FuNGI

A0A167D8H8

Protein Details

Accession

A0A167D8H8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-39	LRRMQILKKINDQCKKQRSCLHC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	slb:AWJ20_870 -
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MKRKFLSELRRPGIDNLRRMQILKKINDQCKKQRSCLHCGAINGVVKKAGALKVIHDKFRWIGKKVPDEKAEFDKSFDEAKNANPEIEKFLKKAMDDLNPLKVLNLFREILPHECELLGMDPTKGRPEMYIWRDVPAPPVCIRPSVMQDTASNEDDLTVKLTEIVWTSSLIRAGLEKGMSIANLMEQWDYLQLSLALYINADTPSGPGMPAAKPIRALCQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLRVDEVAVPDRVAKILTYPEKVNRYNKAKLQKLVSNGALQYPGANYVLKKDGIGRLNLRFARKDNIAAELQIGDIVERHLEDGDIVLFNRQPSLHRLSILSHFAKIRPWRTFRLNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAEAMALMGVKNNLVTPRSGEPIIAATQDFITGSFLISKKDQFFDRASFCEILSMMSDGNLQFDLPPPAIFKPERLWTGKQVFSLLIKPNRQSKVIINLDAKNKTFHAPPKGVPNEMSPNDGYVLIRGSQVLCGSMDKNTLGDGKKNSVFYAILRDHGPVEAANAMNRMAKMCARWLGNRGFSIGINDVTPGKALNAHKDRLVELAYSRCDDLIEQLAQGKLETQPGCNEEQTLEAKIGGLLSKVREEVGDVCIKELEKSNAPLIMATCGSKGSTLNVSQMVAVVGQQIISGSRVPDGFQNRSLPHFPKFSKTPPSKGFVRNSFYSGLTPPEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSSQYDNTVRTSSNSIVQFVYGGDGLDPFDMEGDAKPVDFSRTWAHCQNITFSNEEKNLLPYEIVQVCNSIIDPLINRLERRDNLGELVKQEDSQLEVYVDEHDPQRDFYQSVREFVYSKAEDLANVRLRKNMADLLEPPEGEYANVDFDELVSVEKKIAVDQVYKISRKLVETFLQICLFKYERAKVEPGTAVGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINASKTISTPIIAACLANDDDERTARIVKGRVEKTMLKDVAAYIEDVYSEHSAYVSIGIDMKTIDRLQLGLTLDDIRKAIRFAPKLKLTDQDVNVIDRYNVIQVSVRPVTSTSKAVETVTASGLTYMDSELFQRAQHLRRVLPDVVVKGFPDIARAVINIREDNGKKELLVEGYGLQNVMITDGVVGHKTTTNHILEMRQVLGIEAARSSIINEIHYTMTKHGMSVDPRHIQLLGDVMTFKGEVLGITRFGLAKMRDSVLQLASFEKTTDHLFDASFYMKTDKIEGVSECIILGQSMSIGTGAFKVVRPLEDVDQAASYLSKPTIFEDLCETYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.6
3	0.55
4	0.56
5	0.54
6	0.54
7	0.52
8	0.5
9	0.51
10	0.5
11	0.55
12	0.59
13	0.67
14	0.74
15	0.78
16	0.8
17	0.81
18	0.82
19	0.81
20	0.8
21	0.77
22	0.78
23	0.78
24	0.75
25	0.67
26	0.62
27	0.57
28	0.54
29	0.53
30	0.45
31	0.36
32	0.3
33	0.26
34	0.25
35	0.26
36	0.22
37	0.21
38	0.2
39	0.25
40	0.35
41	0.4
42	0.44
43	0.4
44	0.41
45	0.41
46	0.5
47	0.52
48	0.45
49	0.48
50	0.52
51	0.62
52	0.66
53	0.71
54	0.67
55	0.65
56	0.66
57	0.67
58	0.66
59	0.56
60	0.5
61	0.43
62	0.39
63	0.4
64	0.35
65	0.31
66	0.25
67	0.29
68	0.36
69	0.35
70	0.35
71	0.31
72	0.32
73	0.35
74	0.41
75	0.39
76	0.31
77	0.35
78	0.36
79	0.34
80	0.39
81	0.37
82	0.37
83	0.42
84	0.44
85	0.45
86	0.43
87	0.43
88	0.38
89	0.35
90	0.3
91	0.26
92	0.28
93	0.22
94	0.21
95	0.26
96	0.27
97	0.27
98	0.29
99	0.26
100	0.23
101	0.21
102	0.21
103	0.18
104	0.17
105	0.16
106	0.13
107	0.13
108	0.14
109	0.16
110	0.2
111	0.19
112	0.18
113	0.17
114	0.21
115	0.3
116	0.33
117	0.41
118	0.38
119	0.39
120	0.41
121	0.4
122	0.42
123	0.35
124	0.34
125	0.27
126	0.32
127	0.31
128	0.31
129	0.33
130	0.3
131	0.33
132	0.35
133	0.35
134	0.31
135	0.31
136	0.34
137	0.37
138	0.34
139	0.28
140	0.22
141	0.21
142	0.2
143	0.19
144	0.16
145	0.12
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.12
150	0.12
151	0.13
152	0.11
153	0.12
154	0.14
155	0.15
156	0.16
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.15
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.09
169	0.07
170	0.08
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.1
182	0.09
183	0.07
184	0.07
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.11
196	0.11
197	0.2
198	0.21
199	0.21
200	0.24
201	0.25
202	0.34
203	0.37
204	0.43
205	0.4
206	0.48
207	0.55
208	0.57
209	0.66
210	0.65
211	0.68
212	0.71
213	0.75
214	0.74
215	0.7
216	0.7
217	0.7
218	0.71
219	0.68
220	0.67
221	0.65
222	0.56
223	0.53
224	0.49
225	0.42
226	0.34
227	0.31
228	0.32
229	0.24
230	0.24
231	0.25
232	0.27
233	0.27
234	0.3
235	0.29
236	0.25
237	0.26
238	0.27
239	0.25
240	0.23
241	0.21
242	0.2
243	0.21
244	0.19
245	0.18
246	0.17
247	0.17
248	0.17
249	0.16
250	0.13
251	0.1
252	0.09
253	0.17
254	0.21
255	0.23
256	0.26
257	0.32
258	0.39
259	0.45
260	0.5
261	0.51
262	0.54
263	0.58
264	0.62
265	0.65
266	0.65
267	0.65
268	0.65
269	0.6
270	0.58
271	0.56
272	0.51
273	0.45
274	0.38
275	0.34
276	0.28
277	0.23
278	0.19
279	0.13
280	0.13
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.13
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.18
289	0.24
290	0.26
291	0.3
292	0.31
293	0.31
294	0.38
295	0.41
296	0.41
297	0.38
298	0.37
299	0.38
300	0.36
301	0.37
302	0.31
303	0.32
304	0.29
305	0.26
306	0.24
307	0.18
308	0.16
309	0.12
310	0.11
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.16
331	0.23
332	0.23
333	0.23
334	0.24
335	0.26
336	0.3
337	0.34
338	0.3
339	0.26
340	0.26
341	0.25
342	0.31
343	0.35
344	0.37
345	0.39
346	0.43
347	0.46
348	0.52
349	0.59
350	0.58
351	0.62
352	0.57
353	0.52
354	0.5
355	0.47
356	0.4
357	0.34
358	0.31
359	0.24
360	0.22
361	0.2
362	0.18
363	0.15
364	0.15
365	0.14
366	0.12
367	0.09
368	0.08
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.06
374	0.07
375	0.1
376	0.11
377	0.1
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.11
396	0.14
397	0.17
398	0.17
399	0.16
400	0.14
401	0.16
402	0.16
403	0.14
404	0.11
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.06
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.1
414	0.1
415	0.12
416	0.13
417	0.16
418	0.17
419	0.2
420	0.21
421	0.21
422	0.23
423	0.26
424	0.28
425	0.27
426	0.28
427	0.26
428	0.24
429	0.22
430	0.19
431	0.14
432	0.12
433	0.1
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.06
441	0.06
442	0.08
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.18
452	0.23
453	0.27
454	0.29
455	0.31
456	0.34
457	0.4
458	0.4
459	0.36
460	0.33
461	0.29
462	0.26
463	0.29
464	0.28
465	0.28
466	0.29
467	0.32
468	0.39
469	0.4
470	0.4
471	0.37
472	0.34
473	0.38
474	0.39
475	0.4
476	0.36
477	0.39
478	0.43
479	0.43
480	0.4
481	0.32
482	0.29
483	0.26
484	0.27
485	0.29
486	0.3
487	0.31
488	0.32
489	0.4
490	0.41
491	0.41
492	0.37
493	0.35
494	0.35
495	0.33
496	0.34
497	0.23
498	0.22
499	0.21
500	0.21
501	0.17
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.07
508	0.07
509	0.08
510	0.08
511	0.07
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.13
520	0.12
521	0.16
522	0.17
523	0.2
524	0.23
525	0.23
526	0.22
527	0.2
528	0.19
529	0.16
530	0.22
531	0.18
532	0.17
533	0.17
534	0.18
535	0.16
536	0.16
537	0.16
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.08
549	0.09
550	0.09
551	0.11
552	0.15
553	0.16
554	0.17
555	0.21
556	0.24
557	0.26
558	0.25
559	0.24
560	0.21
561	0.19
562	0.19
563	0.16
564	0.12
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.08
569	0.08
570	0.06
571	0.05
572	0.1
573	0.11
574	0.19
575	0.23
576	0.24
577	0.25
578	0.26
579	0.26
580	0.23
581	0.23
582	0.14
583	0.12
584	0.14
585	0.13
586	0.13
587	0.13
588	0.11
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.1
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.09
600	0.07
601	0.12
602	0.12
603	0.11
604	0.13
605	0.15
606	0.17
607	0.16
608	0.16
609	0.11
610	0.13
611	0.14
612	0.12
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.08
617	0.08
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.06
626	0.07
627	0.08
628	0.1
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.12
633	0.12
634	0.12
635	0.13
636	0.13
637	0.11
638	0.13
639	0.14
640	0.14
641	0.14
642	0.13
643	0.11
644	0.1
645	0.09
646	0.08
647	0.07
648	0.06
649	0.07
650	0.07
651	0.06
652	0.07
653	0.08
654	0.09
655	0.1
656	0.1
657	0.11
658	0.1
659	0.1
660	0.09
661	0.06
662	0.05
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.03
668	0.03
669	0.04
670	0.05
671	0.05
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.11
676	0.15
677	0.16
678	0.18
679	0.22
680	0.21
681	0.24
682	0.28
683	0.26
684	0.25
685	0.28
686	0.27
687	0.28
688	0.31
689	0.33
690	0.39
691	0.41
692	0.45
693	0.43
694	0.47
695	0.47
696	0.5
697	0.52
698	0.48
699	0.49
700	0.42
701	0.41
702	0.38
703	0.33
704	0.28
705	0.22
706	0.2
707	0.15
708	0.15
709	0.13
710	0.12
711	0.12
712	0.11
713	0.11
714	0.08
715	0.09
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.07
720	0.07
721	0.06
722	0.06
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.06
732	0.07
733	0.07
734	0.09
735	0.14
736	0.15
737	0.19
738	0.19
739	0.19
740	0.19
741	0.19
742	0.21
743	0.19
744	0.2
745	0.17
746	0.17
747	0.19
748	0.2
749	0.18
750	0.15
751	0.14
752	0.13
753	0.13
754	0.14
755	0.11
756	0.11
757	0.14
758	0.15
759	0.18
760	0.18
761	0.19
762	0.17
763	0.17
764	0.15
765	0.12
766	0.12
767	0.07
768	0.06
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.03
775	0.03
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.06
783	0.06
784	0.09
785	0.08
786	0.11
787	0.16
788	0.19
789	0.23
790	0.26
791	0.28
792	0.28
793	0.29
794	0.3
795	0.28
796	0.27
797	0.25
798	0.22
799	0.25
800	0.23
801	0.24
802	0.21
803	0.18
804	0.17
805	0.16
806	0.15
807	0.1
808	0.15
809	0.15
810	0.16
811	0.14
812	0.13
813	0.13
814	0.13
815	0.13
816	0.08
817	0.06
818	0.05
819	0.06
820	0.08
821	0.13
822	0.14
823	0.14
824	0.17
825	0.22
826	0.23
827	0.28
828	0.28
829	0.24
830	0.26
831	0.29
832	0.27
833	0.22
834	0.24
835	0.18
836	0.16
837	0.16
838	0.13
839	0.12
840	0.11
841	0.11
842	0.08
843	0.08
844	0.08
845	0.1
846	0.1
847	0.1
848	0.11
849	0.12
850	0.12
851	0.13
852	0.14
853	0.13
854	0.14
855	0.13
856	0.22
857	0.22
858	0.23
859	0.23
860	0.23
861	0.22
862	0.22
863	0.29
864	0.19
865	0.19
866	0.19
867	0.17
868	0.17
869	0.18
870	0.25
871	0.24
872	0.26
873	0.26
874	0.26
875	0.27
876	0.27
877	0.28
878	0.24
879	0.19
880	0.19
881	0.2
882	0.23
883	0.24
884	0.23
885	0.21
886	0.18
887	0.17
888	0.14
889	0.13
890	0.08
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.07
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.06
901	0.06
902	0.08
903	0.08
904	0.08
905	0.1
906	0.12
907	0.13
908	0.15
909	0.22
910	0.27
911	0.28
912	0.28
913	0.28
914	0.28
915	0.28
916	0.29
917	0.26
918	0.24
919	0.27
920	0.29
921	0.28
922	0.29
923	0.26
924	0.24
925	0.23
926	0.21
927	0.2
928	0.22
929	0.24
930	0.26
931	0.29
932	0.32
933	0.29
934	0.32
935	0.3
936	0.26
937	0.23
938	0.19
939	0.15
940	0.12
941	0.12
942	0.07
943	0.06
944	0.05
945	0.03
946	0.03
947	0.03
948	0.04
949	0.03
950	0.03
951	0.03
952	0.06
953	0.06
954	0.07
955	0.08
956	0.11
957	0.11
958	0.13
959	0.13
960	0.11
961	0.12
962	0.12
963	0.12
964	0.1
965	0.1
966	0.09
967	0.08
968	0.08
969	0.07
970	0.07
971	0.06
972	0.06
973	0.08
974	0.07
975	0.08
976	0.1
977	0.1
978	0.13
979	0.17
980	0.24
981	0.25
982	0.26
983	0.27
984	0.27
985	0.27
986	0.28
987	0.24
988	0.15
989	0.14
990	0.13
991	0.13
992	0.1
993	0.1
994	0.08
995	0.1
996	0.09
997	0.09
998	0.09
999	0.09
1000	0.1
1001	0.11
1002	0.12
1003	0.11
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.18
1007	0.2
1008	0.25
1009	0.34
1010	0.35
1011	0.37
1012	0.4
1013	0.43
1014	0.44
1015	0.5
1016	0.44
1017	0.35
1018	0.33
1019	0.3
1020	0.28
1021	0.24
1022	0.19
1023	0.1
1024	0.1
1025	0.09
1026	0.09
1027	0.11
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.08
1031	0.08
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.09
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.1
1048	0.14
1049	0.14
1050	0.12
1051	0.13
1052	0.16
1053	0.15
1054	0.16
1055	0.16
1056	0.13
1057	0.13
1058	0.14
1059	0.17
1060	0.22
1061	0.28
1062	0.31
1063	0.4
1064	0.46
1065	0.49
1066	0.5
1067	0.51
1068	0.49
1069	0.51
1070	0.48
1071	0.45
1072	0.4
1073	0.38
1074	0.37
1075	0.32
1076	0.25
1077	0.18
1078	0.18
1079	0.13
1080	0.12
1081	0.11
1082	0.13
1083	0.13
1084	0.2
1085	0.21
1086	0.2
1087	0.18
1088	0.2
1089	0.24
1090	0.24
1091	0.26
1092	0.21
1093	0.22
1094	0.23
1095	0.23
1096	0.23
1097	0.2
1098	0.19
1099	0.17
1100	0.15
1101	0.13
1102	0.12
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.09
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.08
1110	0.1
1111	0.11
1112	0.11
1113	0.16
1114	0.22
1115	0.25
1116	0.31
1117	0.35
1118	0.35
1119	0.39
1120	0.45
1121	0.4
1122	0.39
1123	0.38
1124	0.35
1125	0.33
1126	0.32
1127	0.27
1128	0.22
1129	0.23
1130	0.19
1131	0.17
1132	0.15
1133	0.13
1134	0.13
1135	0.14
1136	0.14
1137	0.15
1138	0.18
1139	0.16
1140	0.17
1141	0.24
1142	0.25
1143	0.29
1144	0.3
1145	0.27
1146	0.24
1147	0.25
1148	0.26
1149	0.2
1150	0.19
1151	0.16
1152	0.15
1153	0.16
1154	0.16
1155	0.14
1156	0.11
1157	0.1
1158	0.09
1159	0.09
1160	0.07
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.07
1164	0.08
1165	0.08
1166	0.08
1167	0.09
1168	0.13
1169	0.14
1170	0.18
1171	0.23
1172	0.24
1173	0.25
1174	0.27
1175	0.28
1176	0.28
1177	0.3
1178	0.27
1179	0.21
1180	0.19
1181	0.17
1182	0.17
1183	0.16
1184	0.13
1185	0.1
1186	0.09
1187	0.09
1188	0.09
1189	0.1
1190	0.12
1191	0.12
1192	0.13
1193	0.14
1194	0.16
1195	0.18
1196	0.2
1197	0.21
1198	0.19
1199	0.24
1200	0.22
1201	0.21
1202	0.21
1203	0.25
1204	0.28
1205	0.33
1206	0.39
1207	0.38
1208	0.38
1209	0.39
1210	0.38
1211	0.32
1212	0.28
1213	0.25
1214	0.18
1215	0.15
1216	0.14
1217	0.13
1218	0.13
1219	0.13
1220	0.12
1221	0.08
1222	0.07
1223	0.06
1224	0.09
1225	0.11
1226	0.11
1227	0.12
1228	0.13
1229	0.13
1230	0.13
1231	0.19
1232	0.18
1233	0.21
1234	0.24
1235	0.25
1236	0.26
1237	0.28
1238	0.31
1239	0.27
1240	0.27
1241	0.23
1242	0.22
1243	0.22
1244	0.2
1245	0.18
1246	0.15
1247	0.14
1248	0.16
1249	0.18
1250	0.18
1251	0.17
1252	0.17
1253	0.18
1254	0.2
1255	0.2
1256	0.18
1257	0.16
1258	0.18
1259	0.18
1260	0.19
1261	0.21
1262	0.2
1263	0.2
1264	0.24
1265	0.23
1266	0.25
1267	0.25
1268	0.24
1269	0.2
1270	0.18
1271	0.16
1272	0.12
1273	0.11
1274	0.06
1275	0.05
1276	0.05
1277	0.05
1278	0.05
1279	0.05
1280	0.06
1281	0.06
1282	0.08
1283	0.09
1284	0.1
1285	0.15
1286	0.17
1287	0.18
1288	0.21
1289	0.25
1290	0.27
1291	0.3
1292	0.3
1293	0.27
1294	0.25
1295	0.24
1296	0.21
1297	0.17
1298	0.14
1299	0.13
1300	0.13
1301	0.13
1302	0.13
1303	0.16
1304	0.24
1305	0.23
1306	0.24
1307	0.28

A0A167D8H8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer