Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TKQ4

Protein Details
Accession A0A1V1TKQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-69QYDSSGRRSNTRHQRHRRRLEDERHSLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-151GSVKEGRRRGRG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
Amino Acid Sequences MTSEQIEAYALHVRIEEITQKLRLDDVVPANQNRRSPSPEPQYDSSGRRSNTRHQRHRRRLEDERHSLIRTAMGTIPGYRPPPDYIPRHASGSMIKDKVYIPTKEFPEMNFIGQLLGPRGRSLAEMNTQSGANIVVRGKGSVKEGRRRGRGMAVGRRDTGSSQDHEPLHCLITADTHEKIKKAKALLQDTIEVIVMSPDHSNHRKSQQLRDLAVINGTFRDDENRGERHRDAWKREIGASIKCNICGGGHVSRDCADGNIIPPWRQSKKPGHPEDQLEIEYRQLLAEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.2
4 0.18
5 0.22
6 0.25
7 0.25
8 0.25
9 0.25
10 0.24
11 0.2
12 0.23
13 0.25
14 0.28
15 0.33
16 0.36
17 0.41
18 0.43
19 0.45
20 0.44
21 0.43
22 0.44
23 0.44
24 0.5
25 0.55
26 0.58
27 0.61
28 0.59
29 0.61
30 0.59
31 0.58
32 0.55
33 0.52
34 0.46
35 0.46
36 0.48
37 0.52
38 0.57
39 0.65
40 0.68
41 0.73
42 0.83
43 0.88
44 0.94
45 0.92
46 0.9
47 0.89
48 0.89
49 0.88
50 0.84
51 0.79
52 0.72
53 0.64
54 0.56
55 0.46
56 0.38
57 0.28
58 0.23
59 0.17
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.25
70 0.31
71 0.33
72 0.37
73 0.41
74 0.42
75 0.42
76 0.4
77 0.35
78 0.31
79 0.33
80 0.32
81 0.27
82 0.25
83 0.23
84 0.24
85 0.29
86 0.31
87 0.27
88 0.25
89 0.3
90 0.32
91 0.34
92 0.34
93 0.28
94 0.29
95 0.28
96 0.24
97 0.19
98 0.16
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.17
129 0.22
130 0.29
131 0.37
132 0.44
133 0.47
134 0.48
135 0.46
136 0.44
137 0.45
138 0.43
139 0.43
140 0.42
141 0.39
142 0.38
143 0.37
144 0.33
145 0.28
146 0.25
147 0.2
148 0.16
149 0.16
150 0.2
151 0.21
152 0.2
153 0.22
154 0.19
155 0.17
156 0.15
157 0.13
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.2
167 0.22
168 0.24
169 0.23
170 0.27
171 0.32
172 0.36
173 0.38
174 0.37
175 0.35
176 0.32
177 0.3
178 0.25
179 0.16
180 0.11
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.13
187 0.16
188 0.19
189 0.24
190 0.3
191 0.37
192 0.41
193 0.49
194 0.52
195 0.55
196 0.54
197 0.51
198 0.48
199 0.4
200 0.38
201 0.28
202 0.2
203 0.14
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.13
208 0.12
209 0.16
210 0.21
211 0.26
212 0.28
213 0.33
214 0.34
215 0.35
216 0.44
217 0.48
218 0.5
219 0.52
220 0.55
221 0.53
222 0.53
223 0.54
224 0.48
225 0.46
226 0.42
227 0.41
228 0.36
229 0.33
230 0.32
231 0.26
232 0.23
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.23
237 0.23
238 0.25
239 0.25
240 0.26
241 0.25
242 0.21
243 0.17
244 0.14
245 0.16
246 0.2
247 0.22
248 0.22
249 0.25
250 0.33
251 0.37
252 0.39
253 0.46
254 0.51
255 0.59
256 0.69
257 0.74
258 0.74
259 0.75
260 0.78
261 0.74
262 0.68
263 0.59
264 0.51
265 0.42
266 0.36
267 0.3
268 0.23