FuNGI

A0A1V1SWC4

Protein Details

Accession

A0A1V1SWC4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
238-260	AAAATHRHHHHQRQHQQHPHDPL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
555-558	KRRE
1043-1056	RRPVLGRGGAKRGG

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MANPVGEDSWLAYIDEQRRHASDLEARVKVVELFKAALGDEPASLRLWLTYCEYFWSLFTECQSPSPSSSSSSPSSSLSSSSWTEEERQLGRDLFSFDAALSLWSDGYNATKFRIADSHLFWDRWVAIELEQLARTRTPSGVKRISHLFRDRLQVPHATWDQTSQMFSEFLTTYNNAAYEHEFQEVTRTARDAKTAYELRESHELDLARAQRATDREAEKAKMRQYLDWEMAQTAQAAAAATHRHHHHQRQHQQHPHDPLAVPLGVGLYARALTGVFAFDDDIWNNCAVYLSSLHRNTKTHPSLYTPLLPNMLDFFQRATKHCPWSGPLWSRYILTAEDAGWSFHNVESIKHAATNTKALDSNGMTGVLDMYTAWCGFLKRTAMDPNAPEDAADVAEVGLLAALEDVELWGKRLYKDAYQGDPNFRLERILIQYLTEVKGDTEAARSHWDRLSHHSLLANSYDFWLNYYLWEMVVYASKPKAPSPTPPTPSTGSKSTRAPTVATGVLQRALMERVLDWPERIMEVYLQHCNDYEQPDTLHYALDTVHKTRRVVAKRREREKAAAAAANHATQTQIQTEAEQAQDQAAATSTQDTIAPGSPSSGKRKRDETAEDAGEAASKKAKSVEASVDDAASQEAKLKRDRENTSVMVTNLPPDVTQTALRRYFKEYGHINSLILRQEDDNTSSSALIEFRSPEDADSALLRDQKYFNQSQLSVKPGTHLTVFVSNYPPTADEAYIRRLFAHCGEIFNIRWPSLKYNAHRRFCYISFRDASAAYKATLMDGTMVEDQYKLQSKFSNPSHKKDREGAVAEGRELRVKGVHPATRENDLRSVFGKYGKVITVRLLTNLSGQHVGTAFIVFETKEQAQKALELDKTKFKSQLLEVELSKETNFRPTATIRGDGSSRAPSLAPSGDGDVAMPDDPGDMHSEEQKPTPAEIQARTMAIMNIPDTVNDARIRALTEKFGSIVKIVLRPDHAGAIVEFGEASTVGRAALGLEGFEIAPHHKLRTGSVKELFKEKVEPQQKDTLKAPKAAWMPPPPTVRRPVLGRGGAKRGGLGFVAAAKKDKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.3
3	0.32
4	0.34
5	0.35
6	0.38
7	0.38
8	0.37
9	0.37
10	0.42
11	0.46
12	0.44
13	0.42
14	0.4
15	0.39
16	0.37
17	0.32
18	0.24
19	0.18
20	0.18
21	0.19
22	0.19
23	0.18
24	0.17
25	0.16
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.14
32	0.12
33	0.12
34	0.12
35	0.13
36	0.18
37	0.18
38	0.18
39	0.22
40	0.24
41	0.22
42	0.22
43	0.24
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.23
48	0.22
49	0.25
50	0.28
51	0.26
52	0.26
53	0.29
54	0.27
55	0.28
56	0.3
57	0.31
58	0.31
59	0.32
60	0.3
61	0.28
62	0.3
63	0.26
64	0.26
65	0.22
66	0.23
67	0.22
68	0.23
69	0.23
70	0.22
71	0.25
72	0.26
73	0.31
74	0.29
75	0.3
76	0.31
77	0.3
78	0.29
79	0.28
80	0.27
81	0.23
82	0.21
83	0.19
84	0.15
85	0.14
86	0.13
87	0.11
88	0.09
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.11
95	0.13
96	0.14
97	0.15
98	0.19
99	0.19
100	0.21
101	0.24
102	0.25
103	0.28
104	0.31
105	0.37
106	0.38
107	0.38
108	0.35
109	0.35
110	0.31
111	0.27
112	0.24
113	0.17
114	0.13
115	0.16
116	0.18
117	0.17
118	0.19
119	0.18
120	0.18
121	0.18
122	0.19
123	0.18
124	0.19
125	0.24
126	0.29
127	0.38
128	0.44
129	0.44
130	0.47
131	0.54
132	0.56
133	0.57
134	0.58
135	0.54
136	0.51
137	0.57
138	0.56
139	0.5
140	0.49
141	0.45
142	0.38
143	0.41
144	0.39
145	0.34
146	0.31
147	0.3
148	0.3
149	0.26
150	0.26
151	0.18
152	0.17
153	0.15
154	0.15
155	0.16
156	0.13
157	0.12
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.16
163	0.13
164	0.14
165	0.17
166	0.18
167	0.19
168	0.2
169	0.19
170	0.18
171	0.23
172	0.24
173	0.22
174	0.19
175	0.19
176	0.21
177	0.23
178	0.26
179	0.21
180	0.2
181	0.27
182	0.3
183	0.3
184	0.34
185	0.33
186	0.34
187	0.41
188	0.4
189	0.33
190	0.33
191	0.31
192	0.25
193	0.3
194	0.29
195	0.23
196	0.22
197	0.21
198	0.21
199	0.23
200	0.25
201	0.27
202	0.27
203	0.3
204	0.33
205	0.37
206	0.38
207	0.42
208	0.43
209	0.42
210	0.41
211	0.39
212	0.42
213	0.45
214	0.42
215	0.38
216	0.35
217	0.29
218	0.27
219	0.25
220	0.18
221	0.12
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.09
228	0.1
229	0.15
230	0.17
231	0.24
232	0.32
233	0.41
234	0.49
235	0.58
236	0.67
237	0.73
238	0.81
239	0.82
240	0.82
241	0.8
242	0.78
243	0.7
244	0.64
245	0.53
246	0.44
247	0.39
248	0.31
249	0.23
250	0.16
251	0.13
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.12
279	0.2
280	0.24
281	0.28
282	0.3
283	0.32
284	0.35
285	0.43
286	0.44
287	0.4
288	0.37
289	0.39
290	0.41
291	0.43
292	0.45
293	0.37
294	0.33
295	0.32
296	0.3
297	0.24
298	0.22
299	0.2
300	0.14
301	0.12
302	0.12
303	0.15
304	0.18
305	0.2
306	0.26
307	0.31
308	0.36
309	0.37
310	0.37
311	0.35
312	0.38
313	0.44
314	0.43
315	0.39
316	0.36
317	0.35
318	0.34
319	0.32
320	0.28
321	0.2
322	0.15
323	0.13
324	0.1
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.15
336	0.16
337	0.16
338	0.16
339	0.16
340	0.15
341	0.17
342	0.21
343	0.18
344	0.18
345	0.19
346	0.18
347	0.2
348	0.18
349	0.18
350	0.14
351	0.13
352	0.11
353	0.09
354	0.1
355	0.06
356	0.06
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.1
366	0.12
367	0.12
368	0.15
369	0.2
370	0.22
371	0.24
372	0.25
373	0.25
374	0.24
375	0.23
376	0.2
377	0.15
378	0.14
379	0.1
380	0.09
381	0.06
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.02
388	0.02
389	0.02
390	0.02
391	0.02
392	0.02
393	0.02
394	0.03
395	0.03
396	0.05
397	0.06
398	0.08
399	0.09
400	0.13
401	0.15
402	0.17
403	0.24
404	0.27
405	0.3
406	0.35
407	0.37
408	0.37
409	0.37
410	0.37
411	0.3
412	0.27
413	0.23
414	0.17
415	0.18
416	0.18
417	0.17
418	0.15
419	0.14
420	0.15
421	0.16
422	0.17
423	0.14
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.09
432	0.14
433	0.15
434	0.17
435	0.18
436	0.2
437	0.2
438	0.27
439	0.33
440	0.29
441	0.29
442	0.29
443	0.27
444	0.26
445	0.26
446	0.19
447	0.12
448	0.12
449	0.11
450	0.09
451	0.1
452	0.1
453	0.09
454	0.08
455	0.1
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.06
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.1
466	0.11
467	0.12
468	0.17
469	0.17
470	0.24
471	0.31
472	0.39
473	0.42
474	0.43
475	0.45
476	0.43
477	0.44
478	0.4
479	0.38
480	0.33
481	0.31
482	0.33
483	0.31
484	0.31
485	0.29
486	0.26
487	0.2
488	0.2
489	0.17
490	0.15
491	0.14
492	0.12
493	0.12
494	0.11
495	0.1
496	0.08
497	0.08
498	0.07
499	0.06
500	0.06
501	0.08
502	0.11
503	0.11
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.08
510	0.06
511	0.08
512	0.1
513	0.12
514	0.12
515	0.12
516	0.12
517	0.13
518	0.14
519	0.15
520	0.13
521	0.11
522	0.11
523	0.12
524	0.13
525	0.13
526	0.11
527	0.08
528	0.07
529	0.07
530	0.1
531	0.11
532	0.12
533	0.15
534	0.17
535	0.18
536	0.22
537	0.3
538	0.35
539	0.43
540	0.51
541	0.58
542	0.65
543	0.72
544	0.73
545	0.68
546	0.63
547	0.57
548	0.52
549	0.43
550	0.36
551	0.3
552	0.27
553	0.24
554	0.21
555	0.17
556	0.13
557	0.1
558	0.08
559	0.09
560	0.07
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.08
583	0.08
584	0.07
585	0.08
586	0.12
587	0.14
588	0.24
589	0.3
590	0.33
591	0.36
592	0.41
593	0.43
594	0.45
595	0.48
596	0.44
597	0.43
598	0.38
599	0.35
600	0.3
601	0.28
602	0.23
603	0.17
604	0.13
605	0.1
606	0.09
607	0.09
608	0.11
609	0.12
610	0.12
611	0.15
612	0.19
613	0.18
614	0.21
615	0.21
616	0.19
617	0.18
618	0.16
619	0.14
620	0.1
621	0.07
622	0.1
623	0.12
624	0.15
625	0.2
626	0.23
627	0.29
628	0.38
629	0.42
630	0.4
631	0.43
632	0.42
633	0.4
634	0.39
635	0.33
636	0.26
637	0.22
638	0.19
639	0.14
640	0.13
641	0.1
642	0.09
643	0.09
644	0.09
645	0.12
646	0.13
647	0.19
648	0.25
649	0.27
650	0.28
651	0.33
652	0.36
653	0.33
654	0.38
655	0.35
656	0.33
657	0.37
658	0.36
659	0.31
660	0.28
661	0.3
662	0.25
663	0.22
664	0.18
665	0.13
666	0.15
667	0.16
668	0.16
669	0.14
670	0.13
671	0.13
672	0.12
673	0.12
674	0.1
675	0.1
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.11
681	0.11
682	0.1
683	0.11
684	0.11
685	0.1
686	0.1
687	0.11
688	0.1
689	0.13
690	0.13
691	0.14
692	0.15
693	0.18
694	0.23
695	0.23
696	0.23
697	0.24
698	0.26
699	0.29
700	0.3
701	0.31
702	0.27
703	0.25
704	0.25
705	0.22
706	0.22
707	0.17
708	0.15
709	0.13
710	0.17
711	0.18
712	0.17
713	0.19
714	0.18
715	0.17
716	0.17
717	0.16
718	0.13
719	0.14
720	0.13
721	0.12
722	0.15
723	0.21
724	0.22
725	0.21
726	0.21
727	0.2
728	0.21
729	0.2
730	0.24
731	0.18
732	0.18
733	0.19
734	0.21
735	0.21
736	0.26
737	0.25
738	0.19
739	0.21
740	0.21
741	0.24
742	0.29
743	0.35
744	0.36
745	0.46
746	0.55
747	0.59
748	0.59
749	0.59
750	0.57
751	0.52
752	0.56
753	0.47
754	0.44
755	0.4
756	0.4
757	0.37
758	0.32
759	0.31
760	0.24
761	0.22
762	0.16
763	0.15
764	0.13
765	0.12
766	0.12
767	0.1
768	0.08
769	0.07
770	0.09
771	0.1
772	0.1
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.13
777	0.2
778	0.18
779	0.19
780	0.23
781	0.26
782	0.34
783	0.42
784	0.49
785	0.47
786	0.54
787	0.63
788	0.64
789	0.65
790	0.64
791	0.61
792	0.58
793	0.57
794	0.52
795	0.48
796	0.44
797	0.41
798	0.36
799	0.31
800	0.26
801	0.22
802	0.19
803	0.15
804	0.15
805	0.21
806	0.26
807	0.28
808	0.28
809	0.35
810	0.37
811	0.42
812	0.44
813	0.39
814	0.37
815	0.35
816	0.35
817	0.3
818	0.3
819	0.24
820	0.25
821	0.24
822	0.2
823	0.22
824	0.22
825	0.23
826	0.2
827	0.22
828	0.23
829	0.22
830	0.23
831	0.21
832	0.19
833	0.21
834	0.21
835	0.2
836	0.16
837	0.16
838	0.15
839	0.14
840	0.15
841	0.12
842	0.11
843	0.09
844	0.07
845	0.08
846	0.07
847	0.07
848	0.11
849	0.12
850	0.15
851	0.16
852	0.18
853	0.18
854	0.2
855	0.22
856	0.23
857	0.25
858	0.25
859	0.28
860	0.35
861	0.39
862	0.4
863	0.41
864	0.36
865	0.38
866	0.37
867	0.42
868	0.38
869	0.38
870	0.35
871	0.36
872	0.36
873	0.31
874	0.28
875	0.23
876	0.19
877	0.21
878	0.22
879	0.19
880	0.22
881	0.23
882	0.3
883	0.31
884	0.35
885	0.29
886	0.3
887	0.3
888	0.28
889	0.29
890	0.25
891	0.23
892	0.2
893	0.19
894	0.17
895	0.19
896	0.19
897	0.16
898	0.14
899	0.16
900	0.15
901	0.15
902	0.14
903	0.11
904	0.11
905	0.1
906	0.09
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.07
911	0.1
912	0.09
913	0.11
914	0.17
915	0.2
916	0.22
917	0.24
918	0.27
919	0.26
920	0.27
921	0.28
922	0.27
923	0.29
924	0.3
925	0.32
926	0.31
927	0.3
928	0.28
929	0.26
930	0.22
931	0.18
932	0.17
933	0.13
934	0.13
935	0.12
936	0.12
937	0.14
938	0.15
939	0.17
940	0.17
941	0.17
942	0.15
943	0.16
944	0.19
945	0.2
946	0.21
947	0.22
948	0.23
949	0.24
950	0.24
951	0.24
952	0.22
953	0.19
954	0.2
955	0.18
956	0.2
957	0.2
958	0.22
959	0.24
960	0.26
961	0.26
962	0.25
963	0.23
964	0.2
965	0.18
966	0.18
967	0.15
968	0.12
969	0.1
970	0.08
971	0.08
972	0.07
973	0.07
974	0.06
975	0.05
976	0.05
977	0.05
978	0.06
979	0.06
980	0.07
981	0.07
982	0.06
983	0.06
984	0.07
985	0.07
986	0.08
987	0.08
988	0.09
989	0.13
990	0.15
991	0.16
992	0.19
993	0.21
994	0.26
995	0.36
996	0.4
997	0.44
998	0.5
999	0.54
1000	0.53
1001	0.59
1002	0.55
1003	0.47
1004	0.47
1005	0.43
1006	0.45
1007	0.49
1008	0.51
1009	0.5
1010	0.58
1011	0.58
1012	0.57
1013	0.6
1014	0.6
1015	0.54
1016	0.56
1017	0.51
1018	0.49
1019	0.51
1020	0.5
1021	0.52
1022	0.51
1023	0.5
1024	0.52
1025	0.6
1026	0.58
1027	0.59
1028	0.62
1029	0.58
1030	0.56
1031	0.57
1032	0.57
1033	0.58
1034	0.6
1035	0.61
1036	0.59
1037	0.62
1038	0.59
1039	0.54
1040	0.48
1041	0.4
1042	0.34
1043	0.27
1044	0.21
1045	0.15
1046	0.17
1047	0.21
1048	0.2

A0A1V1SWC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer