Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TCC3

Protein Details
Accession A0A1V1TCC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
503-527RENESQLERRRRQRKKANNAWRPMLHydrophilic
834-857DIQAIESRSKRRRTLRESRISTLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-518RRRRQRKK
842-845SKRR
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 3, nucl 1, plas 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MPTPFICRKCTARLAKSVFRSLRLSQSPLHTRTIPSERPSHVLVPPAEHDPESSQSRRPGATHKGKHDRADEILVYWQGEIGKFVPRRTPAVKRLATLPTNSLRELKAKIIAARGDYVLFHDDLASLCGLSDREARHAVGQLERLLWGHLEIEVTAQRLDQYLTWKKDFSATLKNVLTALSTQGDGSAIDDDVFEMTLYESEWLSMRTAWQRLPREKRERLWPRMMLSAAKSEPHILLTLIQSTFDPSWCPSYVVEDILYFLFCRQLALEKSGPKGAPKGAPDSRLQTQEVSEVMADVILNKCPPRYLALEQVVLVSTFSSLSTPELLQRYELLKTLEHPFHANTLLHLASRFAKGYDTKLHAADIIRILTDMPKFDLNTPAAASVCTTLLTINEHDPLPDPQVAPDLLFEFLLKRGLSPNLLGLSALMRNFCIRGHLDTAWKIFDLMLQYGLEPDQHVYSILLNGSTQNFDSVSFEQIFNIITSRTAWSPVLLNDFLGLLFRENESQLERRRRQRKKANNAWRPMLDLYAKFYDLAPLQKFTLFSLENLVGARSLHPNYSTPSTRLAESLMPQPENRLMQPDTITLSLMIGAHMRSLLTPKYAIRYYKCFVNLVNRKDPTALSLLDNHGTLIFDIYLRTLMQFRETTGFAMRELLKKINAAEREREQHGRNRLHHPPSVHTWTIALNGLKNHNDTRGAVGILDMMTNIGGIRPNLATWNAVIQAFARTRNVGGAVKAVWSLEKAGFQPDDRTIKAFSMLPRELREHAIAQLEDLRKAPGSFPNAKAPPDSATNPTAPTMKGMHQFSSNDPNQRSKPVIPKTLKALIRQRGKPDIQAIESRSKRRRTLRESRISTLNSPLSVGTLAGLHRETYLEDVESPPPYRKITM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.73
3 0.74
4 0.75
5 0.68
6 0.63
7 0.61
8 0.55
9 0.56
10 0.53
11 0.5
12 0.45
13 0.51
14 0.55
15 0.53
16 0.55
17 0.47
18 0.45
19 0.5
20 0.54
21 0.51
22 0.47
23 0.52
24 0.49
25 0.51
26 0.52
27 0.48
28 0.42
29 0.42
30 0.39
31 0.35
32 0.35
33 0.35
34 0.33
35 0.29
36 0.29
37 0.25
38 0.3
39 0.32
40 0.32
41 0.34
42 0.37
43 0.41
44 0.42
45 0.41
46 0.43
47 0.47
48 0.56
49 0.59
50 0.64
51 0.7
52 0.74
53 0.78
54 0.74
55 0.68
56 0.61
57 0.58
58 0.48
59 0.39
60 0.37
61 0.31
62 0.27
63 0.22
64 0.2
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.12
69 0.2
70 0.22
71 0.24
72 0.3
73 0.32
74 0.38
75 0.44
76 0.52
77 0.52
78 0.59
79 0.6
80 0.55
81 0.58
82 0.59
83 0.55
84 0.48
85 0.46
86 0.43
87 0.43
88 0.42
89 0.39
90 0.33
91 0.35
92 0.35
93 0.32
94 0.3
95 0.31
96 0.32
97 0.34
98 0.34
99 0.32
100 0.31
101 0.29
102 0.24
103 0.2
104 0.2
105 0.18
106 0.15
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.1
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.14
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.23
124 0.27
125 0.27
126 0.26
127 0.27
128 0.25
129 0.23
130 0.23
131 0.21
132 0.17
133 0.15
134 0.12
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.11
148 0.18
149 0.26
150 0.32
151 0.34
152 0.34
153 0.34
154 0.38
155 0.39
156 0.36
157 0.38
158 0.35
159 0.4
160 0.4
161 0.4
162 0.35
163 0.32
164 0.27
165 0.17
166 0.17
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.12
194 0.17
195 0.19
196 0.23
197 0.31
198 0.39
199 0.48
200 0.57
201 0.64
202 0.69
203 0.74
204 0.75
205 0.78
206 0.8
207 0.78
208 0.77
209 0.71
210 0.63
211 0.61
212 0.56
213 0.48
214 0.39
215 0.37
216 0.29
217 0.25
218 0.23
219 0.2
220 0.19
221 0.17
222 0.16
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.14
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.18
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.13
254 0.14
255 0.19
256 0.23
257 0.24
258 0.26
259 0.3
260 0.3
261 0.26
262 0.27
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.31
267 0.3
268 0.33
269 0.34
270 0.36
271 0.36
272 0.35
273 0.34
274 0.27
275 0.24
276 0.23
277 0.21
278 0.16
279 0.12
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.16
294 0.19
295 0.26
296 0.29
297 0.29
298 0.29
299 0.28
300 0.25
301 0.2
302 0.16
303 0.08
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.07
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.15
318 0.15
319 0.16
320 0.14
321 0.12
322 0.15
323 0.2
324 0.19
325 0.18
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.21
330 0.18
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.09
341 0.11
342 0.12
343 0.16
344 0.2
345 0.22
346 0.23
347 0.23
348 0.23
349 0.22
350 0.22
351 0.2
352 0.16
353 0.12
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.17
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.1
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.11
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.12
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.1
423 0.13
424 0.14
425 0.16
426 0.18
427 0.19
428 0.16
429 0.15
430 0.13
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.09
460 0.09
461 0.11
462 0.12
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.09
468 0.08
469 0.06
470 0.05
471 0.06
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.14
480 0.12
481 0.12
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.04
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.08
493 0.1
494 0.15
495 0.22
496 0.31
497 0.38
498 0.47
499 0.57
500 0.65
501 0.73
502 0.79
503 0.83
504 0.84
505 0.88
506 0.9
507 0.88
508 0.85
509 0.78
510 0.68
511 0.6
512 0.49
513 0.41
514 0.32
515 0.23
516 0.21
517 0.18
518 0.18
519 0.15
520 0.14
521 0.14
522 0.14
523 0.18
524 0.16
525 0.16
526 0.16
527 0.17
528 0.17
529 0.15
530 0.18
531 0.14
532 0.13
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.13
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.16
547 0.21
548 0.22
549 0.2
550 0.24
551 0.25
552 0.24
553 0.23
554 0.22
555 0.18
556 0.18
557 0.23
558 0.21
559 0.21
560 0.2
561 0.21
562 0.23
563 0.23
564 0.21
565 0.2
566 0.18
567 0.18
568 0.2
569 0.19
570 0.17
571 0.16
572 0.16
573 0.11
574 0.1
575 0.09
576 0.08
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.05
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.11
588 0.12
589 0.17
590 0.2
591 0.24
592 0.25
593 0.31
594 0.31
595 0.35
596 0.36
597 0.32
598 0.3
599 0.37
600 0.41
601 0.42
602 0.49
603 0.44
604 0.43
605 0.43
606 0.41
607 0.33
608 0.28
609 0.23
610 0.16
611 0.18
612 0.19
613 0.18
614 0.18
615 0.16
616 0.13
617 0.12
618 0.1
619 0.08
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.06
626 0.07
627 0.08
628 0.09
629 0.12
630 0.13
631 0.14
632 0.16
633 0.17
634 0.17
635 0.19
636 0.19
637 0.15
638 0.19
639 0.2
640 0.2
641 0.23
642 0.24
643 0.21
644 0.22
645 0.24
646 0.26
647 0.31
648 0.3
649 0.33
650 0.36
651 0.4
652 0.44
653 0.47
654 0.44
655 0.46
656 0.52
657 0.54
658 0.54
659 0.57
660 0.61
661 0.61
662 0.61
663 0.57
664 0.52
665 0.52
666 0.53
667 0.46
668 0.38
669 0.33
670 0.3
671 0.29
672 0.28
673 0.21
674 0.16
675 0.18
676 0.22
677 0.23
678 0.25
679 0.25
680 0.24
681 0.25
682 0.24
683 0.25
684 0.23
685 0.21
686 0.18
687 0.16
688 0.14
689 0.12
690 0.11
691 0.07
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.04
697 0.06
698 0.06
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.11
703 0.12
704 0.12
705 0.11
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.11
711 0.16
712 0.17
713 0.19
714 0.18
715 0.17
716 0.18
717 0.19
718 0.22
719 0.18
720 0.17
721 0.17
722 0.16
723 0.16
724 0.16
725 0.14
726 0.11
727 0.1
728 0.12
729 0.11
730 0.13
731 0.13
732 0.17
733 0.19
734 0.2
735 0.23
736 0.27
737 0.31
738 0.29
739 0.31
740 0.28
741 0.27
742 0.28
743 0.28
744 0.25
745 0.29
746 0.31
747 0.32
748 0.34
749 0.37
750 0.37
751 0.37
752 0.36
753 0.29
754 0.29
755 0.3
756 0.26
757 0.24
758 0.29
759 0.27
760 0.25
761 0.24
762 0.23
763 0.2
764 0.21
765 0.22
766 0.21
767 0.27
768 0.33
769 0.36
770 0.44
771 0.46
772 0.46
773 0.46
774 0.41
775 0.37
776 0.35
777 0.35
778 0.3
779 0.3
780 0.31
781 0.3
782 0.31
783 0.3
784 0.24
785 0.24
786 0.23
787 0.25
788 0.31
789 0.32
790 0.32
791 0.34
792 0.36
793 0.38
794 0.45
795 0.44
796 0.45
797 0.45
798 0.51
799 0.49
800 0.53
801 0.54
802 0.51
803 0.56
804 0.57
805 0.64
806 0.61
807 0.62
808 0.63
809 0.67
810 0.63
811 0.62
812 0.63
813 0.62
814 0.67
815 0.68
816 0.68
817 0.69
818 0.67
819 0.65
820 0.63
821 0.59
822 0.54
823 0.54
824 0.52
825 0.53
826 0.57
827 0.6
828 0.61
829 0.63
830 0.68
831 0.72
832 0.78
833 0.77
834 0.82
835 0.84
836 0.86
837 0.86
838 0.82
839 0.8
840 0.73
841 0.66
842 0.63
843 0.55
844 0.44
845 0.38
846 0.33
847 0.26
848 0.22
849 0.19
850 0.12
851 0.1
852 0.1
853 0.12
854 0.13
855 0.12
856 0.12
857 0.13
858 0.13
859 0.14
860 0.16
861 0.15
862 0.15
863 0.18
864 0.21
865 0.24
866 0.26
867 0.28
868 0.3