Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V1TP55

Protein Details
Accession A0A1V1TP55    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32EGPTGPRAKKQKASENQTTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MGLVDYSDSDESEGPTGPRAKKQKASENQTTTTPTAKSELPPLPSAFHDLYASTVRVSASDDPTLHQGRKRVNPHKAGHWPSHLYIEWHPTPTERTTLTTLLSTLQSTLTTTSPSPAPSITSFLTSDLGAPQPLHISLSRPIVLSTAQKDAFLSDLERSIRSSGIAAFELAPAGLQWHRTAESARSFLVLRVASKPALNQSNTSNGNGNNKAGKGAEDPTGETNPQLTALLRRANAVVAAFGQPALYAFAQPRADDGGGERADVDTAFHISIAWSFAVPSAELQRATDEAFANAVNARPDADKSNESDGEALRGGNEASDDENPTAAPSPTIEDLVGAMRVRVEGIKAKIGNVVTHVPLPNARGRRNDGGSEGGRGLFGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.19
3 0.26
4 0.28
5 0.36
6 0.44
7 0.51
8 0.58
9 0.66
10 0.71
11 0.74
12 0.8
13 0.81
14 0.79
15 0.73
16 0.68
17 0.64
18 0.55
19 0.49
20 0.4
21 0.32
22 0.28
23 0.28
24 0.26
25 0.29
26 0.32
27 0.32
28 0.35
29 0.35
30 0.34
31 0.32
32 0.36
33 0.29
34 0.25
35 0.22
36 0.18
37 0.2
38 0.21
39 0.2
40 0.14
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.16
45 0.18
46 0.19
47 0.22
48 0.22
49 0.22
50 0.29
51 0.33
52 0.32
53 0.3
54 0.32
55 0.37
56 0.46
57 0.55
58 0.58
59 0.63
60 0.7
61 0.71
62 0.75
63 0.77
64 0.74
65 0.69
66 0.65
67 0.59
68 0.51
69 0.52
70 0.43
71 0.37
72 0.33
73 0.35
74 0.31
75 0.29
76 0.28
77 0.25
78 0.28
79 0.26
80 0.27
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.24
85 0.24
86 0.2
87 0.19
88 0.17
89 0.17
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.13
106 0.17
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.1
124 0.13
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.16
131 0.17
132 0.16
133 0.18
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.12
141 0.07
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.17
176 0.14
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.18
188 0.25
189 0.26
190 0.26
191 0.24
192 0.21
193 0.26
194 0.25
195 0.25
196 0.2
197 0.19
198 0.19
199 0.17
200 0.17
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.18
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.09
216 0.12
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.12
224 0.09
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.15
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.13
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.16
288 0.19
289 0.2
290 0.23
291 0.29
292 0.28
293 0.28
294 0.28
295 0.24
296 0.23
297 0.21
298 0.18
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.09
306 0.11
307 0.13
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.13
314 0.11
315 0.1
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.16
332 0.19
333 0.26
334 0.27
335 0.27
336 0.31
337 0.31
338 0.3
339 0.27
340 0.27
341 0.22
342 0.26
343 0.26
344 0.23
345 0.24
346 0.27
347 0.31
348 0.35
349 0.39
350 0.41
351 0.48
352 0.55
353 0.57
354 0.56
355 0.51
356 0.51
357 0.48
358 0.45
359 0.39
360 0.3