 0.38
246 0.4
247 0.47
248 0.51
249 0.56
250 0.49
251 0.49
252 0.5
253 0.43
254 0.42
255 0.34
256 0.3
257 0.25
258 0.24
259 0.26
260 0.22
261 0.22
262 0.25
263 0.28
264 0.27
265 0.28
266 0.33
267 0.31
268 0.36
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.34
273 0.32
274 0.28
275 0.24
276 0.2
277 0.18
278 0.15
279 0.12
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.13
288 0.11
289 0.08
290 0.07
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.18
295 0.2
296 0.22
297 0.25
298 0.27
299 0.31
300 0.38
301 0.44
302 0.44
303 0.43
304 0.43
305 0.42
306 0.39
307 0.31
308 0.21
309 0.15
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.2
349 0.28
350 0.3
351 0.33
352 0.31
353 0.32
354 0.32
355 0.41
356 0.42
357 0.36
358 0.36
359 0.34
360 0.34
361 0.32
362 0.32
363 0.21
364 0.15
365 0.12
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.18
378 0.19
379 0.25
380 0.32
381 0.32
382 0.31
383 0.3
384 0.29
385 0.34
386 0.43
387 0.4
388 0.42
389 0.42
390 0.45
391 0.49
392 0.54
393 0.51
394 0.45
395 0.45
396 0.37
397 0.39
398 0.37
399 0.32
400 0.27
401 0.22
402 0.2
403 0.16
404 0.18
405 0.16
406 0.16
407 0.23
408 0.24
409 0.32
410 0.37
411 0.41
412 0.4
413 0.4
414 0.41
415 0.36
416 0.36
417 0.29
418 0.25
419 0.21
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.15
424 0.14
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.14
432 0.17
433 0.25
434 0.28
435 0.3
436 0.31
437 0.31
438 0.3
439 0.29
440 0.27
441 0.2
442 0.2
443 0.22
444 0.28
445 0.36
446 0.35
447 0.4
448 0.47
449 0.48
450 0.53
451 0.56
452 0.54
453 0.46
454 0.5
455 0.5
456 0.43
457 0.41
458 0.33
459 0.27
460 0.2
461 0.18
462 0.14
463 0.1
464 0.09
465 0.08
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.14
498 0.16
499 0.16
500 0.18
501 0.17
502 0.18
503 0.22
504 0.24
505 0.18
506 0.19
507 0.2
508 0.2
509 0.2
510 0.2
511 0.17
512 0.17
513 0.14
514 0.16
515 0.19
516 0.17
517 0.18
518 0.17
519 0.18
520 0.21
521 0.26
522 0.28
523 0.28
524 0.34
525 0.34
526 0.35
527 0.36
528 0.37
529 0.35
530 0.29
531 0.29
532 0.23
533 0.29
534 0.29
535 0.27
536 0.24
537 0.23
538 0.26
539 0.23
540 0.22
541 0.18
542 0.17
543 0.15
544 0.15
545 0.13
546 0.11
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.12
556 0.1
557 0.09
558 0.09
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.12
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.09
571 0.1
572 0.14
573 0.15
574 0.19
575 0.22
576 0.24
577 0.29
578 0.36
579 0.41
580 0.46
581 0.53
582 0.58
583 0.67
584 0.75
585 0.77
586 0.79
587 0.8
588 0.74
589 0.73
590 0.74
591 0.71
592 0.72
593 0.71
594 0.68
595 0.65
596 0.65
597 0.62
598 0.59
599 0.54
600 0.45
601 0.44
602 0.39
603 0.35
604 0.34
605 0.31
606 0.27
607 0.24
608 0.24
609 0.21
610 0.19
611 0.22
612 0.22
613 0.21
614 0.18
615 0.18
616 0.2
617 0.18
618 0.19
619 0.18
620 0.2
621 0.24
622 0.23
623 0.24
624 0.26
625 0.31
626 0.35
627 0.42
628 0.48
629 0.54
630 0.62
631 0.71
632 0.76
633 0.77
634 0.78
635 0.77
636 0.78
637 0.77
638 0.75
639 0.66
640 0.58
641 0.53
642 0.45
643 0.38
644 0.27
645 0.21
646 0.14
647 0.13
648 0.12
649 0.13
650 0.14
651 0.15
652 0.17
653 0.16
654 0.17
655 0.17
656 0.17
657 0.13
658 0.14
659 0.17
660 0.22
661 0.24
662 0.28
663 0.33
664 0.41
665 0.44
666 0.46
667 0.53
668 0.47
669 0.5
670 0.53
671 0.51