FuNGI

A0A1V1SSX9

Protein Details

Accession

A0A1V1SSX9

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-101	PSPSHEARRKTTSRRRGAPIPDT	Hydrophilic
115-139	IESLSPKDKPWQKFKSKPTENDNES	Hydrophilic
370-400	AVMSQRKTKGKEKKQPAKTKRKKKAGTEADP	Basic
654-681	VAKPTTSKTSTPKRPRGRPKKDEAASTS	Hydrophilic
685-708	SGVSVSSPKRPRSRPRKSSAASIE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
151-153	KKR
375-394	RKTKGKEKKQPAKTKRKKKA
664-675	TPKRPRGRPKKD
692-701	PKRPRSRPRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000116 HMGA IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MSSPSVFRSSPPRPPTFNSTSVLSSSPCLPSLDEIFLKKSPRKPPLGAGKAGVLPTLTGAANVLREAPVIDIDTETIIPSPSHEARRKTTSRRRGAPIPDTLADDRGSNSPATVIESLSPKDKPWQKFKSKPTENDNESLIPRSPKVSNSKKRSGKAIEKVSRHFTTSEEGSRLNSSAEREKRKLSTKEQASAVLASVALEPAIPRRGDWTPPRADVPIVLDSDSDTRELLSSVGKEPVSKDVFQTLYNQYGRQDTDLAPELFPQAQADFLRKRKRIELVSTGQERGGEQPHEEPLSKEPQLLNEQKTQAKLKAPAPRKKTRTITELATAPFAVPPASDIELTGPTTKESMLDYFDSDGAVKALVEHQTAVMSQRKTKGKEKKQPAKTKRKKKAGTEADPILLSPSTALKQSSKQDFVFGTSSQLVQEESPATLRDLQAAIRASNSLNSDPFDDDVGQRLWHAGARDEEGELIGMEFIDLQHGPAVVTEPDLTVTPGCRSFVDIDDILDSPKPVSSTLNAPSAPLQTNPHFVESQNTEQSSSSQCSEPGGSASASNLDPRPNYELFTDAQLGKQITSYGFKPMKRRAAMIALLDQCWTSKHQGASAGSIQPLSTSTRTPVLAQQEPTGNVPNEASARTRGRNRATKDRDSTTSVAKPTTSKTSTPKRPRGRPKKDEAASTSAAGSGVSVSSPKRPRSRPRKSSAASIEIPDSETGTPSPVLSSADPVFSSPPPLDLTTLDEGDLSLTLSPTDQQTELFRHITKAVTSAPRSQNPSNPSWYEKMLLYDPIILEDLASWLNGGELTRVGYDGEVSPFDVKTWCESKSVICLWRQNLRGRERKRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.68
3	0.66
4	0.63
5	0.56
6	0.51
7	0.47
8	0.43
9	0.39
10	0.31
11	0.26
12	0.24
13	0.23
14	0.21
15	0.2
16	0.19
17	0.21
18	0.23
19	0.27
20	0.27
21	0.27
22	0.3
23	0.32
24	0.38
25	0.42
26	0.47
27	0.51
28	0.57
29	0.63
30	0.63
31	0.68
32	0.73
33	0.73
34	0.67
35	0.59
36	0.54
37	0.49
38	0.45
39	0.35
40	0.24
41	0.17
42	0.15
43	0.15
44	0.11
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.11
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.11
62	0.1
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.16
68	0.21
69	0.3
70	0.36
71	0.42
72	0.47
73	0.57
74	0.64
75	0.68
76	0.73
77	0.75
78	0.78
79	0.81
80	0.82
81	0.81
82	0.81
83	0.78
84	0.74
85	0.69
86	0.6
87	0.57
88	0.5
89	0.44
90	0.36
91	0.29
92	0.24
93	0.2
94	0.2
95	0.15
96	0.14
97	0.13
98	0.13
99	0.16
100	0.15
101	0.13
102	0.14
103	0.17
104	0.19
105	0.22
106	0.22
107	0.19
108	0.28
109	0.36
110	0.4
111	0.48
112	0.57
113	0.64
114	0.73
115	0.81
116	0.83
117	0.85
118	0.85
119	0.84
120	0.83
121	0.77
122	0.71
123	0.64
124	0.56
125	0.48
126	0.43
127	0.37
128	0.3
129	0.26
130	0.27
131	0.26
132	0.29
133	0.38
134	0.46
135	0.53
136	0.59
137	0.69
138	0.73
139	0.74
140	0.77
141	0.76
142	0.75
143	0.74
144	0.76
145	0.74
146	0.71
147	0.73
148	0.71
149	0.64
150	0.56
151	0.47
152	0.37
153	0.35
154	0.33
155	0.33
156	0.27
157	0.26
158	0.26
159	0.27
160	0.26
161	0.21
162	0.19
163	0.19
164	0.26
165	0.34
166	0.4
167	0.41
168	0.46
169	0.51
170	0.59
171	0.62
172	0.61
173	0.63
174	0.61
175	0.65
176	0.61
177	0.57
178	0.49
179	0.42
180	0.34
181	0.24
182	0.17
183	0.11
184	0.1
185	0.07
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.08
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.16
194	0.18
195	0.25
196	0.32
197	0.36
198	0.37
199	0.4
200	0.42
201	0.38
202	0.36
203	0.3
204	0.28
205	0.24
206	0.2
207	0.18
208	0.15
209	0.15
210	0.17
211	0.16
212	0.12
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.09
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.11
221	0.15
222	0.14
223	0.15
224	0.16
225	0.23
226	0.24
227	0.23
228	0.22
229	0.23
230	0.25
231	0.25
232	0.28
233	0.23
234	0.27
235	0.28
236	0.27
237	0.24
238	0.26
239	0.26
240	0.22
241	0.22
242	0.16
243	0.19
244	0.23
245	0.23
246	0.2
247	0.2
248	0.2
249	0.17
250	0.17
251	0.13
252	0.08
253	0.1
254	0.1
255	0.15
256	0.2
257	0.27
258	0.36
259	0.39
260	0.42
261	0.45
262	0.52
263	0.52
264	0.53
265	0.53
266	0.49
267	0.53
268	0.53
269	0.48
270	0.41
271	0.36
272	0.3
273	0.24
274	0.22
275	0.15
276	0.14
277	0.15
278	0.17
279	0.19
280	0.19
281	0.17
282	0.17
283	0.22
284	0.22
285	0.22
286	0.2
287	0.22
288	0.29
289	0.33
290	0.33
291	0.33
292	0.36
293	0.36
294	0.39
295	0.38
296	0.34
297	0.33
298	0.35
299	0.35
300	0.41
301	0.48
302	0.53
303	0.58
304	0.64
305	0.65
306	0.68
307	0.7
308	0.66
309	0.62
310	0.58
311	0.53
312	0.47
313	0.45
314	0.37
315	0.3
316	0.24
317	0.19
318	0.15
319	0.13
320	0.09
321	0.05
322	0.05
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.11
342	0.11
343	0.1
344	0.09
345	0.08
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.1
358	0.14
359	0.14
360	0.16
361	0.23
362	0.28
363	0.33
364	0.42
365	0.5
366	0.55
367	0.64
368	0.73
369	0.76
370	0.81
371	0.87
372	0.89
373	0.9
374	0.9
375	0.91
376	0.9
377	0.9
378	0.87
379	0.84
380	0.84
381	0.83
382	0.79
383	0.74
384	0.65
385	0.55
386	0.48
387	0.4
388	0.3
389	0.19
390	0.12
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.13
398	0.19
399	0.23
400	0.25
401	0.25
402	0.26
403	0.25
404	0.27
405	0.24
406	0.19
407	0.17
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.09
413	0.07
414	0.08
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.1
429	0.11
430	0.09
431	0.11
432	0.13
433	0.1
434	0.1
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.09
442	0.11
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.09
457	0.09
458	0.07
459	0.05
460	0.04
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.05
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.06
481	0.07
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.12
488	0.13
489	0.15
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.11
496	0.1
497	0.07
498	0.07
499	0.08
500	0.07
501	0.08
502	0.09
503	0.13
504	0.16
505	0.2
506	0.19
507	0.19
508	0.2
509	0.21
510	0.21
511	0.18
512	0.19
513	0.16
514	0.22
515	0.23
516	0.24
517	0.22
518	0.21
519	0.24
520	0.25
521	0.28
522	0.26
523	0.25
524	0.24
525	0.23
526	0.25
527	0.23
528	0.21
529	0.18
530	0.15
531	0.15
532	0.15
533	0.16
534	0.14
535	0.12
536	0.11
537	0.1
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.1
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.15
547	0.2
548	0.18
549	0.19
550	0.17
551	0.18
552	0.17
553	0.19
554	0.2
555	0.14
556	0.14
557	0.16
558	0.16
559	0.14
560	0.14
561	0.12
562	0.11
563	0.13
564	0.13
565	0.19
566	0.24
567	0.27
568	0.34
569	0.41
570	0.49
571	0.48
572	0.49
573	0.44
574	0.45
575	0.44
576	0.38
577	0.37
578	0.29
579	0.28
580	0.26
581	0.23
582	0.17
583	0.15
584	0.16
585	0.13
586	0.16
587	0.17
588	0.19
589	0.24
590	0.25
591	0.28
592	0.29
593	0.27
594	0.23
595	0.22
596	0.2
597	0.14
598	0.15
599	0.14
600	0.12
601	0.12
602	0.13
603	0.16
604	0.17
605	0.19
606	0.22
607	0.25
608	0.28
609	0.29
610	0.3
611	0.3
612	0.3
613	0.31
614	0.31
615	0.24
616	0.21
617	0.19
618	0.19
619	0.17
620	0.17
621	0.17
622	0.18
623	0.22
624	0.27
625	0.33
626	0.39
627	0.47
628	0.54
629	0.59
630	0.64
631	0.68
632	0.71
633	0.71
634	0.69
635	0.64
636	0.61
637	0.57
638	0.52
639	0.49
640	0.41
641	0.36
642	0.32
643	0.3
644	0.28
645	0.34
646	0.31
647	0.3
648	0.38
649	0.47
650	0.57
651	0.66
652	0.72
653	0.74
654	0.82
655	0.89
656	0.92
657	0.92
658	0.91
659	0.9
660	0.9
661	0.84
662	0.81
663	0.74
664	0.69
665	0.6
666	0.51
667	0.42
668	0.31
669	0.27
670	0.19
671	0.14
672	0.08
673	0.06
674	0.05
675	0.07
676	0.08
677	0.16
678	0.23
679	0.31
680	0.4
681	0.49
682	0.6
683	0.69
684	0.8
685	0.82
686	0.83
687	0.86
688	0.8
689	0.81
690	0.77
691	0.72
692	0.63
693	0.55
694	0.49
695	0.38
696	0.37
697	0.27
698	0.22
699	0.15
700	0.14
701	0.12
702	0.12
703	0.12
704	0.11
705	0.11
706	0.1
707	0.13
708	0.12
709	0.16
710	0.15
711	0.16
712	0.16
713	0.16
714	0.18
715	0.16
716	0.19
717	0.15
718	0.16
719	0.17
720	0.18
721	0.19
722	0.17
723	0.22
724	0.22
725	0.22
726	0.2
727	0.17
728	0.16
729	0.15
730	0.14
731	0.09
732	0.06
733	0.06
734	0.06
735	0.07
736	0.08
737	0.09
738	0.12
739	0.11
740	0.13
741	0.17
742	0.21
743	0.25
744	0.28
745	0.27
746	0.26
747	0.28
748	0.29
749	0.26
750	0.24
751	0.27
752	0.31
753	0.34
754	0.41
755	0.47
756	0.51
757	0.57
758	0.58
759	0.59
760	0.57
761	0.58
762	0.56
763	0.52
764	0.51
765	0.48
766	0.46
767	0.41
768	0.37
769	0.36
770	0.31
771	0.3
772	0.25
773	0.25
774	0.23
775	0.22
776	0.21
777	0.17
778	0.14
779	0.12
780	0.12
781	0.09
782	0.09
783	0.07
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.09
791	0.09
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.11
796	0.12
797	0.14
798	0.13
799	0.14
800	0.16
801	0.16
802	0.17
803	0.17
804	0.16
805	0.2
806	0.23
807	0.23
808	0.23
809	0.24
810	0.26
811	0.32
812	0.38
813	0.36
814	0.39
815	0.44
816	0.48
817	0.55
818	0.58
819	0.59
820	0.61
821	0.66
822	0.71

A0A1V1SSX9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer