Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1T385

Protein Details
Accession A0A1V1T385    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-39STQRRVVGTRRRTQRRSAGRPVATHydrophilic
187-212KTAAAARGRKRRPARSSRPAKKTAEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-208PKSAANDKKKDAGKTAAAARGRKRRPARSSRPAKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 15, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGSGKLDQPLDEIISTQRRVVGTRRRTQRRSAGRPVATAPVGGVQKTSRQPRNAATKQAPAKAAGGNGESKVVVSNLPKDVNEAQIKEYFTTSVGPIKRVEVSYGPGGVSRGIATVTFHKPDGASKAFNVLNGILVDGRPIKIEIVVSAAKAAEIIPAPKTLTERITQPKAQPKSAANDKKKDAGKTAAAARGRKRRPARSSRPAKKTAEELDSEMADYFNSGDQNENTNGVAANNGDAAMDDEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.24
3 0.25
4 0.23
5 0.25
6 0.24
7 0.27
8 0.35
9 0.39
10 0.43
11 0.52
12 0.62
13 0.69
14 0.72
15 0.78
16 0.8
17 0.81
18 0.8
19 0.81
20 0.8
21 0.73
22 0.71
23 0.64
24 0.59
25 0.48
26 0.38
27 0.28
28 0.23
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.14
33 0.2
34 0.27
35 0.36
36 0.38
37 0.41
38 0.45
39 0.51
40 0.61
41 0.6
42 0.61
43 0.56
44 0.58
45 0.59
46 0.59
47 0.53
48 0.43
49 0.4
50 0.33
51 0.29
52 0.22
53 0.19
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.13
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.19
68 0.2
69 0.25
70 0.26
71 0.24
72 0.23
73 0.25
74 0.26
75 0.23
76 0.22
77 0.16
78 0.13
79 0.14
80 0.12
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.18
87 0.17
88 0.18
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.18
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.17
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.2
153 0.26
154 0.31
155 0.33
156 0.37
157 0.45
158 0.47
159 0.48
160 0.46
161 0.42
162 0.45
163 0.52
164 0.57
165 0.54
166 0.57
167 0.57
168 0.61
169 0.63
170 0.57
171 0.51
172 0.46
173 0.41
174 0.39
175 0.41
176 0.39
177 0.39
178 0.41
179 0.45
180 0.5
181 0.52
182 0.57
183 0.61
184 0.66
185 0.72
186 0.78
187 0.8
188 0.81
189 0.88
190 0.89
191 0.89
192 0.86
193 0.81
194 0.73
195 0.7
196 0.65
197 0.59
198 0.5
199 0.45
200 0.39
201 0.35
202 0.32
203 0.25
204 0.18
205 0.13
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.12
212 0.14
213 0.18
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.18
218 0.18
219 0.15
220 0.15
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.1