Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V1ST57

Protein Details
Accession A0A1V1ST57    Localization Confidence High Confidence Score 23.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-146LPHGEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
266-289DDGTKTPKGKTTRKRKSTAGDVDDHydrophilic
294-318AAKNATPASPDKKRKRQSKLRDTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-137KKERKKRTHD
275-275K
277-280TRKR
305-312KKRKRQSK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4, plas 2, mito 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MVPMPAMPMQQQHQQLQQQHQMTPQHQMPQAIAQQPPMQPMQGTLPPQQRTIGIDEFIRVRDSVHQRFNTITALMKNFADDFVRQTNLLIGEPAPFDNGAGASMQSLVASLDGIGGQLSDLLPHGEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQTARPIIANDLGADAPKGAVQEEGQRRWSSMSPGEKVAWNNAYQFNLRLYNARVHSYKAGNPDARNMTDGDALNYADANGIPQADVVTDETMAPNDQEAIAEQLQMATPSITQDDGTKTPKGKTTRKRKSTAGDVDDGESSAAKNATPASPDKKRKRQSKLRDTSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.51
3 0.55
4 0.59
5 0.56
6 0.52
7 0.54
8 0.54
9 0.48
10 0.49
11 0.46
12 0.44
13 0.43
14 0.43
15 0.38
16 0.38
17 0.42
18 0.39
19 0.35
20 0.31
21 0.34
22 0.34
23 0.35
24 0.3
25 0.25
26 0.2
27 0.21
28 0.24
29 0.23
30 0.26
31 0.3
32 0.37
33 0.38
34 0.39
35 0.39
36 0.35
37 0.33
38 0.34
39 0.29
40 0.23
41 0.21
42 0.22
43 0.22
44 0.22
45 0.2
46 0.15
47 0.13
48 0.21
49 0.29
50 0.35
51 0.41
52 0.42
53 0.42
54 0.43
55 0.44
56 0.37
57 0.29
58 0.25
59 0.2
60 0.21
61 0.21
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.17
66 0.15
67 0.12
68 0.14
69 0.15
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.13
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.07
112 0.09
113 0.14
114 0.21
115 0.32
116 0.42
117 0.48
118 0.55
119 0.62
120 0.7
121 0.77
122 0.81
123 0.81
124 0.82
125 0.87
126 0.9
127 0.84
128 0.75
129 0.66
130 0.61
131 0.53
132 0.47
133 0.38
134 0.3
135 0.29
136 0.29
137 0.28
138 0.23
139 0.21
140 0.18
141 0.16
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.13
161 0.18
162 0.2
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.24
167 0.25
168 0.2
169 0.22
170 0.25
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.27
175 0.26
176 0.27
177 0.22
178 0.18
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.22
190 0.23
191 0.25
192 0.24
193 0.24
194 0.28
195 0.28
196 0.29
197 0.28
198 0.33
199 0.33
200 0.33
201 0.37
202 0.37
203 0.35
204 0.33
205 0.28
206 0.23
207 0.23
208 0.23
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.11
253 0.15
254 0.19
255 0.22
256 0.26
257 0.27
258 0.3
259 0.37
260 0.43
261 0.49
262 0.55
263 0.63
264 0.7
265 0.77
266 0.8
267 0.81
268 0.81
269 0.81
270 0.81
271 0.75
272 0.68
273 0.6
274 0.56
275 0.49
276 0.4
277 0.3
278 0.2
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.13
286 0.17
287 0.23
288 0.29
289 0.39
290 0.5
291 0.6
292 0.68
293 0.77
294 0.84
295 0.89
296 0.91
297 0.92
298 0.93