FuNGI

A0A161HNU4

Protein Details

Accession

A0A161HNU4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
347-371	SPDRSRSPSYRRRSRSPSRSPDRGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
325-401	RDRSPVRRKRSVSRSDSRSISRSPDRSRSPSYRRRSRSPSRSPDRGEQERARIRSERKKEAERELRKSRMGAERRVK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	slb:AWJ20_3521 -
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MMSRQSVGSFLPKPKNAEKENPRYAEVVSEDEADASVSKSTSISIRNESVAIVKPKTSTTLALQRNSQGALDYSGVIARQGHDSKRIIQTSYSDLIPLRQRAAEINLEKPTQEQVDLTTERTKAALEKIISGKVESSRPQSVVKKANEPTYVRYTPASAPASGSAPRQRIIKMVDRAEDPLAPPKFKHTKVPGGPPSPPPPVLRSPPRKLTAKDQEDWYIPPSVSNWKNPKGFTIALDKRVAADGRGLQEAVVNDNMAKLAEALYAADRSARDEIRQRAAMQQKLAERENAVKEEKLRQLAQQAREERTKISASSSATRPRDEFRDRSPVRRKRSVSRSDSRSISRSPDRSRSPSYRRRSRSPSRSPDRGEQERARIRSERKKEAERELRKSRMGAERRVKMLARENDRDISERVALGVAKPTRATGESQFDARLFSQTSNSGGLGGSGYSEDQVYDKSLFSAQEAVRSIYRPRGNVDADDGGDAELDRINKEKRFQGLGALKESEGGSEGPVEFVKDTDDDPFGVNQMVDQVKKNTKYGLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.65
3	0.65
4	0.69
5	0.71
6	0.73
7	0.78
8	0.75
9	0.69
10	0.61
11	0.55
12	0.49
13	0.41
14	0.34
15	0.26
16	0.24
17	0.22
18	0.2
19	0.2
20	0.15
21	0.13
22	0.1
23	0.1
24	0.08
25	0.08
26	0.08
27	0.1
28	0.13
29	0.18
30	0.22
31	0.26
32	0.28
33	0.29
34	0.29
35	0.29
36	0.28
37	0.3
38	0.31
39	0.28
40	0.27
41	0.27
42	0.28
43	0.31
44	0.29
45	0.25
46	0.27
47	0.35
48	0.4
49	0.42
50	0.44
51	0.43
52	0.43
53	0.4
54	0.34
55	0.25
56	0.2
57	0.19
58	0.17
59	0.14
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.11
64	0.11
65	0.09
66	0.15
67	0.19
68	0.21
69	0.27
70	0.3
71	0.35
72	0.43
73	0.44
74	0.39
75	0.36
76	0.37
77	0.37
78	0.37
79	0.31
80	0.24
81	0.21
82	0.25
83	0.29
84	0.28
85	0.24
86	0.22
87	0.23
88	0.24
89	0.28
90	0.31
91	0.28
92	0.3
93	0.32
94	0.32
95	0.31
96	0.3
97	0.29
98	0.22
99	0.2
100	0.15
101	0.14
102	0.2
103	0.21
104	0.23
105	0.24
106	0.23
107	0.23
108	0.23
109	0.21
110	0.17
111	0.19
112	0.22
113	0.18
114	0.23
115	0.26
116	0.28
117	0.28
118	0.26
119	0.24
120	0.22
121	0.25
122	0.23
123	0.26
124	0.27
125	0.28
126	0.34
127	0.37
128	0.42
129	0.47
130	0.47
131	0.5
132	0.5
133	0.54
134	0.54
135	0.51
136	0.49
137	0.48
138	0.46
139	0.39
140	0.36
141	0.32
142	0.28
143	0.33
144	0.29
145	0.21
146	0.21
147	0.21
148	0.22
149	0.21
150	0.23
151	0.21
152	0.21
153	0.23
154	0.24
155	0.23
156	0.25
157	0.29
158	0.34
159	0.35
160	0.36
161	0.37
162	0.36
163	0.37
164	0.34
165	0.3
166	0.23
167	0.25
168	0.24
169	0.22
170	0.21
171	0.27
172	0.34
173	0.34
174	0.42
175	0.4
176	0.48
177	0.52
178	0.62
179	0.61
180	0.58
181	0.59
182	0.55
183	0.54
184	0.48
185	0.45
186	0.37
187	0.34
188	0.35
189	0.39
190	0.44
191	0.48
192	0.5
193	0.55
194	0.59
195	0.6
196	0.57
197	0.6
198	0.61
199	0.58
200	0.54
201	0.5
202	0.47
203	0.43
204	0.42
205	0.33
206	0.25
207	0.19
208	0.16
209	0.15
210	0.2
211	0.21
212	0.28
213	0.33
214	0.37
215	0.4
216	0.4
217	0.41
218	0.37
219	0.35
220	0.29
221	0.34
222	0.3
223	0.31
224	0.32
225	0.29
226	0.25
227	0.26
228	0.24
229	0.14
230	0.13
231	0.12
232	0.13
233	0.13
234	0.12
235	0.1
236	0.12
237	0.12
238	0.11
239	0.09
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.05
245	0.05
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.05
256	0.07
257	0.1
258	0.1
259	0.11
260	0.17
261	0.21
262	0.24
263	0.25
264	0.24
265	0.29
266	0.34
267	0.34
268	0.29
269	0.3
270	0.28
271	0.3
272	0.3
273	0.24
274	0.19
275	0.21
276	0.23
277	0.22
278	0.21
279	0.18
280	0.19
281	0.24
282	0.26
283	0.26
284	0.24
285	0.23
286	0.3
287	0.35
288	0.37
289	0.38
290	0.39
291	0.39
292	0.41
293	0.41
294	0.33
295	0.31
296	0.27
297	0.21
298	0.19
299	0.19
300	0.19
301	0.22
302	0.25
303	0.3
304	0.31
305	0.32
306	0.31
307	0.3
308	0.36
309	0.37
310	0.37
311	0.33
312	0.43
313	0.43
314	0.51
315	0.59
316	0.6
317	0.63
318	0.68
319	0.68
320	0.66
321	0.75
322	0.75
323	0.73
324	0.74
325	0.73
326	0.69
327	0.68
328	0.61
329	0.55
330	0.46
331	0.44
332	0.42
333	0.43
334	0.43
335	0.48
336	0.5
337	0.53
338	0.58
339	0.61
340	0.64
341	0.66
342	0.71
343	0.73
344	0.74
345	0.76
346	0.79
347	0.8
348	0.81
349	0.82
350	0.83
351	0.81
352	0.83
353	0.79
354	0.78
355	0.76
356	0.71
357	0.68
358	0.61
359	0.62
360	0.62
361	0.59
362	0.54
363	0.52
364	0.54
365	0.56
366	0.6
367	0.61
368	0.6
369	0.67
370	0.69
371	0.73
372	0.76
373	0.75
374	0.76
375	0.74
376	0.73
377	0.66
378	0.61
379	0.57
380	0.56
381	0.53
382	0.53
383	0.54
384	0.54
385	0.55
386	0.58
387	0.52
388	0.46
389	0.5
390	0.48
391	0.47
392	0.46
393	0.47
394	0.47
395	0.47
396	0.46
397	0.38
398	0.32
399	0.26
400	0.21
401	0.18
402	0.16
403	0.14
404	0.12
405	0.18
406	0.16
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.17
411	0.19
412	0.21
413	0.19
414	0.25
415	0.25
416	0.27
417	0.27
418	0.25
419	0.26
420	0.24
421	0.21
422	0.16
423	0.15
424	0.17
425	0.17
426	0.19
427	0.18
428	0.17
429	0.15
430	0.13
431	0.13
432	0.1
433	0.09
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.07
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.21
450	0.18
451	0.23
452	0.25
453	0.26
454	0.25
455	0.27
456	0.29
457	0.3
458	0.34
459	0.3
460	0.32
461	0.37
462	0.37
463	0.37
464	0.39
465	0.33
466	0.3
467	0.29
468	0.25
469	0.18
470	0.16
471	0.14
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.1
476	0.15
477	0.2
478	0.24
479	0.29
480	0.34
481	0.37
482	0.42
483	0.42
484	0.46
485	0.48
486	0.49
487	0.49
488	0.45
489	0.39
490	0.35
491	0.35
492	0.25
493	0.2
494	0.16
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.13
504	0.12
505	0.13
506	0.14
507	0.16
508	0.15
509	0.17
510	0.17
511	0.16
512	0.16
513	0.15
514	0.12
515	0.17
516	0.2
517	0.2
518	0.24
519	0.31
520	0.38
521	0.42
522	0.44

A0A161HNU4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer