Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1STR4

Protein Details
Accession A0A1V1STR4    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-137HLTHGYRKGRKRISKVSKYFETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 12.333, cyto 8, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
IPR001085  Ser_HO-MeTrfase  
IPR039429  SHMT-like_dom  
Gene Ontology GO:0004372  F:glycine hydroxymethyltransferase activity  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0019264  P:glycine biosynthetic process from serine  
GO:0035999  P:tetrahydrofolate interconversion  
Pfam View protein in Pfam  
PF00464  SHMT  
CDD cd00378  SHMT  
Amino Acid Sequences MFRLLRQEEYRQKSCLNLIASENVMSPAVLEALGSVVQNKSSEGYPGARYHSCCTNIDKIERICQSRALKAFNLRPEEWGVNVQSMSGSNANLYVYSALLECHDRIMGLDLAHGGHLTHGYRKGRKRISKVSKYFETFPYYLDPKTGFIDYDGLEAAAEQYQPRIVVAGTSAYSRLIDYARIKRITSKVGAYLVSDISHISGLIAAGLVPSPFEHSDIITSSTAKLLQGPRGGIIFYRRGIKPTGTGSIENAIDASVFPGHQSSPHNNSIAALSVALQQALTPEFKQYQKQVLLNSKALAETLTSLGYSLSSGGTDTHLVLLDLRPHGIDGARLERVLELLGVASNRNVLYGDTSVKEPSGLRIGSPAMTARGLGPQDFVEVAKFIDRAVGVAKKLSVLAEEQAAGAGEEEPANLEHFLRFIEENDDHEMILELRSEISDWVEQFTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.41
4 0.35
5 0.34
6 0.34
7 0.33
8 0.3
9 0.27
10 0.21
11 0.18
12 0.14
13 0.12
14 0.09
15 0.08
16 0.07
17 0.06
18 0.05
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.14
30 0.16
31 0.19
32 0.22
33 0.25
34 0.3
35 0.32
36 0.34
37 0.36
38 0.4
39 0.4
40 0.38
41 0.41
42 0.44
43 0.46
44 0.46
45 0.5
46 0.45
47 0.5
48 0.53
49 0.52
50 0.45
51 0.47
52 0.47
53 0.48
54 0.49
55 0.45
56 0.44
57 0.47
58 0.52
59 0.51
60 0.54
61 0.48
62 0.46
63 0.46
64 0.43
65 0.37
66 0.34
67 0.28
68 0.23
69 0.22
70 0.19
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.12
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.07
102 0.05
103 0.07
104 0.08
105 0.11
106 0.18
107 0.24
108 0.32
109 0.4
110 0.49
111 0.57
112 0.65
113 0.7
114 0.75
115 0.79
116 0.82
117 0.83
118 0.81
119 0.78
120 0.74
121 0.68
122 0.61
123 0.57
124 0.46
125 0.39
126 0.37
127 0.32
128 0.28
129 0.26
130 0.23
131 0.18
132 0.2
133 0.19
134 0.14
135 0.12
136 0.15
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.1
165 0.16
166 0.22
167 0.28
168 0.3
169 0.3
170 0.34
171 0.37
172 0.37
173 0.33
174 0.28
175 0.25
176 0.25
177 0.25
178 0.2
179 0.18
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.17
225 0.16
226 0.18
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.22
232 0.19
233 0.2
234 0.19
235 0.2
236 0.19
237 0.16
238 0.13
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.08
249 0.11
250 0.16
251 0.22
252 0.25
253 0.25
254 0.25
255 0.25
256 0.23
257 0.2
258 0.15
259 0.09
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.07
270 0.09
271 0.13
272 0.15
273 0.19
274 0.21
275 0.27
276 0.31
277 0.33
278 0.37
279 0.41
280 0.44
281 0.42
282 0.39
283 0.33
284 0.28
285 0.25
286 0.19
287 0.12
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.13
325 0.1
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.1
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.14
346 0.15
347 0.19
348 0.17
349 0.16
350 0.18
351 0.19
352 0.18
353 0.19
354 0.17
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.11
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.13
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.09
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.15
377 0.18
378 0.17
379 0.19
380 0.19
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.14
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.19
410 0.19
411 0.22
412 0.28
413 0.28
414 0.24
415 0.24
416 0.24
417 0.17
418 0.17
419 0.15
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.12
426 0.15
427 0.15