Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V1TM21

Protein Details
Accession A0A1V1TM21    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-312IKKAEFAKRYGHRERRPRLDEYRRDREKBasic
316-345ERNGRYRDSYKSERERERREHNYDHRLRAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-312KPKEAKRRPHLMGLGSKEDEEIKKAEFAKRYGHRERRPRLDEYRRDREK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
Amino Acid Sequences MSDSVLQSKAPRIAIRFGASSSAGPKASDNVKNIRGQSQPSSTLGKRQRPNALYHDSESGEDDENTKGKHKSVTTIGLNTTSRGDNAPTGKEYNKQYVISSQKNQGWKADVKKRRGDGNTVLHTSKNNHNLETAPADQDKDIKWGLNVTKKDAQYGSLSADNEHLEEEKDALRIKAELLQPPRDADRDAVDALLGKRNPQQHLVIKDPAASRRPQFSEQDAYERSMTEAADVSTIEEYSEIPEGEFGAAMLRGMGWTGEEFGAKPKEAKRRPHLMGLGSKEDEEIKKAEFAKRYGHRERRPRLDEYRRDREKETQERNGRYRDSYKSERERERREHNYDHRLRAPYRERDDRGHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.37
4 0.33
5 0.32
6 0.29
7 0.27
8 0.24
9 0.23
10 0.2
11 0.19
12 0.19
13 0.22
14 0.28
15 0.32
16 0.35
17 0.38
18 0.43
19 0.47
20 0.49
21 0.49
22 0.45
23 0.44
24 0.46
25 0.44
26 0.42
27 0.4
28 0.45
29 0.4
30 0.45
31 0.5
32 0.53
33 0.53
34 0.57
35 0.64
36 0.6
37 0.66
38 0.64
39 0.62
40 0.56
41 0.53
42 0.49
43 0.4
44 0.38
45 0.34
46 0.28
47 0.23
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.26
57 0.26
58 0.29
59 0.32
60 0.39
61 0.39
62 0.4
63 0.39
64 0.38
65 0.37
66 0.32
67 0.29
68 0.22
69 0.19
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.19
74 0.21
75 0.21
76 0.24
77 0.25
78 0.29
79 0.32
80 0.34
81 0.36
82 0.34
83 0.32
84 0.37
85 0.43
86 0.43
87 0.43
88 0.43
89 0.43
90 0.48
91 0.48
92 0.42
93 0.4
94 0.39
95 0.45
96 0.48
97 0.51
98 0.53
99 0.59
100 0.6
101 0.63
102 0.6
103 0.57
104 0.55
105 0.56
106 0.54
107 0.5
108 0.48
109 0.4
110 0.39
111 0.37
112 0.35
113 0.36
114 0.32
115 0.29
116 0.3
117 0.29
118 0.3
119 0.3
120 0.24
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.19
133 0.24
134 0.24
135 0.27
136 0.32
137 0.32
138 0.34
139 0.3
140 0.28
141 0.22
142 0.22
143 0.19
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.16
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.13
163 0.14
164 0.18
165 0.21
166 0.24
167 0.24
168 0.25
169 0.26
170 0.21
171 0.19
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.12
182 0.12
183 0.16
184 0.2
185 0.22
186 0.23
187 0.27
188 0.29
189 0.33
190 0.36
191 0.35
192 0.31
193 0.33
194 0.32
195 0.3
196 0.27
197 0.26
198 0.23
199 0.27
200 0.31
201 0.3
202 0.31
203 0.32
204 0.36
205 0.34
206 0.38
207 0.33
208 0.31
209 0.28
210 0.25
211 0.22
212 0.16
213 0.15
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.18
252 0.23
253 0.34
254 0.41
255 0.51
256 0.54
257 0.62
258 0.65
259 0.69
260 0.67
261 0.62
262 0.61
263 0.57
264 0.53
265 0.44
266 0.41
267 0.33
268 0.33
269 0.27
270 0.23
271 0.19
272 0.15
273 0.19
274 0.23
275 0.28
276 0.29
277 0.31
278 0.38
279 0.44
280 0.52
281 0.59
282 0.66
283 0.7
284 0.76
285 0.83
286 0.84
287 0.81
288 0.8
289 0.8
290 0.8
291 0.81
292 0.8
293 0.81
294 0.78
295 0.77
296 0.74
297 0.73
298 0.72
299 0.73
300 0.72
301 0.72
302 0.74
303 0.78
304 0.8
305 0.78
306 0.71
307 0.66
308 0.64
309 0.61
310 0.61
311 0.6
312 0.64
313 0.68
314 0.73
315 0.78
316 0.81
317 0.83
318 0.83
319 0.85
320 0.85
321 0.82
322 0.83
323 0.82
324 0.84
325 0.82
326 0.81
327 0.78
328 0.75
329 0.7
330 0.7
331 0.69
332 0.68
333 0.69
334 0.72
335 0.69