FuNGI

A0A167D3X1

Protein Details

Accession

A0A167D3X1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-33	SSSSNPLISRVKRRPPPPNPLRRPNANPLVKR	Hydrophilic
496-518	PPIPLPRKVTAKKKYKNLPPGMV	Hydrophilic
620-645	KQLLGILKPKLRRHPQNHERLKQLLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-33	VKRRPPPPNPLRRPNANPLVKR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	slb:AWJ20_695 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSSSNPLISRVKRRPPPPNPLRRPNANPLVKREPRDSANGVKPAVQVKREKDDTKPIIASASSGSGVKSSSSSSSSTSSSATESYTDFTLRSCSAEEVKVARHHIIKFHSRTPVNPATDFTPPVRFHRKDPRNLQFQLTLSELEQRQKDIEQSNAQLEQSLKDQEAKAKEAAAASLAAGVAPEPAPKADMSVVAPDGGARRSARPFEKKTRQVILGDEQSRKLRYEEYYPWIMEDFDGKNTWVGNYEAAQSDSYVLFVFDKDGFKMVPAEKWYKMTPRNKYTTLTVEEAEQRMEKKSNVPRWIMKHIAEEQQTQAQDRSYNARRRFRTVDGATSGTSPTRGRDDDHDEIDFDEEFADDEEAPIMDGNEEDVKEVEEKIKREQRNANTIGVAPDDDNEDLFNNPDEPKMGKEGRKLKKYLRSLEKNAYYESDDEENPYASSSEDTDDDEISSATTPAVKEEPDAASSAANGNINGVTVKREDSANPSSRPSSQSPPPIPLPRKVTAKKKYKNLPPGMVVLHLSPSSLSNFPPDLWNPNAKRRREVSPDSNSSETGGEIKKIKLRSPSPPQPSAVATSSSVPSASVSPAATTTTSDPGNSDDLLTADDVRSVITANRVNAKQLLGILKPKLRRHPQNHERLKQLLREMAKIHNGVLVLKGSSN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.82
3	0.83
4	0.87
5	0.87
6	0.89
7	0.89
8	0.9
9	0.89
10	0.88
11	0.86
12	0.85
13	0.84
14	0.82
15	0.78
16	0.76
17	0.78
18	0.76
19	0.73
20	0.68
21	0.64
22	0.58
23	0.6
24	0.57
25	0.55
26	0.56
27	0.56
28	0.52
29	0.48
30	0.47
31	0.47
32	0.48
33	0.45
34	0.44
35	0.46
36	0.54
37	0.59
38	0.59
39	0.57
40	0.62
41	0.61
42	0.6
43	0.55
44	0.46
45	0.41
46	0.38
47	0.33
48	0.23
49	0.2
50	0.14
51	0.13
52	0.13
53	0.11
54	0.12
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.13
59	0.15
60	0.16
61	0.18
62	0.2
63	0.21
64	0.21
65	0.2
66	0.19
67	0.18
68	0.18
69	0.16
70	0.14
71	0.14
72	0.15
73	0.15
74	0.14
75	0.13
76	0.12
77	0.15
78	0.15
79	0.15
80	0.15
81	0.16
82	0.19
83	0.21
84	0.23
85	0.22
86	0.26
87	0.29
88	0.3
89	0.31
90	0.33
91	0.34
92	0.36
93	0.41
94	0.45
95	0.46
96	0.49
97	0.54
98	0.5
99	0.5
100	0.53
101	0.55
102	0.49
103	0.45
104	0.41
105	0.36
106	0.37
107	0.38
108	0.31
109	0.31
110	0.29
111	0.35
112	0.44
113	0.42
114	0.47
115	0.56
116	0.62
117	0.64
118	0.73
119	0.75
120	0.74
121	0.74
122	0.7
123	0.64
124	0.56
125	0.49
126	0.4
127	0.32
128	0.23
129	0.27
130	0.25
131	0.25
132	0.25
133	0.23
134	0.23
135	0.23
136	0.28
137	0.25
138	0.29
139	0.28
140	0.3
141	0.32
142	0.32
143	0.3
144	0.27
145	0.25
146	0.21
147	0.19
148	0.18
149	0.16
150	0.17
151	0.19
152	0.22
153	0.25
154	0.27
155	0.25
156	0.24
157	0.24
158	0.21
159	0.2
160	0.15
161	0.11
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.1
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.11
183	0.1
184	0.11
185	0.1
186	0.12
187	0.11
188	0.14
189	0.17
190	0.23
191	0.3
192	0.38
193	0.45
194	0.53
195	0.62
196	0.66
197	0.7
198	0.69
199	0.65
200	0.57
201	0.54
202	0.49
203	0.47
204	0.44
205	0.39
206	0.36
207	0.36
208	0.36
209	0.33
210	0.28
211	0.23
212	0.21
213	0.26
214	0.29
215	0.31
216	0.33
217	0.32
218	0.31
219	0.28
220	0.26
221	0.19
222	0.18
223	0.14
224	0.12
225	0.12
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.11
240	0.09
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.14
254	0.13
255	0.14
256	0.17
257	0.21
258	0.21
259	0.24
260	0.25
261	0.28
262	0.36
263	0.41
264	0.46
265	0.5
266	0.54
267	0.54
268	0.54
269	0.51
270	0.47
271	0.43
272	0.36
273	0.28
274	0.25
275	0.25
276	0.23
277	0.21
278	0.16
279	0.13
280	0.14
281	0.15
282	0.14
283	0.19
284	0.27
285	0.34
286	0.38
287	0.41
288	0.44
289	0.47
290	0.52
291	0.48
292	0.4
293	0.37
294	0.35
295	0.37
296	0.33
297	0.3
298	0.25
299	0.25
300	0.24
301	0.21
302	0.19
303	0.14
304	0.13
305	0.13
306	0.19
307	0.24
308	0.32
309	0.38
310	0.46
311	0.47
312	0.52
313	0.56
314	0.51
315	0.53
316	0.46
317	0.43
318	0.37
319	0.36
320	0.3
321	0.26
322	0.23
323	0.14
324	0.14
325	0.1
326	0.09
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.17
331	0.24
332	0.26
333	0.27
334	0.26
335	0.23
336	0.22
337	0.22
338	0.17
339	0.1
340	0.07
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.11
363	0.14
364	0.16
365	0.23
366	0.31
367	0.32
368	0.38
369	0.46
370	0.47
371	0.52
372	0.54
373	0.47
374	0.4
375	0.39
376	0.33
377	0.25
378	0.2
379	0.11
380	0.09
381	0.09
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.11
395	0.16
396	0.21
397	0.22
398	0.3
399	0.4
400	0.48
401	0.53
402	0.56
403	0.57
404	0.62
405	0.66
406	0.68
407	0.68
408	0.68
409	0.67
410	0.72
411	0.71
412	0.63
413	0.56
414	0.48
415	0.39
416	0.32
417	0.28
418	0.22
419	0.16
420	0.16
421	0.16
422	0.15
423	0.13
424	0.13
425	0.11
426	0.08
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.05
441	0.07
442	0.06
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.12
448	0.13
449	0.13
450	0.14
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.09
466	0.1
467	0.11
468	0.12
469	0.18
470	0.26
471	0.3
472	0.31
473	0.33
474	0.34
475	0.36
476	0.39
477	0.37
478	0.36
479	0.36
480	0.44
481	0.44
482	0.46
483	0.51
484	0.55
485	0.55
486	0.55
487	0.55
488	0.52
489	0.59
490	0.62
491	0.65
492	0.66
493	0.73
494	0.75
495	0.78
496	0.81
497	0.81
498	0.84
499	0.82
500	0.77
501	0.69
502	0.65
503	0.56
504	0.48
505	0.39
506	0.29
507	0.23
508	0.17
509	0.14
510	0.1
511	0.11
512	0.12
513	0.13
514	0.13
515	0.14
516	0.16
517	0.16
518	0.2
519	0.21
520	0.23
521	0.26
522	0.35
523	0.36
524	0.45
525	0.53
526	0.51
527	0.57
528	0.56
529	0.6
530	0.6
531	0.64
532	0.63
533	0.65
534	0.69
535	0.67
536	0.64
537	0.56
538	0.48
539	0.39
540	0.3
541	0.25
542	0.2
543	0.18
544	0.19
545	0.22
546	0.26
547	0.28
548	0.32
549	0.37
550	0.41
551	0.47
552	0.55
553	0.62
554	0.65
555	0.67
556	0.64
557	0.58
558	0.55
559	0.5
560	0.41
561	0.33
562	0.27
563	0.25
564	0.24
565	0.21
566	0.19
567	0.14
568	0.13
569	0.12
570	0.12
571	0.12
572	0.11
573	0.12
574	0.12
575	0.14
576	0.13
577	0.14
578	0.15
579	0.17
580	0.17
581	0.16
582	0.17
583	0.18
584	0.2
585	0.18
586	0.16
587	0.13
588	0.13
589	0.14
590	0.13
591	0.12
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.1
599	0.15
600	0.19
601	0.21
602	0.29
603	0.3
604	0.33
605	0.34
606	0.34
607	0.29
608	0.29
609	0.31
610	0.26
611	0.32
612	0.35
613	0.39
614	0.46
615	0.51
616	0.58
617	0.64
618	0.71
619	0.75
620	0.8
621	0.85
622	0.88
623	0.91
624	0.88
625	0.84
626	0.8
627	0.76
628	0.71
629	0.66
630	0.63
631	0.55
632	0.53
633	0.49
634	0.48
635	0.49
636	0.44
637	0.38
638	0.33
639	0.31
640	0.26
641	0.26
642	0.21

A0A167D3X1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer