Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TJC8

Protein Details
Accession A0A1V1TJC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132YREIDEKMDKRRRARREAREQAERDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-124KRRRARREA
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8.5, cyto_mito 8.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGFSDAVTGKKKDQAAEEDDNNDERFQDPDNEVGLFAGGIYDKDDDEADRIYREIDEKMDKRRRARREAREQAERDEYERKNPKISQQFADLKRGLESITEDEWAALPEVGDLTGRNKRARQARHQRFYAVPDSVIAAASSAGELGATVADDGAVSANTGTSTNGTDGTVTDFAKIGQARDKVLQVRLDQASQNGAGTSGSATSVDPKGYLTSLAKSQLPDSAAQVGDVNRVRDLLESVIKTNPNNAPGWIAAARVEELAGKIVAARNVISRGCDHCPKSEDVWLENIRLNDQRNARIIAANAIKKNNRSVRLWVEAMKLEDDARSKKRVIRHALDHIPESEALWKEAVNLEENSDDAKLLLAKATELVPGSVDLWLALARLETPENAQKVLNRARKHRPTSHEIWIAAARLQEQLGEGDKVNVMKRAAQVLVKESAMPKREEWITEAEKCEEEGAIITCGAIIRETLGYGLDEDDDRKEAWLEDARGSIDRGMYETARAIYAYALRVFPTSKTIWLAAADLERNYGKREDLWQVLEKAVNAVPHSEVLWMMLAKEKWQAGEVDNARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENDQTEQARGLLKQARQEAPTDRVWMKSAVFERQLNNHDEALDLVQQALNLFPGYPKLWMMKGHIYEDMGKKPQAREAYATGVKAVPNSVPLWLLYSRLEESMGLLPKARSVLDRARLAVPKSPELWCESVRLELRAGDKKQAESIMERARRDVPKNKQGLLWAEKIWHLTEPKQRKPRAVEAVKEAENDPVLLVAVARIFWGERRLDKAQNWFERALVRDSDLGDSWAWYYKFLVEHGTVEKREEVIRKCVGVEPRHGEVWQRIAKDPKNARRGTEEILKIVAAEVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.37
40 0.36
41 0.31
42 0.28
43 0.25
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.15
48 0.2
49 0.24
50 0.25
51 0.24
52 0.29
53 0.32
54 0.33
55 0.38
56 0.39
57 0.43
58 0.48
59 0.48
60 0.45
61 0.45
62 0.44
63 0.39
64 0.32
65 0.25
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.2
70 0.19
71 0.2
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.19
76 0.16
77 0.1
78 0.09
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.27
99 0.3
100 0.41
101 0.49
102 0.54
103 0.62
104 0.7
105 0.74
106 0.76
107 0.83
108 0.83
109 0.85
110 0.89
111 0.88
112 0.89
113 0.82
114 0.76
115 0.74
116 0.64
117 0.56
118 0.54
119 0.47
120 0.47
121 0.54
122 0.5
123 0.5
124 0.52
125 0.58
126 0.59
127 0.63
128 0.56
129 0.56
130 0.63
131 0.59
132 0.64
133 0.56
134 0.47
135 0.42
136 0.39
137 0.3
138 0.22
139 0.22
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.11
156 0.16
157 0.21
158 0.24
159 0.27
160 0.34
161 0.43
162 0.51
163 0.57
164 0.63
165 0.7
166 0.75
167 0.75
168 0.73
169 0.67
170 0.64
171 0.58
172 0.48
173 0.37
174 0.29
175 0.27
176 0.23
177 0.2
178 0.14
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.12
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.16
217 0.17
218 0.15
219 0.19
220 0.2
221 0.22
222 0.24
223 0.28
224 0.27
225 0.3
226 0.33
227 0.27
228 0.32
229 0.31
230 0.31
231 0.28
232 0.25
233 0.23
234 0.19
235 0.19
236 0.12
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.13
253 0.11
254 0.12
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.16
266 0.15
267 0.16
268 0.14
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.15
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.16
281 0.19
282 0.2
283 0.2
284 0.24
285 0.24
286 0.23
287 0.22
288 0.21
289 0.2
290 0.18
291 0.21
292 0.16
293 0.13
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.16
315 0.2
316 0.26
317 0.26
318 0.28
319 0.31
320 0.33
321 0.33
322 0.34
323 0.31
324 0.26
325 0.31
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.24
330 0.21
331 0.23
332 0.24
333 0.23
334 0.24
335 0.26
336 0.27
337 0.28
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.23
342 0.26
343 0.26
344 0.26
345 0.28
346 0.29
347 0.29
348 0.37
349 0.38
350 0.37
351 0.35
352 0.39
353 0.4
354 0.42
355 0.42
356 0.36
357 0.32
358 0.3
359 0.28
360 0.23
361 0.18
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.17
366 0.19
367 0.21
368 0.22
369 0.26
370 0.32
371 0.39
372 0.44
373 0.45
374 0.48
375 0.53
376 0.56
377 0.54
378 0.49
379 0.41
380 0.34
381 0.27
382 0.22
383 0.18
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.12
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.07
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.13
432 0.19
433 0.28
434 0.32
435 0.31
436 0.38
437 0.47
438 0.55
439 0.61
440 0.62
441 0.59
442 0.61
443 0.63
444 0.64
445 0.57
446 0.48
447 0.43
448 0.36
449 0.31
450 0.24
451 0.19
452 0.12
453 0.09
454 0.09
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.11
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.16
475 0.14
476 0.14
477 0.13
478 0.16
479 0.17
480 0.18
481 0.16
482 0.18
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.21
487 0.22
488 0.23
489 0.24
490 0.21
491 0.2
492 0.2
493 0.18
494 0.12
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.03
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.1
524 0.13
525 0.13
526 0.13
527 0.14
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.13
532 0.1
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.06
544 0.08
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.13
553 0.12
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.09
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.11
570 0.12
571 0.16
572 0.18
573 0.2
574 0.24
575 0.25
576 0.25
577 0.25
578 0.25
579 0.21
580 0.18
581 0.16
582 0.14
583 0.11
584 0.11
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.07
593 0.06
594 0.1
595 0.09
596 0.1
597 0.13
598 0.13
599 0.12
600 0.14
601 0.15
602 0.12
603 0.21
604 0.23
605 0.26
606 0.29
607 0.29
608 0.28
609 0.27
610 0.26
611 0.19
612 0.2
613 0.18
614 0.24
615 0.28
616 0.35
617 0.4
618 0.44
619 0.45
620 0.44
621 0.4
622 0.32
623 0.28
624 0.21
625 0.18
626 0.13
627 0.1
628 0.07
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.09
637 0.11
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.11
644 0.16
645 0.19
646 0.21
647 0.26
648 0.32
649 0.34
650 0.33
651 0.36
652 0.35
653 0.34
654 0.34
655 0.34
656 0.29
657 0.27
658 0.28
659 0.26
660 0.22
661 0.23
662 0.24
663 0.24
664 0.27
665 0.28
666 0.29
667 0.34
668 0.37
669 0.35
670 0.35
671 0.3
672 0.26
673 0.23
674 0.22
675 0.17
676 0.15
677 0.11
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.05
685 0.06
686 0.06
687 0.08
688 0.09
689 0.1
690 0.11
691 0.13
692 0.15
693 0.17
694 0.22
695 0.26
696 0.28
697 0.29
698 0.29
699 0.28
700 0.31
701 0.33
702 0.33
703 0.3
704 0.3
705 0.31
706 0.31
707 0.36
708 0.35
709 0.33
710 0.32
711 0.32
712 0.37
713 0.36
714 0.35
715 0.3
716 0.27
717 0.25
718 0.21
719 0.19
720 0.12
721 0.12
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.11
726 0.14
727 0.13
728 0.14
729 0.13
730 0.15
731 0.16
732 0.15
733 0.16
734 0.12
735 0.14
736 0.18
737 0.2
738 0.17
739 0.18
740 0.18
741 0.19
742 0.2
743 0.18
744 0.14
745 0.17
746 0.25
747 0.31
748 0.33
749 0.34
750 0.39
751 0.42
752 0.43
753 0.42
754 0.38
755 0.35
756 0.35
757 0.34
758 0.3
759 0.31
760 0.33
761 0.28
762 0.28
763 0.25
764 0.28
765 0.29
766 0.28
767 0.24
768 0.24
769 0.29
770 0.34
771 0.35
772 0.36
773 0.37
774 0.37
775 0.39
776 0.38
777 0.34
778 0.29
779 0.35
780 0.37
781 0.4
782 0.39
783 0.39
784 0.44
785 0.49
786 0.53
787 0.56
788 0.56
789 0.61
790 0.66
791 0.65
792 0.6
793 0.58
794 0.59
795 0.54
796 0.48
797 0.39
798 0.36
799 0.35
800 0.34
801 0.3
802 0.27
803 0.24
804 0.27
805 0.36
806 0.44
807 0.53
808 0.61
809 0.64
810 0.68
811 0.72
812 0.75
813 0.76
814 0.74
815 0.69
816 0.67
817 0.69
818 0.63
819 0.57
820 0.48
821 0.39
822 0.32
823 0.27
824 0.19
825 0.12
826 0.11
827 0.08
828 0.08
829 0.06
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.08
836 0.14
837 0.17
838 0.2
839 0.27
840 0.32
841 0.38
842 0.42
843 0.51
844 0.56
845 0.6
846 0.61
847 0.55
848 0.51
849 0.5
850 0.48
851 0.42
852 0.34
853 0.28
854 0.26
855 0.27
856 0.28
857 0.23
858 0.22
859 0.18
860 0.17
861 0.16
862 0.2
863 0.18
864 0.16
865 0.17
866 0.19
867 0.2
868 0.2
869 0.24
870 0.19
871 0.22
872 0.28
873 0.33
874 0.31
875 0.32
876 0.33
877 0.3
878 0.34
879 0.38
880 0.36
881 0.37
882 0.41
883 0.39
884 0.4
885 0.44
886 0.47
887 0.44
888 0.48
889 0.46
890 0.46
891 0.47
892 0.46
893 0.44
894 0.41
895 0.46
896 0.42
897 0.39
898 0.41
899 0.48
900 0.52
901 0.58
902 0.64
903 0.65
904 0.69
905 0.69
906 0.67
907 0.66
908 0.65
909 0.61
910 0.6
911 0.54
912 0.45
913 0.44
914 0.39
915 0.32