FuNGI

A0A0C4EHS5

Protein Details

Accession

A0A0C4EHS5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
975-998	NPLQILKSKKSVRKKWPVYSQSNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MEYSLVPKQEKYHKLTGKRTGPVSENGHNFSDVNSDAGASAWAQNSQPARSSCGDIASESDESDVIEDQQAASSRSETESVETSNSEDSDDNDVPQDKGTKASKQTERMMLAQEARAHLSQLFINEPELCGLLYGPRYPALQSHRQQASASADMFFLDVVPVPPSRFRPAAMMGGMTLESPQNQLLTQILSQTMKLRDLNDELATTNRRLKLEKHLNSTEFEALQASRAKLYRQVLEACVGMQVVVNSLMDSTKNPTSMGPGKLPPQGIKQLLEKKDGLFRMNMMGKRVNYAARSVISPDINIETNEIGVPPVFAKKLTFPEFVTEHNHDQMHRLVCNGPHKHPGAVYVQDEDGTMISLDKMDEDGRRALANTLRHSSTDAENPPNTTRPDIGLPSTRTRTRGIRVHRHLNDGDILILNRQPTLHKPSMMCHRARILKGEKTIRMHYANCNSYNADFDGDDEHAFPTKPDRPKRGTNDRKYDNQYLVPTSGNPLRGLIQDHVVSGVWMTNKDTFFDREEYYQIIYGALRPEGNYSGQGRVITVPPAIWKPVPMWTGKQLISTIMKNITPLDASGLNLRSTSKVRGKSWGSHVSEEEVIFMDGDLLQGVIDKSQIGASPYGLVHSVYDLYGSEVAGKLLGILSRLFTKYLQHRAFTCRMDDLQLTKRGDEMRSKLISETSQRGIRATLSTIGLTEWEAKTPHGMIDLENRLQEVLRDDMKMAALDNAYSGENSSLQTAINNQCLPSGLAKPFPWNNMQMMTSSGAKGTPVNASQISCLLGQQALEGRRVPVMVSGKTLPSFRAFETAPRAGGFVAQRFLTGIRPQEYYFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGVRVHYDHTVRNSDSSILQFHYGDDSLDVTKQKHLNQFDFSLLNRSSLITRFNPSRIAGQVDCDTAHYYTEGIVKALNKGQHPLPPPTLSIFSPSRNLGSISEKFARDVKAYQLDNPLQILKSKKSVRKKWPVYSQSNELVAMDMFSSLMHVRFMMGLVDPGEAVGLLAAQGVGEPSTQMTLNTFHFAGHGAANVTLGIPRLREIVMTASANIKTPTMKFPIRPEVTDDEFERFIKRTARLHLSQVVDQVVVTERLKTNGSSAQIFKVYEIRLELYPAEEYCREYSINVPAVFKSIAKVFVPTLERMITRELKTLQSDLKTQLAEIGKGKASSARKGQGSGADGSEDGEEDVPARRVDEADIEDGDAYDENGHVNGAKLTTIKMMTGAGKTDEDQDSDEDTSSSTTASEDSRSRDELEISQDDADELADEVQQLSSYVNSIEFDKHGGHFCLDCT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.77
3	0.8
4	0.78
5	0.77
6	0.73
7	0.68
8	0.64
9	0.63
10	0.6
11	0.58
12	0.54
13	0.51
14	0.49
15	0.45
16	0.4
17	0.33
18	0.3
19	0.23
20	0.19
21	0.15
22	0.13
23	0.12
24	0.12
25	0.12
26	0.09
27	0.11
28	0.11
29	0.13
30	0.12
31	0.18
32	0.21
33	0.22
34	0.28
35	0.26
36	0.31
37	0.32
38	0.37
39	0.33
40	0.34
41	0.32
42	0.26
43	0.28
44	0.26
45	0.24
46	0.19
47	0.18
48	0.14
49	0.13
50	0.14
51	0.12
52	0.09
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.13
57	0.15
58	0.15
59	0.16
60	0.16
61	0.16
62	0.18
63	0.19
64	0.17
65	0.18
66	0.19
67	0.19
68	0.2
69	0.19
70	0.19
71	0.19
72	0.19
73	0.18
74	0.15
75	0.16
76	0.22
77	0.22
78	0.21
79	0.23
80	0.25
81	0.23
82	0.25
83	0.27
84	0.19
85	0.26
86	0.3
87	0.33
88	0.39
89	0.48
90	0.54
91	0.57
92	0.63
93	0.64
94	0.63
95	0.58
96	0.55
97	0.49
98	0.44
99	0.41
100	0.37
101	0.31
102	0.31
103	0.29
104	0.25
105	0.21
106	0.2
107	0.18
108	0.17
109	0.18
110	0.15
111	0.17
112	0.16
113	0.16
114	0.15
115	0.15
116	0.12
117	0.1
118	0.09
119	0.11
120	0.12
121	0.13
122	0.14
123	0.15
124	0.16
125	0.16
126	0.22
127	0.26
128	0.34
129	0.37
130	0.45
131	0.47
132	0.48
133	0.47
134	0.46
135	0.45
136	0.39
137	0.36
138	0.27
139	0.23
140	0.22
141	0.22
142	0.16
143	0.1
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.09
148	0.1
149	0.11
150	0.16
151	0.2
152	0.25
153	0.26
154	0.26
155	0.29
156	0.31
157	0.34
158	0.31
159	0.27
160	0.21
161	0.21
162	0.2
163	0.15
164	0.12
165	0.08
166	0.08
167	0.09
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.15
177	0.14
178	0.16
179	0.2
180	0.21
181	0.23
182	0.25
183	0.24
184	0.26
185	0.29
186	0.31
187	0.27
188	0.25
189	0.22
190	0.25
191	0.27
192	0.25
193	0.28
194	0.29
195	0.29
196	0.31
197	0.34
198	0.4
199	0.48
200	0.53
201	0.55
202	0.58
203	0.58
204	0.57
205	0.57
206	0.49
207	0.38
208	0.3
209	0.24
210	0.17
211	0.19
212	0.2
213	0.18
214	0.19
215	0.2
216	0.21
217	0.26
218	0.3
219	0.3
220	0.3
221	0.33
222	0.3
223	0.31
224	0.3
225	0.24
226	0.2
227	0.16
228	0.12
229	0.09
230	0.08
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.12
240	0.14
241	0.15
242	0.15
243	0.16
244	0.22
245	0.28
246	0.3
247	0.3
248	0.3
249	0.33
250	0.37
251	0.39
252	0.34
253	0.34
254	0.37
255	0.35
256	0.35
257	0.39
258	0.45
259	0.45
260	0.47
261	0.43
262	0.38
263	0.42
264	0.42
265	0.35
266	0.27
267	0.25
268	0.28
269	0.33
270	0.32
271	0.3
272	0.32
273	0.31
274	0.33
275	0.34
276	0.3
277	0.25
278	0.25
279	0.24
280	0.21
281	0.21
282	0.21
283	0.22
284	0.19
285	0.18
286	0.18
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.14
304	0.22
305	0.27
306	0.28
307	0.26
308	0.31
309	0.32
310	0.33
311	0.35
312	0.32
313	0.3
314	0.32
315	0.32
316	0.27
317	0.29
318	0.32
319	0.29
320	0.25
321	0.23
322	0.22
323	0.26
324	0.35
325	0.37
326	0.35
327	0.38
328	0.4
329	0.39
330	0.37
331	0.35
332	0.3
333	0.3
334	0.27
335	0.22
336	0.21
337	0.2
338	0.2
339	0.16
340	0.12
341	0.08
342	0.07
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.13
353	0.13
354	0.14
355	0.14
356	0.16
357	0.18
358	0.23
359	0.24
360	0.26
361	0.26
362	0.26
363	0.28
364	0.27
365	0.25
366	0.27
367	0.27
368	0.28
369	0.29
370	0.31
371	0.31
372	0.33
373	0.32
374	0.27
375	0.24
376	0.21
377	0.24
378	0.23
379	0.24
380	0.26
381	0.28
382	0.32
383	0.36
384	0.36
385	0.35
386	0.37
387	0.39
388	0.4
389	0.44
390	0.47
391	0.53
392	0.58
393	0.66
394	0.65
395	0.66
396	0.59
397	0.53
398	0.45
399	0.35
400	0.28
401	0.19
402	0.16
403	0.12
404	0.12
405	0.11
406	0.09
407	0.09
408	0.1
409	0.14
410	0.22
411	0.24
412	0.26
413	0.27
414	0.32
415	0.42
416	0.47
417	0.43
418	0.37
419	0.41
420	0.43
421	0.43
422	0.46
423	0.42
424	0.41
425	0.47
426	0.5
427	0.48
428	0.46
429	0.48
430	0.45
431	0.42
432	0.39
433	0.39
434	0.41
435	0.41
436	0.38
437	0.37
438	0.34
439	0.31
440	0.3
441	0.24
442	0.17
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.11
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.13
454	0.2
455	0.28
456	0.35
457	0.42
458	0.47
459	0.56
460	0.65
461	0.71
462	0.75
463	0.76
464	0.79
465	0.76
466	0.78
467	0.75
468	0.71
469	0.62
470	0.55
471	0.47
472	0.39
473	0.35
474	0.28
475	0.21
476	0.2
477	0.19
478	0.17
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.15
483	0.17
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.12
490	0.1
491	0.08
492	0.09
493	0.07
494	0.07
495	0.09
496	0.12
497	0.12
498	0.14
499	0.15
500	0.16
501	0.18
502	0.2
503	0.2
504	0.18
505	0.19
506	0.19
507	0.17
508	0.16
509	0.13
510	0.11
511	0.09
512	0.1
513	0.1
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.1
519	0.11
520	0.12
521	0.12
522	0.13
523	0.14
524	0.14
525	0.13
526	0.13
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.09
531	0.1
532	0.11
533	0.12
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.16
538	0.17
539	0.17
540	0.18
541	0.2
542	0.25
543	0.25
544	0.25
545	0.19
546	0.2
547	0.22
548	0.2
549	0.18
550	0.15
551	0.14
552	0.14
553	0.14
554	0.12
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.08
559	0.08
560	0.1
561	0.11
562	0.11
563	0.11
564	0.12
565	0.12
566	0.13
567	0.19
568	0.22
569	0.26
570	0.27
571	0.34
572	0.37
573	0.39
574	0.45
575	0.48
576	0.44
577	0.4
578	0.39
579	0.35
580	0.33
581	0.28
582	0.21
583	0.12
584	0.1
585	0.08
586	0.07
587	0.05
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.04
597	0.03
598	0.04
599	0.04
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.08
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.05
629	0.07
630	0.07
631	0.08
632	0.08
633	0.12
634	0.17
635	0.27
636	0.28
637	0.28
638	0.29
639	0.34
640	0.39
641	0.36
642	0.31
643	0.23
644	0.21
645	0.22
646	0.21
647	0.19
648	0.2
649	0.25
650	0.24
651	0.23
652	0.24
653	0.24
654	0.25
655	0.26
656	0.24
657	0.23
658	0.24
659	0.24
660	0.23
661	0.22
662	0.22
663	0.21
664	0.22
665	0.19
666	0.2
667	0.2
668	0.2
669	0.19
670	0.18
671	0.16
672	0.13
673	0.11
674	0.1
675	0.1
676	0.09
677	0.09
678	0.08
679	0.08
680	0.09
681	0.08
682	0.08
683	0.09
684	0.09
685	0.1
686	0.1
687	0.09
688	0.08
689	0.09
690	0.08
691	0.14
692	0.17
693	0.17
694	0.16
695	0.16
696	0.14
697	0.14
698	0.14
699	0.1
700	0.1
701	0.1
702	0.1
703	0.1
704	0.11
705	0.11
706	0.11
707	0.09
708	0.08
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.05
717	0.06
718	0.06
719	0.07
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.1
724	0.12
725	0.15
726	0.15
727	0.14
728	0.14
729	0.15
730	0.15
731	0.13
732	0.14
733	0.12
734	0.15
735	0.15
736	0.19
737	0.2
738	0.22
739	0.22
740	0.2
741	0.2
742	0.19
743	0.2
744	0.16
745	0.16
746	0.15
747	0.13
748	0.11
749	0.1
750	0.09
751	0.09
752	0.08
753	0.08
754	0.09
755	0.09
756	0.11
757	0.11
758	0.12
759	0.12
760	0.12
761	0.12
762	0.1
763	0.1
764	0.08
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.11
769	0.1
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.12
774	0.12
775	0.12
776	0.12
777	0.14
778	0.14
779	0.15
780	0.16
781	0.17
782	0.18
783	0.18
784	0.15
785	0.14
786	0.16
787	0.14
788	0.16
789	0.15
790	0.17
791	0.23
792	0.23
793	0.21
794	0.19
795	0.19
796	0.16
797	0.18
798	0.17
799	0.12
800	0.12
801	0.12
802	0.11
803	0.11
804	0.12
805	0.12
806	0.13
807	0.15
808	0.16
809	0.18
810	0.18
811	0.23
812	0.25
813	0.27
814	0.25
815	0.23
816	0.21
817	0.2
818	0.2
819	0.16
820	0.14
821	0.1
822	0.09
823	0.08
824	0.08
825	0.07
826	0.07
827	0.08
828	0.09
829	0.08
830	0.08
831	0.1
832	0.12
833	0.15
834	0.21
835	0.22
836	0.27
837	0.32
838	0.36
839	0.35
840	0.35
841	0.34
842	0.29
843	0.3
844	0.27
845	0.29
846	0.26
847	0.29
848	0.3
849	0.29
850	0.28
851	0.28
852	0.26
853	0.21
854	0.24
855	0.25
856	0.22
857	0.22
858	0.22
859	0.21
860	0.2
861	0.19
862	0.17
863	0.13
864	0.14
865	0.13
866	0.12
867	0.13
868	0.12
869	0.11
870	0.09
871	0.1
872	0.09
873	0.11
874	0.12
875	0.11
876	0.16
877	0.2
878	0.25
879	0.3
880	0.35
881	0.36
882	0.38
883	0.38
884	0.35
885	0.33
886	0.29
887	0.28
888	0.23
889	0.21
890	0.18
891	0.17
892	0.16
893	0.16
894	0.2
895	0.16
896	0.2
897	0.22
898	0.23
899	0.25
900	0.25
901	0.26
902	0.24
903	0.27
904	0.23
905	0.23
906	0.23
907	0.21
908	0.2
909	0.18
910	0.18
911	0.13
912	0.13
913	0.1
914	0.09
915	0.09
916	0.13
917	0.12
918	0.1
919	0.12
920	0.12
921	0.14
922	0.17
923	0.19
924	0.17
925	0.2
926	0.22
927	0.26
928	0.29
929	0.32
930	0.33
931	0.31
932	0.31
933	0.31
934	0.31
935	0.26
936	0.27
937	0.24
938	0.22
939	0.24
940	0.24
941	0.22
942	0.21
943	0.22
944	0.19
945	0.23
946	0.23
947	0.25
948	0.29
949	0.28
950	0.28
951	0.3
952	0.3
953	0.26
954	0.26
955	0.26
956	0.29
957	0.3
958	0.31
959	0.35
960	0.34
961	0.33
962	0.33
963	0.28
964	0.21
965	0.24
966	0.25
967	0.21
968	0.28
969	0.36
970	0.43
971	0.52
972	0.61
973	0.68
974	0.75
975	0.82
976	0.83
977	0.86
978	0.87
979	0.84
980	0.8
981	0.75
982	0.68
983	0.6
984	0.51
985	0.4
986	0.31
987	0.23
988	0.17
989	0.11
990	0.07
991	0.05
992	0.05
993	0.06
994	0.06
995	0.07
996	0.07
997	0.06
998	0.07
999	0.07
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.06
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.03
1012	0.03
1013	0.02
1014	0.02
1015	0.02
1016	0.02
1017	0.02
1018	0.03
1019	0.03
1020	0.03
1021	0.04
1022	0.04
1023	0.06
1024	0.06
1025	0.06
1026	0.08
1027	0.1
1028	0.12
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.14
1034	0.14
1035	0.11
1036	0.11
1037	0.09
1038	0.09
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.08
1042	0.07
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.07
1046	0.08
1047	0.1
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.1
1051	0.13
1052	0.15
1053	0.15
1054	0.16
1055	0.17
1056	0.18
1057	0.19
1058	0.18
1059	0.16
1060	0.15
1061	0.17
1062	0.21
1063	0.24
1064	0.27
1065	0.3
1066	0.37
1067	0.46
1068	0.47
1069	0.46
1070	0.47
1071	0.47
1072	0.47
1073	0.47
1074	0.41
1075	0.34
1076	0.32
1077	0.32
1078	0.29
1079	0.24
1080	0.23
1081	0.26
1082	0.29
1083	0.31
1084	0.37
1085	0.44
1086	0.44
1087	0.48
1088	0.51
1089	0.49
1090	0.46
1091	0.43
1092	0.36
1093	0.28
1094	0.25
1095	0.21
1096	0.16
1097	0.16
1098	0.14
1099	0.16
1100	0.16
1101	0.18
1102	0.2
1103	0.19
1104	0.2
1105	0.22
1106	0.25
1107	0.25
1108	0.25
1109	0.27
1110	0.28
1111	0.28
1112	0.26
1113	0.27
1114	0.24
1115	0.22
1116	0.22
1117	0.21
1118	0.19
1119	0.21
1120	0.2
1121	0.16
1122	0.17
1123	0.16
1124	0.18
1125	0.16
1126	0.19
1127	0.19
1128	0.21
1129	0.19
1130	0.18
1131	0.21
1132	0.24
1133	0.3
1134	0.28
1135	0.28
1136	0.26
1137	0.29
1138	0.29
1139	0.26
1140	0.21
1141	0.17
1142	0.19
1143	0.18
1144	0.2
1145	0.17
1146	0.22
1147	0.25
1148	0.24
1149	0.25
1150	0.24
1151	0.24
1152	0.23
1153	0.29
1154	0.3
1155	0.29
1156	0.33
1157	0.33
1158	0.35
1159	0.37
1160	0.39
1161	0.38
1162	0.34
1163	0.36
1164	0.34
1165	0.36
1166	0.31
1167	0.29
1168	0.31
1169	0.28
1170	0.28
1171	0.26
1172	0.27
1173	0.25
1174	0.25
1175	0.25
1176	0.26
1177	0.28
1178	0.31
1179	0.37
1180	0.4
1181	0.4
1182	0.42
1183	0.44
1184	0.43
1185	0.42
1186	0.38
1187	0.31
1188	0.25
1189	0.22
1190	0.21
1191	0.19
1192	0.14
1193	0.11
1194	0.09
1195	0.08
1196	0.08
1197	0.11
1198	0.12
1199	0.12
1200	0.13
1201	0.13
1202	0.13
1203	0.15
1204	0.19
1205	0.19
1206	0.19
1207	0.2
1208	0.2
1209	0.19
1210	0.18
1211	0.17
1212	0.12
1213	0.1
1214	0.07
1215	0.07
1216	0.07
1217	0.07
1218	0.08
1219	0.07
1220	0.08
1221	0.09
1222	0.09
1223	0.1
1224	0.1
1225	0.12
1226	0.15
1227	0.15
1228	0.15
1229	0.14
1230	0.16
1231	0.18
1232	0.19
1233	0.2
1234	0.18
1235	0.19
1236	0.2
1237	0.24
1238	0.24
1239	0.22
1240	0.22
1241	0.22
1242	0.23
1243	0.23
1244	0.22
1245	0.17
1246	0.16
1247	0.16
1248	0.14
1249	0.12
1250	0.09
1251	0.08
1252	0.09
1253	0.11
1254	0.15
1255	0.18
1256	0.23
1257	0.27
1258	0.29
1259	0.32
1260	0.32
1261	0.33
1262	0.32
1263	0.35
1264	0.33
1265	0.3
1266	0.28
1267	0.25
1268	0.23
1269	0.2
1270	0.17
1271	0.1
1272	0.08
1273	0.07
1274	0.07
1275	0.07
1276	0.08
1277	0.08
1278	0.08
1279	0.08
1280	0.08
1281	0.08
1282	0.08
1283	0.09
1284	0.09
1285	0.1
1286	0.12
1287	0.14
1288	0.15
1289	0.17
1290	0.18
1291	0.2
1292	0.24
1293	0.25
1294	0.25

A0A0C4EHS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer