FuNGI

A0A1V1TMC0

Protein Details

Accession

A0A1V1TMC0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
964-984	QYNNGPPPKYQRHDQRGGRGY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 7.5, cyto_mito 7.5, mito 6.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPAAFRWLSTKYPKIISPVIEDKPIVMEDGSVIPVDTTRPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKDEEEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKQADKEELLKMIKQQNGGVLPPETLASLTKKAFDSNSITPGTPFMEILAISLRYWCAYKLNTDPGWANMKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQEGKARTCKICGQKGHDAQSCRGEAKQKDGEFDEKDKPLQQKPFIWLHVSVLREYLAVELEVPGLPFRWDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTAIWRDNLTFMGGYMTKDGHVDLERAQYIFDGLGKQEDAIFRRRKEVEDRREASFKRRKLQEQQRNGQNPSHGTKGYGDAPENSLPGGLSKALTHDMIVKRGATASDANTANKSAAAVLKSQIQGLMSTPKNQDQPGSPELQTAPALAKRKASVMEADGTSTPGSESVKSDAAKSDELEDSVRLWEDGYADRYYEQKFHVDTKDIDFRRKVAWAYTEGLAWVLRYYFQGCPSWEWFYPYHYAPFAQDFKDIATLEIKFEKGRIARPFEQLMSVQPAASRHVLPDVFHSLMTESESPIIDFYPEDFVVDLNGKKMAWQGVALLPFIEMPRLLAAIEEKYPLLTAEDAARNEPGRECLLLSEENQELYDDIIAQFYSKKQGAPKCKLDPRKSQGLSGKIEKMPEYLPHATLEYPLERKGMPDIDDDRSLTVHYDMPSSSHTHKSMLLRGVKLPVPALNNSDIEELKGKTRSSGRSYRGAPLGRQYNDGRRERMNYGPDSRRDGNNRHPSQYNNGGRRNGPNAFPGTPPMVPPGWAPPPPGFPGFGSGIPPPPPGYHGGGRGGHGNNRNDGYGNYGSQAYNQRHGPPGVPPYQDYGGQYNNGPPPKYQRHDQRGGRGYGYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.47
7	0.48
8	0.46
9	0.45
10	0.42
11	0.36
12	0.34
13	0.31
14	0.24
15	0.16
16	0.13
17	0.11
18	0.13
19	0.13
20	0.1
21	0.1
22	0.09
23	0.09
24	0.12
25	0.14
26	0.17
27	0.23
28	0.26
29	0.29
30	0.32
31	0.36
32	0.39
33	0.37
34	0.38
35	0.34
36	0.35
37	0.32
38	0.3
39	0.26
40	0.21
41	0.19
42	0.13
43	0.1
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.22
53	0.29
54	0.37
55	0.45
56	0.52
57	0.55
58	0.55
59	0.53
60	0.55
61	0.49
62	0.46
63	0.39
64	0.33
65	0.27
66	0.23
67	0.21
68	0.18
69	0.16
70	0.11
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.2
77	0.28
78	0.37
79	0.44
80	0.46
81	0.44
82	0.46
83	0.45
84	0.44
85	0.39
86	0.32
87	0.29
88	0.26
89	0.24
90	0.24
91	0.21
92	0.2
93	0.18
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.26
99	0.36
100	0.45
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.8
105	0.82
106	0.78
107	0.75
108	0.77
109	0.77
110	0.75
111	0.77
112	0.73
113	0.69
114	0.73
115	0.68
116	0.59
117	0.57
118	0.5
119	0.42
120	0.45
121	0.43
122	0.4
123	0.4
124	0.39
125	0.38
126	0.42
127	0.42
128	0.35
129	0.34
130	0.34
131	0.34
132	0.33
133	0.29
134	0.23
135	0.2
136	0.18
137	0.18
138	0.12
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.17
143	0.17
144	0.2
145	0.21
146	0.23
147	0.23
148	0.25
149	0.28
150	0.27
151	0.32
152	0.31
153	0.3
154	0.28
155	0.28
156	0.26
157	0.19
158	0.16
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.13
172	0.14
173	0.18
174	0.23
175	0.31
176	0.31
177	0.33
178	0.33
179	0.32
180	0.37
181	0.32
182	0.27
183	0.21
184	0.21
185	0.18
186	0.18
187	0.15
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.28
206	0.29
207	0.3
208	0.32
209	0.36
210	0.42
211	0.44
212	0.5
213	0.48
214	0.52
215	0.54
216	0.52
217	0.55
218	0.48
219	0.42
220	0.33
221	0.27
222	0.22
223	0.22
224	0.19
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.07
238	0.07
239	0.11
240	0.13
241	0.13
242	0.18
243	0.2
244	0.23
245	0.25
246	0.25
247	0.24
248	0.26
249	0.25
250	0.21
251	0.26
252	0.23
253	0.24
254	0.26
255	0.26
256	0.23
257	0.27
258	0.33
259	0.35
260	0.41
261	0.43
262	0.47
263	0.54
264	0.6
265	0.65
266	0.62
267	0.57
268	0.52
269	0.52
270	0.46
271	0.38
272	0.34
273	0.33
274	0.3
275	0.35
276	0.4
277	0.35
278	0.36
279	0.37
280	0.4
281	0.36
282	0.4
283	0.38
284	0.32
285	0.32
286	0.35
287	0.37
288	0.39
289	0.42
290	0.42
291	0.4
292	0.44
293	0.48
294	0.44
295	0.42
296	0.35
297	0.32
298	0.31
299	0.28
300	0.23
301	0.18
302	0.17
303	0.14
304	0.14
305	0.11
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.09
319	0.1
320	0.11
321	0.15
322	0.16
323	0.16
324	0.19
325	0.18
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.1
330	0.09
331	0.08
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.07
345	0.1
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.14
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.08
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.07
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.1
394	0.11
395	0.19
396	0.24
397	0.24
398	0.31
399	0.32
400	0.33
401	0.42
402	0.5
403	0.51
404	0.56
405	0.58
406	0.55
407	0.6
408	0.58
409	0.58
410	0.55
411	0.51
412	0.49
413	0.52
414	0.55
415	0.59
416	0.7
417	0.7
418	0.72
419	0.75
420	0.76
421	0.76
422	0.72
423	0.63
424	0.54
425	0.48
426	0.41
427	0.35
428	0.26
429	0.21
430	0.2
431	0.21
432	0.21
433	0.19
434	0.17
435	0.15
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.1
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.16
455	0.14
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.14
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.13
468	0.12
469	0.11
470	0.06
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.12
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.16
483	0.13
484	0.16
485	0.17
486	0.2
487	0.22
488	0.22
489	0.22
490	0.18
491	0.23
492	0.22
493	0.24
494	0.21
495	0.2
496	0.2
497	0.2
498	0.18
499	0.13
500	0.12
501	0.12
502	0.15
503	0.14
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.17
508	0.16
509	0.14
510	0.13
511	0.15
512	0.13
513	0.14
514	0.12
515	0.12
516	0.11
517	0.09
518	0.08
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.13
525	0.13
526	0.14
527	0.15
528	0.16
529	0.16
530	0.15
531	0.16
532	0.12
533	0.13
534	0.13
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.09
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.08
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.13
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.14
553	0.16
554	0.19
555	0.21
556	0.22
557	0.22
558	0.25
559	0.33
560	0.31
561	0.33
562	0.3
563	0.29
564	0.28
565	0.29
566	0.25
567	0.19
568	0.2
569	0.19
570	0.21
571	0.2
572	0.18
573	0.16
574	0.16
575	0.13
576	0.1
577	0.07
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.08
582	0.09
583	0.11
584	0.14
585	0.15
586	0.19
587	0.21
588	0.24
589	0.22
590	0.24
591	0.22
592	0.22
593	0.25
594	0.22
595	0.21
596	0.18
597	0.18
598	0.16
599	0.2
600	0.2
601	0.17
602	0.17
603	0.16
604	0.16
605	0.19
606	0.18
607	0.14
608	0.14
609	0.13
610	0.13
611	0.14
612	0.14
613	0.11
614	0.11
615	0.15
616	0.15
617	0.21
618	0.25
619	0.32
620	0.34
621	0.38
622	0.4
623	0.36
624	0.36
625	0.3
626	0.26
627	0.24
628	0.2
629	0.16
630	0.15
631	0.16
632	0.16
633	0.18
634	0.16
635	0.11
636	0.15
637	0.15
638	0.14
639	0.17
640	0.19
641	0.18
642	0.18
643	0.17
644	0.14
645	0.14
646	0.16
647	0.13
648	0.09
649	0.1
650	0.1
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.1
658	0.09
659	0.1
660	0.09
661	0.09
662	0.1
663	0.13
664	0.12
665	0.09
666	0.1
667	0.09
668	0.1
669	0.12
670	0.13
671	0.11
672	0.11
673	0.12
674	0.14
675	0.15
676	0.15
677	0.12
678	0.1
679	0.11
680	0.1
681	0.09
682	0.06
683	0.05
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.07
689	0.08
690	0.09
691	0.1
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.07
698	0.07
699	0.11
700	0.15
701	0.16
702	0.17
703	0.18
704	0.18
705	0.19
706	0.19
707	0.16
708	0.14
709	0.14
710	0.14
711	0.13
712	0.15
713	0.15
714	0.15
715	0.16
716	0.15
717	0.15
718	0.15
719	0.14
720	0.11
721	0.1
722	0.09
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.07
729	0.08
730	0.14
731	0.14
732	0.17
733	0.23
734	0.32
735	0.42
736	0.49
737	0.57
738	0.61
739	0.69
740	0.76
741	0.77
742	0.79
743	0.76
744	0.78
745	0.71
746	0.68
747	0.66
748	0.63
749	0.6
750	0.55
751	0.55
752	0.46
753	0.46
754	0.39
755	0.35
756	0.3
757	0.27
758	0.29
759	0.25
760	0.24
761	0.24
762	0.24
763	0.22
764	0.22
765	0.22
766	0.19
767	0.18
768	0.19
769	0.19
770	0.18
771	0.19
772	0.21
773	0.22
774	0.19
775	0.23
776	0.26
777	0.28
778	0.3
779	0.3
780	0.26
781	0.23
782	0.22
783	0.17
784	0.15
785	0.14
786	0.13
787	0.14
788	0.14
789	0.15
790	0.17
791	0.2
792	0.22
793	0.25
794	0.25
795	0.25
796	0.3
797	0.33
798	0.38
799	0.41
800	0.42
801	0.38
802	0.4
803	0.42
804	0.39
805	0.36
806	0.31
807	0.27
808	0.25
809	0.24
810	0.25
811	0.24
812	0.23
813	0.23
814	0.24
815	0.21
816	0.19
817	0.21
818	0.19
819	0.2
820	0.24
821	0.22
822	0.25
823	0.32
824	0.37
825	0.41
826	0.49
827	0.49
828	0.54
829	0.57
830	0.58
831	0.59
832	0.55
833	0.49
834	0.49
835	0.53
836	0.46
837	0.48
838	0.47
839	0.48
840	0.55
841	0.58
842	0.53
843	0.49
844	0.53
845	0.52
846	0.54
847	0.51
848	0.48
849	0.52
850	0.56
851	0.55
852	0.58
853	0.58
854	0.58
855	0.59
856	0.6
857	0.62
858	0.65
859	0.66
860	0.63
861	0.63
862	0.59
863	0.6
864	0.63
865	0.62
866	0.6
867	0.62
868	0.61
869	0.61
870	0.63
871	0.62
872	0.55
873	0.47
874	0.44
875	0.43
876	0.4
877	0.38
878	0.35
879	0.33
880	0.3
881	0.28
882	0.27
883	0.22
884	0.21
885	0.21
886	0.25
887	0.27
888	0.28
889	0.31
890	0.3
891	0.34
892	0.37
893	0.37
894	0.31
895	0.26
896	0.29
897	0.28
898	0.26
899	0.24
900	0.22
901	0.25
902	0.25
903	0.26
904	0.23
905	0.21
906	0.23
907	0.24
908	0.28
909	0.28
910	0.3
911	0.35
912	0.35
913	0.35
914	0.39
915	0.38
916	0.39
917	0.42
918	0.42
919	0.41
920	0.41
921	0.41
922	0.36
923	0.33
924	0.33
925	0.28
926	0.26
927	0.22
928	0.22
929	0.21
930	0.25
931	0.34
932	0.31
933	0.34
934	0.37
935	0.39
936	0.42
937	0.44
938	0.41
939	0.39
940	0.43
941	0.44
942	0.43
943	0.4
944	0.41
945	0.41
946	0.42
947	0.38
948	0.35
949	0.31
950	0.31
951	0.31
952	0.32
953	0.37
954	0.39
955	0.38
956	0.36
957	0.43
958	0.51
959	0.56
960	0.59
961	0.63
962	0.67
963	0.76
964	0.81
965	0.81
966	0.8
967	0.78

A0A1V1TMC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer