Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1SZX1

Protein Details
Accession A0A1V1SZX1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAKDKKDKKSKKASKQQSDAVAKPHydrophilic
54-76GAHREFRKHRATKAWKGHRAEKLBasic
420-448LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-14KKDKKSKKAS
60-72RKHRATKAWKGHR
426-439KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKDKKDKKSKKASKQQSDAVAKPSASPASPAQKPPAQLMDLVESFLSEQGFDGAHREFRKHRATKAWKGHRAEKLGDKESHSLVGIFHAWETLPTATTTATKKSKSDGRSSSSSSSGPATNTPSSDESSDEESSDDDDVAMADAPAAESSSESSSSDSSSSSESDSESDSESDDDNGGAPMAGSSNSIITPTTKSLKRKAQSDSESSSSESDSDEEMTSSNSKKEEKPQSKKIKTQDSSDKSSSSDSSSESDSDSDSDSDSEDENAKPKKTEKVQSDSDSSSSSDSDDSSSSSESESDSEKEVKIAAKVPLPASDSDSSSESESESKKEKQNTNIAGEAAASAASDSSATLEKASPEYAPLPPDPATFKANNRGKNGSALKKSQNQPFSRISKDVQVDPRLSSNAYVSHGYGEQAHRDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHTSRSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.92
3 0.88
4 0.87
5 0.84
6 0.76
7 0.7
8 0.62
9 0.52
10 0.45
11 0.41
12 0.33
13 0.26
14 0.26
15 0.27
16 0.32
17 0.37
18 0.39
19 0.42
20 0.43
21 0.45
22 0.46
23 0.45
24 0.38
25 0.34
26 0.33
27 0.32
28 0.29
29 0.27
30 0.22
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.13
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.17
43 0.19
44 0.23
45 0.27
46 0.35
47 0.46
48 0.48
49 0.53
50 0.58
51 0.66
52 0.72
53 0.79
54 0.81
55 0.79
56 0.81
57 0.83
58 0.8
59 0.75
60 0.7
61 0.68
62 0.65
63 0.63
64 0.6
65 0.55
66 0.5
67 0.46
68 0.42
69 0.33
70 0.25
71 0.19
72 0.18
73 0.15
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.14
86 0.16
87 0.21
88 0.26
89 0.28
90 0.29
91 0.34
92 0.41
93 0.42
94 0.5
95 0.49
96 0.49
97 0.52
98 0.55
99 0.52
100 0.47
101 0.42
102 0.34
103 0.3
104 0.25
105 0.21
106 0.19
107 0.21
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.22
112 0.22
113 0.21
114 0.2
115 0.17
116 0.21
117 0.21
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.11
180 0.16
181 0.2
182 0.24
183 0.31
184 0.4
185 0.43
186 0.46
187 0.49
188 0.52
189 0.52
190 0.53
191 0.49
192 0.43
193 0.4
194 0.36
195 0.31
196 0.22
197 0.18
198 0.14
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.15
212 0.24
213 0.34
214 0.43
215 0.5
216 0.59
217 0.69
218 0.72
219 0.77
220 0.75
221 0.75
222 0.67
223 0.65
224 0.65
225 0.59
226 0.6
227 0.55
228 0.48
229 0.38
230 0.37
231 0.31
232 0.23
233 0.18
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.14
253 0.17
254 0.17
255 0.18
256 0.2
257 0.27
258 0.33
259 0.4
260 0.41
261 0.45
262 0.5
263 0.52
264 0.54
265 0.47
266 0.41
267 0.34
268 0.28
269 0.22
270 0.16
271 0.14
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.2
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.21
301 0.22
302 0.21
303 0.2
304 0.19
305 0.2
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.13
310 0.15
311 0.15
312 0.17
313 0.21
314 0.25
315 0.31
316 0.39
317 0.44
318 0.47
319 0.56
320 0.58
321 0.57
322 0.53
323 0.47
324 0.39
325 0.33
326 0.26
327 0.16
328 0.11
329 0.06
330 0.04
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.11
344 0.12
345 0.15
346 0.15
347 0.18
348 0.17
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.22
353 0.22
354 0.26
355 0.26
356 0.3
357 0.37
358 0.42
359 0.47
360 0.49
361 0.51
362 0.47
363 0.52
364 0.57
365 0.55
366 0.55
367 0.55
368 0.57
369 0.62
370 0.67
371 0.67
372 0.68
373 0.62
374 0.62
375 0.64
376 0.63
377 0.59
378 0.56
379 0.49
380 0.48
381 0.49
382 0.5
383 0.49
384 0.49
385 0.45
386 0.44
387 0.45
388 0.39
389 0.36
390 0.29
391 0.24
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.19
396 0.19
397 0.19
398 0.19
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.21
403 0.21
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.2
408 0.26
409 0.24
410 0.24
411 0.3
412 0.33
413 0.39
414 0.43
415 0.48
416 0.51
417 0.6
418 0.69
419 0.75
420 0.82
421 0.84
422 0.9
423 0.91
424 0.9
425 0.9
426 0.89
427 0.89
428 0.89
429 0.86
430 0.76
431 0.68
432 0.66
433 0.57
434 0.53
435 0.45
436 0.38
437 0.33