Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A161HFQ8

Protein Details
Accession A0A161HFQ8    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52TVALRFRPVKKAVKKKDAPKEVKDVHydrophilic
294-319KKRPGSGRIVQSRGRKRQKKQRTVPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-45PVKKAVKKKDA
292-315ASKKRPGSGRIVQSRGRKRQKKQR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG slb:AWJ20_4241  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MNKNVGLSVYDLINSEEHLEEESSQSVTVALRFRPVKKAVKKKDAPKEVKDVINSDENKEGKQGDQPKSQLVYFAEPVVHKPVQEQELEDAFESRVKDQKEPDKVKTKNEAKKTEELSSTSLPRLHYYAEREIVPGIGASRAEYTLWTEDYDPLHPNSYHDYKESEEKLAEDQDWLDYLLNLRAERDREQDGNVRYGLDYGSKGSGANESEDEDQLTSKETEAETGDQEEQGEDDNIDEEEEKEDVTLNQKSATVPPGDSFAASLLKKYGWKPGKGLGKSSNGIVRPLVVIASKKRPGSGRIVQSRGRKRQKKQRTVPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.14
9 0.15
10 0.13
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.14
18 0.22
19 0.27
20 0.3
21 0.37
22 0.44
23 0.5
24 0.57
25 0.68
26 0.71
27 0.77
28 0.83
29 0.85
30 0.88
31 0.89
32 0.87
33 0.81
34 0.8
35 0.75
36 0.71
37 0.63
38 0.54
39 0.47
40 0.47
41 0.43
42 0.36
43 0.37
44 0.33
45 0.31
46 0.31
47 0.28
48 0.22
49 0.28
50 0.35
51 0.34
52 0.41
53 0.42
54 0.44
55 0.45
56 0.44
57 0.4
58 0.33
59 0.31
60 0.24
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.21
65 0.24
66 0.22
67 0.18
68 0.19
69 0.23
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.2
74 0.21
75 0.22
76 0.2
77 0.16
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.13
82 0.16
83 0.17
84 0.2
85 0.26
86 0.34
87 0.43
88 0.48
89 0.53
90 0.59
91 0.6
92 0.63
93 0.67
94 0.68
95 0.65
96 0.69
97 0.69
98 0.63
99 0.68
100 0.65
101 0.59
102 0.51
103 0.45
104 0.4
105 0.35
106 0.32
107 0.26
108 0.25
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.18
114 0.21
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.19
121 0.15
122 0.11
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.17
145 0.19
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.17
150 0.23
151 0.23
152 0.19
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.11
171 0.13
172 0.16
173 0.18
174 0.2
175 0.19
176 0.22
177 0.27
178 0.27
179 0.27
180 0.25
181 0.22
182 0.18
183 0.18
184 0.16
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.11
204 0.09
205 0.08
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.21
241 0.18
242 0.16
243 0.16
244 0.19
245 0.18
246 0.17
247 0.15
248 0.13
249 0.17
250 0.16
251 0.16
252 0.14
253 0.16
254 0.19
255 0.21
256 0.29
257 0.31
258 0.34
259 0.37
260 0.44
261 0.52
262 0.5
263 0.55
264 0.52
265 0.51
266 0.49
267 0.5
268 0.47
269 0.38
270 0.38
271 0.32
272 0.26
273 0.2
274 0.19
275 0.17
276 0.14
277 0.17
278 0.22
279 0.31
280 0.35
281 0.35
282 0.4
283 0.43
284 0.45
285 0.49
286 0.52
287 0.54
288 0.57
289 0.62
290 0.65
291 0.71
292 0.77
293 0.79
294 0.81
295 0.8
296 0.82
297 0.87
298 0.92
299 0.93