Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TFM1

Protein Details
Accession A0A1V1TFM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-303DRSGSRSRSRSESRGRRRSRSDGWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-152RRKLRRRARA
278-299RSDRSGSRSRSRSESRGRRRSR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MPSDTHRADERRFLDERGSGGALAPNGLNPATIMEKAVRERIVDSYFWKEQCFGVNEADIIDRVVDHVSFIGGTYGDNQKPSPFLCLAFKLLQLGPDDAVLGEYLRYGGDKFKYLRALAVFYVRLTRKAEDVFKTLEPFLEDRRKLRRRARAGAKITFLDEFVDELLTKDRVCATSLWQMPKREILEDLDLLDPRVSPLGDIEDLLDEDMDDVNGGEGENGGEGEGESHDGDGDGEEGEVEDERRDRSSSPRYSGRSRSYSTARSSSRDRMDVDRDRRSDRSGSRSRSRSESRGRRRSRSDGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.36
4 0.31
5 0.29
6 0.23
7 0.21
8 0.22
9 0.17
10 0.16
11 0.14
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.07
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.17
23 0.2
24 0.24
25 0.23
26 0.21
27 0.23
28 0.26
29 0.27
30 0.25
31 0.26
32 0.28
33 0.32
34 0.32
35 0.31
36 0.28
37 0.26
38 0.3
39 0.3
40 0.25
41 0.23
42 0.22
43 0.22
44 0.21
45 0.21
46 0.15
47 0.11
48 0.09
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.08
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.16
71 0.17
72 0.19
73 0.2
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.17
82 0.14
83 0.12
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.08
96 0.1
97 0.14
98 0.16
99 0.19
100 0.22
101 0.22
102 0.24
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.2
107 0.17
108 0.14
109 0.19
110 0.17
111 0.19
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.21
116 0.26
117 0.22
118 0.24
119 0.25
120 0.23
121 0.24
122 0.22
123 0.19
124 0.16
125 0.15
126 0.18
127 0.23
128 0.23
129 0.26
130 0.36
131 0.41
132 0.48
133 0.55
134 0.59
135 0.59
136 0.67
137 0.73
138 0.72
139 0.72
140 0.67
141 0.61
142 0.52
143 0.45
144 0.35
145 0.26
146 0.17
147 0.11
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.19
163 0.23
164 0.29
165 0.32
166 0.33
167 0.33
168 0.37
169 0.34
170 0.27
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.16
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.05
185 0.06
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.22
235 0.32
236 0.37
237 0.42
238 0.49
239 0.53
240 0.59
241 0.67
242 0.66
243 0.63
244 0.6
245 0.6
246 0.58
247 0.59
248 0.57
249 0.57
250 0.52
251 0.5
252 0.53
253 0.55
254 0.54
255 0.53
256 0.5
257 0.48
258 0.54
259 0.59
260 0.61
261 0.61
262 0.6
263 0.61
264 0.61
265 0.59
266 0.58
267 0.55
268 0.57
269 0.58
270 0.62
271 0.67
272 0.7
273 0.7
274 0.71
275 0.72
276 0.71
277 0.73
278 0.75
279 0.77
280 0.81
281 0.85
282 0.85
283 0.86