Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1T302

Protein Details
Accession A0A1V1T302    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28TAVPPPPPPKIKRPPIVQANGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-415PKPKTRKR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10.5, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPIVVTAVPPPPPPKIKRPPIVQANGASSQQSSSPSISAKKPPLITATKNNQPPNPANTSVNGAPGGSTRATAPRSRRDTLNTSGARGQKNSASLRSAGLSQDKASTCLFEPRPEVEDESDYILKKFAGQPPSLIVHLHPNHFRFDQQDGIFPYKSPMGVFLGHIRTRTVPHELLADLTDAGVPFYEGCLIVQVHDYKSVAQAKEVARPASKSNSSTPFSIHNSNPYITPSPYAPYPKESINSAERLASSRSNESTAVDGDPDNKENGTAPNSSANARNSREPSKTANVYTVVLHPTPESLYRDLMIKATTPKGFIDPKTGTDTSTMPPPTPLSAVPPTPSAGSMPPPAKRQKREKMEISGSDLYAVEAQILLATTPPLHLEVPRSKEDAISLIGKLSDSKHSEAPPKPKTRKRTVAERAADKALAEEQEKYMLTYDERLSSAISSSQGAADGADGNNTSGTSSFEPRFERFNILTVIKKEHAEKKEQERIRQAENERKIAVQKQQQAEQQLLQQRQHAAELESKRREETARNAANMRMPQDNTAQRQMLAQQRAQAQAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQSQAQAQVQTAAAVAAHSPQNPQMNQPPQASHSHPVQNGAIPNGLPNGMPTAQAQRFAQGVSQPPVSSPIARQNTPQNMSSPMVPNVSMSLPMSQTNSGMGASPPRPSSVVQGQGPISAPMAVSMSARGSQQSHPSGTPRMPSATPQIPHGTPINRPVPTPRMTQASPPPGMVAHGSPMGQNMHMNHQNMGQPMTQLMAAQIAAQQQRQRVVQQQQSQQLHVMQANMMTQNPQMQQQQQHLYQQQQQQLMRQQMMQQFGNGQNSGMLSPAQQVQLRIQAAQQAQMQGQMHGQMQGSVPGQMPGQQMGSQNFINMNGMNPTQFAMMQQQLQQRGQARGPINMQQINMQQVRQRQSALYQQSLPGLIQQFGGEANIPPEVMEKFKSSCLNRAQQDIARLRHMQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHMAQHNDMGNMGMMQQGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.52
3 0.6
4 0.68
5 0.74
6 0.78
7 0.81
8 0.82
9 0.82
10 0.77
11 0.7
12 0.66
13 0.6
14 0.52
15 0.43
16 0.33
17 0.28
18 0.24
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.2
23 0.23
24 0.28
25 0.33
26 0.39
27 0.43
28 0.47
29 0.47
30 0.48
31 0.52
32 0.54
33 0.55
34 0.56
35 0.58
36 0.6
37 0.66
38 0.68
39 0.64
40 0.64
41 0.64
42 0.6
43 0.58
44 0.54
45 0.48
46 0.44
47 0.47
48 0.4
49 0.37
50 0.3
51 0.23
52 0.19
53 0.18
54 0.2
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.19
59 0.23
60 0.29
61 0.35
62 0.42
63 0.49
64 0.52
65 0.55
66 0.56
67 0.59
68 0.59
69 0.62
70 0.53
71 0.5
72 0.52
73 0.53
74 0.5
75 0.45
76 0.42
77 0.35
78 0.41
79 0.42
80 0.39
81 0.36
82 0.34
83 0.34
84 0.32
85 0.3
86 0.26
87 0.26
88 0.24
89 0.22
90 0.27
91 0.26
92 0.27
93 0.26
94 0.25
95 0.22
96 0.29
97 0.3
98 0.28
99 0.31
100 0.32
101 0.34
102 0.34
103 0.35
104 0.29
105 0.29
106 0.27
107 0.28
108 0.28
109 0.26
110 0.24
111 0.22
112 0.19
113 0.2
114 0.25
115 0.26
116 0.3
117 0.3
118 0.31
119 0.34
120 0.37
121 0.34
122 0.28
123 0.23
124 0.27
125 0.3
126 0.34
127 0.35
128 0.34
129 0.38
130 0.38
131 0.39
132 0.32
133 0.33
134 0.35
135 0.3
136 0.34
137 0.34
138 0.38
139 0.36
140 0.33
141 0.31
142 0.25
143 0.25
144 0.19
145 0.17
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.22
150 0.27
151 0.28
152 0.28
153 0.27
154 0.26
155 0.28
156 0.3
157 0.3
158 0.24
159 0.24
160 0.25
161 0.24
162 0.23
163 0.21
164 0.18
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.18
185 0.16
186 0.22
187 0.28
188 0.24
189 0.23
190 0.29
191 0.28
192 0.35
193 0.38
194 0.35
195 0.3
196 0.32
197 0.35
198 0.36
199 0.38
200 0.34
201 0.37
202 0.41
203 0.41
204 0.4
205 0.38
206 0.36
207 0.37
208 0.39
209 0.34
210 0.34
211 0.34
212 0.34
213 0.33
214 0.32
215 0.31
216 0.26
217 0.26
218 0.21
219 0.2
220 0.23
221 0.28
222 0.25
223 0.26
224 0.28
225 0.29
226 0.3
227 0.29
228 0.3
229 0.29
230 0.3
231 0.26
232 0.25
233 0.23
234 0.24
235 0.25
236 0.23
237 0.22
238 0.23
239 0.24
240 0.24
241 0.24
242 0.22
243 0.22
244 0.2
245 0.17
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.16
256 0.17
257 0.15
258 0.15
259 0.19
260 0.2
261 0.21
262 0.25
263 0.26
264 0.29
265 0.31
266 0.36
267 0.36
268 0.41
269 0.42
270 0.41
271 0.43
272 0.43
273 0.45
274 0.4
275 0.38
276 0.34
277 0.32
278 0.3
279 0.26
280 0.22
281 0.18
282 0.17
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.16
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.15
295 0.13
296 0.15
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.22
302 0.26
303 0.25
304 0.29
305 0.26
306 0.28
307 0.34
308 0.33
309 0.29
310 0.27
311 0.28
312 0.21
313 0.26
314 0.24
315 0.18
316 0.19
317 0.19
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.15
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.17
328 0.17
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.17
333 0.2
334 0.22
335 0.28
336 0.37
337 0.44
338 0.51
339 0.59
340 0.63
341 0.7
342 0.75
343 0.75
344 0.74
345 0.72
346 0.66
347 0.62
348 0.54
349 0.44
350 0.36
351 0.3
352 0.22
353 0.16
354 0.14
355 0.07
356 0.05
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.13
370 0.19
371 0.24
372 0.26
373 0.27
374 0.26
375 0.26
376 0.25
377 0.21
378 0.17
379 0.14
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.1
386 0.14
387 0.15
388 0.17
389 0.2
390 0.23
391 0.31
392 0.36
393 0.44
394 0.47
395 0.54
396 0.62
397 0.66
398 0.71
399 0.74
400 0.78
401 0.74
402 0.76
403 0.74
404 0.75
405 0.73
406 0.68
407 0.62
408 0.53
409 0.47
410 0.36
411 0.28
412 0.2
413 0.15
414 0.12
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.11
424 0.12
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.05
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.06
450 0.08
451 0.11
452 0.12
453 0.15
454 0.17
455 0.18
456 0.21
457 0.21
458 0.24
459 0.21
460 0.22
461 0.22
462 0.21
463 0.23
464 0.21
465 0.23
466 0.2
467 0.21
468 0.23
469 0.27
470 0.28
471 0.32
472 0.36
473 0.41
474 0.49
475 0.51
476 0.52
477 0.52
478 0.52
479 0.5
480 0.51
481 0.46
482 0.46
483 0.47
484 0.44
485 0.37
486 0.35
487 0.33
488 0.3
489 0.32
490 0.3
491 0.33
492 0.32
493 0.36
494 0.37
495 0.37
496 0.34
497 0.29
498 0.27
499 0.26
500 0.26
501 0.23
502 0.23
503 0.22
504 0.22
505 0.21
506 0.18
507 0.14
508 0.17
509 0.21
510 0.26
511 0.27
512 0.27
513 0.27
514 0.27
515 0.27
516 0.25
517 0.27
518 0.31
519 0.31
520 0.33
521 0.33
522 0.33
523 0.34
524 0.32
525 0.27
526 0.2
527 0.17
528 0.17
529 0.22
530 0.25
531 0.25
532 0.28
533 0.25
534 0.23
535 0.23
536 0.26
537 0.27
538 0.25
539 0.23
540 0.23
541 0.25
542 0.27
543 0.27
544 0.24
545 0.21
546 0.25
547 0.29
548 0.31
549 0.31
550 0.35
551 0.39
552 0.43
553 0.44
554 0.44
555 0.47
556 0.48
557 0.52
558 0.53
559 0.56
560 0.56
561 0.59
562 0.59
563 0.58
564 0.58
565 0.57
566 0.58
567 0.59
568 0.6
569 0.59
570 0.59
571 0.59
572 0.62
573 0.63
574 0.63
575 0.6
576 0.58
577 0.58
578 0.55
579 0.53
580 0.47
581 0.42
582 0.36
583 0.34
584 0.28
585 0.24
586 0.21
587 0.18
588 0.15
589 0.13
590 0.11
591 0.08
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.07
599 0.11
600 0.15
601 0.16
602 0.19
603 0.25
604 0.29
605 0.33
606 0.34
607 0.32
608 0.3
609 0.34
610 0.34
611 0.29
612 0.29
613 0.3
614 0.29
615 0.3
616 0.28
617 0.26
618 0.24
619 0.22
620 0.18
621 0.12
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.07
626 0.07
627 0.09
628 0.08
629 0.09
630 0.1
631 0.16
632 0.17
633 0.19
634 0.19
635 0.18
636 0.18
637 0.17
638 0.17
639 0.13
640 0.16
641 0.17
642 0.18
643 0.16
644 0.16
645 0.2
646 0.19
647 0.17
648 0.16
649 0.23
650 0.26
651 0.27
652 0.29
653 0.33
654 0.39
655 0.41
656 0.4
657 0.32
658 0.32
659 0.32
660 0.32
661 0.27
662 0.22
663 0.2
664 0.19
665 0.17
666 0.15
667 0.14
668 0.13
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.13
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.11
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.11
682 0.12
683 0.15
684 0.15
685 0.15
686 0.17
687 0.17
688 0.22
689 0.23
690 0.28
691 0.26
692 0.29
693 0.28
694 0.28
695 0.28
696 0.22
697 0.17
698 0.11
699 0.1
700 0.07
701 0.08
702 0.07
703 0.06
704 0.06
705 0.07
706 0.08
707 0.08
708 0.09
709 0.11
710 0.13
711 0.2
712 0.23
713 0.24
714 0.24
715 0.27
716 0.3
717 0.29
718 0.29
719 0.24
720 0.24
721 0.22
722 0.23
723 0.27
724 0.3
725 0.29
726 0.3
727 0.32
728 0.29
729 0.31
730 0.33
731 0.28
732 0.24
733 0.31
734 0.34
735 0.3
736 0.31
737 0.34
738 0.36
739 0.36
740 0.38
741 0.33
742 0.33
743 0.33
744 0.38
745 0.41
746 0.42
747 0.4
748 0.37
749 0.34
750 0.28
751 0.28
752 0.23
753 0.16
754 0.1
755 0.11
756 0.11
757 0.1
758 0.12
759 0.12
760 0.11
761 0.13
762 0.13
763 0.19
764 0.24
765 0.25
766 0.24
767 0.26
768 0.29
769 0.28
770 0.29
771 0.21
772 0.17
773 0.16
774 0.16
775 0.13
776 0.1
777 0.08
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.08
782 0.11
783 0.13
784 0.16
785 0.18
786 0.2
787 0.24
788 0.26
789 0.27
790 0.32
791 0.39
792 0.44
793 0.5
794 0.54
795 0.6
796 0.6
797 0.58
798 0.52
799 0.45
800 0.4
801 0.33
802 0.26
803 0.17
804 0.16
805 0.16
806 0.15
807 0.14
808 0.12
809 0.11
810 0.15
811 0.16
812 0.2
813 0.22
814 0.26
815 0.31
816 0.37
817 0.43
818 0.4
819 0.47
820 0.46
821 0.47
822 0.49
823 0.51
824 0.5
825 0.5
826 0.48
827 0.47
828 0.5
829 0.5
830 0.45
831 0.4
832 0.4
833 0.38
834 0.42
835 0.36
836 0.3
837 0.29
838 0.32
839 0.34
840 0.28
841 0.24
842 0.2
843 0.2
844 0.19
845 0.15
846 0.11
847 0.08
848 0.1
849 0.12
850 0.15
851 0.16
852 0.17
853 0.19
854 0.25
855 0.25
856 0.24
857 0.22
858 0.25
859 0.24
860 0.27
861 0.27
862 0.22
863 0.22
864 0.26
865 0.26
866 0.21
867 0.21
868 0.19
869 0.18
870 0.18
871 0.18
872 0.15
873 0.14
874 0.17
875 0.17
876 0.16
877 0.15
878 0.14
879 0.14
880 0.17
881 0.18
882 0.16
883 0.17
884 0.18
885 0.22
886 0.23
887 0.26
888 0.22
889 0.22
890 0.21
891 0.2
892 0.19
893 0.15
894 0.14
895 0.14
896 0.14
897 0.13
898 0.13
899 0.13
900 0.12
901 0.12
902 0.12
903 0.15
904 0.17
905 0.19
906 0.24
907 0.29
908 0.33
909 0.34
910 0.38
911 0.37
912 0.39
913 0.39
914 0.41
915 0.38
916 0.38
917 0.41
918 0.42
919 0.44
920 0.42
921 0.4
922 0.38
923 0.39
924 0.41
925 0.39
926 0.34
927 0.32
928 0.37
929 0.42
930 0.4
931 0.39
932 0.32
933 0.36
934 0.43
935 0.45
936 0.42
937 0.38
938 0.37
939 0.37
940 0.36
941 0.31
942 0.27
943 0.23
944 0.19
945 0.17
946 0.16
947 0.14
948 0.14
949 0.14
950 0.1
951 0.09
952 0.1
953 0.1
954 0.1
955 0.09
956 0.11
957 0.12
958 0.14
959 0.16
960 0.18
961 0.19
962 0.25
963 0.33
964 0.34
965 0.4
966 0.46
967 0.53
968 0.53
969 0.56
970 0.57
971 0.52
972 0.59
973 0.58
974 0.53
975 0.5
976 0.5
977 0.47
978 0.5
979 0.53
980 0.53
981 0.53
982 0.6
983 0.64
984 0.72
985 0.76
986 0.75
987 0.75
988 0.73
989 0.71
990 0.67
991 0.64
992 0.6
993 0.6
994 0.59
995 0.59
996 0.58
997 0.59
998 0.6
999 0.61
1000 0.59
1001 0.61
1002 0.62
1003 0.6
1004 0.55
1005 0.54
1006 0.49
1007 0.42
1008 0.37
1009 0.3
1010 0.22
1011 0.17
1012 0.16