Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1STM5

Protein Details
Accession A0A1V1STM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
547-566CGHVYCKRCFENRRPPSRSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
529-531KPR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
Amino Acid Sequences MAEIPDSDSPGRYASSPLPNFPAAALAPYEGLPSDASSMLEDTEEEEEDDGEDTSIDEDDLDDEEVADYNYNLDDEGTEEEVDGEGEDEDEDGDGDEQDDYYDRDFDLDDFDMRDVDVDFDFEGFGFPADEERLFVDDYLDFPHEDQFGALHHALLHQLEHHLAQEHWGLRPPHSPNMDQPHVGAAARPRTQRDQLVQVEVAGQGNGGGADAPGGQRRHQRQLPPDVIDLTGDDDPEMPPRPNQAARAVPQRQSENQRRLRSQPQNAPPRLNRSDGNYVDDQQVIVLVSSDDEDQPMRASPRRNANHHHHHHHYHNHNHNHNHHHLNRHNDNSAAGRAARNARFGDQPRQPGPASAPAPAPAPAQAQHLNNHNSNNSHSNLLSSRLRPFTQLVQNLPLFQFLSNPPAIMANRNHNPDDDIVITGERNVANLPNIGPFAGPAQQFIGLGPIHLDYAAHPFPAMQPHAPPAAGAGAGAGPPKPAHEPPKPARPGFTRDTGEDVVAICPSCDQELAYDPEGDDDAPATPAKKPRSKKAMAEHHFWAVKACGHVYCKRCFENRRPPSRSNIQVGFRPDDPPSKKLFCAVEDCDSEVGAKTAWVGIFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.32
3 0.34
4 0.36
5 0.39
6 0.39
7 0.38
8 0.34
9 0.31
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.06
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.12
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.21
156 0.22
157 0.22
158 0.29
159 0.31
160 0.34
161 0.36
162 0.37
163 0.38
164 0.46
165 0.46
166 0.4
167 0.36
168 0.31
169 0.28
170 0.26
171 0.21
172 0.17
173 0.21
174 0.25
175 0.27
176 0.29
177 0.33
178 0.37
179 0.41
180 0.4
181 0.41
182 0.39
183 0.41
184 0.37
185 0.32
186 0.28
187 0.24
188 0.2
189 0.12
190 0.09
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.05
200 0.09
201 0.11
202 0.13
203 0.21
204 0.26
205 0.35
206 0.39
207 0.45
208 0.47
209 0.56
210 0.59
211 0.54
212 0.5
213 0.43
214 0.38
215 0.32
216 0.25
217 0.17
218 0.13
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.14
228 0.18
229 0.19
230 0.21
231 0.24
232 0.27
233 0.29
234 0.38
235 0.39
236 0.39
237 0.4
238 0.41
239 0.41
240 0.46
241 0.52
242 0.52
243 0.57
244 0.59
245 0.58
246 0.61
247 0.66
248 0.65
249 0.64
250 0.64
251 0.64
252 0.69
253 0.68
254 0.69
255 0.61
256 0.61
257 0.55
258 0.49
259 0.4
260 0.36
261 0.42
262 0.36
263 0.38
264 0.3
265 0.29
266 0.27
267 0.26
268 0.2
269 0.12
270 0.11
271 0.07
272 0.06
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.09
285 0.11
286 0.14
287 0.19
288 0.29
289 0.34
290 0.37
291 0.43
292 0.5
293 0.57
294 0.61
295 0.63
296 0.58
297 0.57
298 0.59
299 0.61
300 0.59
301 0.58
302 0.61
303 0.62
304 0.63
305 0.64
306 0.63
307 0.61
308 0.59
309 0.57
310 0.51
311 0.52
312 0.5
313 0.54
314 0.54
315 0.5
316 0.46
317 0.39
318 0.37
319 0.3
320 0.27
321 0.19
322 0.14
323 0.11
324 0.13
325 0.18
326 0.18
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.25
331 0.29
332 0.34
333 0.33
334 0.37
335 0.36
336 0.38
337 0.36
338 0.32
339 0.31
340 0.3
341 0.27
342 0.23
343 0.21
344 0.19
345 0.19
346 0.19
347 0.17
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.14
352 0.17
353 0.18
354 0.2
355 0.26
356 0.29
357 0.29
358 0.31
359 0.29
360 0.26
361 0.28
362 0.29
363 0.24
364 0.21
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.22
369 0.22
370 0.2
371 0.24
372 0.25
373 0.26
374 0.26
375 0.27
376 0.29
377 0.33
378 0.35
379 0.32
380 0.34
381 0.34
382 0.33
383 0.31
384 0.25
385 0.18
386 0.15
387 0.15
388 0.11
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.15
394 0.16
395 0.18
396 0.21
397 0.24
398 0.29
399 0.33
400 0.33
401 0.31
402 0.32
403 0.28
404 0.27
405 0.2
406 0.16
407 0.13
408 0.13
409 0.12
410 0.1
411 0.12
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.13
431 0.12
432 0.14
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.05
441 0.12
442 0.13
443 0.12
444 0.11
445 0.12
446 0.14
447 0.19
448 0.21
449 0.16
450 0.17
451 0.2
452 0.22
453 0.21
454 0.19
455 0.15
456 0.13
457 0.11
458 0.09
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.09
467 0.13
468 0.18
469 0.26
470 0.33
471 0.42
472 0.48
473 0.59
474 0.63
475 0.6
476 0.61
477 0.58
478 0.58
479 0.53
480 0.54
481 0.47
482 0.42
483 0.46
484 0.41
485 0.36
486 0.3
487 0.26
488 0.19
489 0.16
490 0.15
491 0.09
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.14
499 0.18
500 0.2
501 0.19
502 0.18
503 0.19
504 0.2
505 0.18
506 0.13
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.14
513 0.22
514 0.3
515 0.38
516 0.45
517 0.54
518 0.63
519 0.69
520 0.73
521 0.77
522 0.79
523 0.76
524 0.75
525 0.67
526 0.65
527 0.59
528 0.5
529 0.42
530 0.33
531 0.3
532 0.27
533 0.26
534 0.22
535 0.26
536 0.34
537 0.37
538 0.42
539 0.46
540 0.49
541 0.56
542 0.61
543 0.66
544 0.7
545 0.76
546 0.8
547 0.8
548 0.78
549 0.79
550 0.8
551 0.77
552 0.74
553 0.71
554 0.65
555 0.63
556 0.65
557 0.6
558 0.52
559 0.47
560 0.42
561 0.44
562 0.44
563 0.43
564 0.45
565 0.45
566 0.44
567 0.47
568 0.47
569 0.41
570 0.44
571 0.44
572 0.43
573 0.4
574 0.42
575 0.36
576 0.32
577 0.29
578 0.22
579 0.19
580 0.12
581 0.1
582 0.09
583 0.11