Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TAV6

Protein Details
Accession A0A1V1TAV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-60GPSSSSLKAQKPPRPRKRSLPKQGVPASTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-53AQKPPRPRKRSLPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 12.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
IPR047288  Tudor_SGF29_rpt1  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
CDD cd20393  Tudor_SGF29_rpt1  
Amino Acid Sequences MGKVVKEDVIKDVIKDVIKVRTSLDDPSEQAGPSSSSLKAQKPPRPRKRSLPKQGVPASTASAMSSRGNQRRGPNRNNEITQHGEELAAWKEVKDQLPGLLDMFNQSSVNTAAIHDQDKLCAEKKKSKALTQDDLDKLDQLSRQGVKINESTAQAFKDKIEKIKVLRAIAKHNEENQEVTSSRLGGQRKDPWDFNPDDSPMPSPNPSVSRRVGGGGGSSKGDRGDSVPPKFPDRSTPAAKAGSAEPQPGPASNPIRTKQIFAKDDEVAFKPKPTGNEQTDWILGIVQEVRGEGKSRRYRVLDADFDENQNHHQKDFRTSASSMILIPKEGTVLPPLDEGKVVLALYPATTTFYKAEVMGMDGSEKVNLKFEGEESSNTMQAVTRRHVVEYRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.27
4 0.3
5 0.31
6 0.31
7 0.3
8 0.32
9 0.33
10 0.34
11 0.35
12 0.3
13 0.3
14 0.32
15 0.32
16 0.25
17 0.24
18 0.21
19 0.18
20 0.17
21 0.18
22 0.15
23 0.19
24 0.25
25 0.3
26 0.37
27 0.44
28 0.51
29 0.6
30 0.7
31 0.76
32 0.8
33 0.82
34 0.85
35 0.87
36 0.9
37 0.9
38 0.9
39 0.85
40 0.85
41 0.85
42 0.76
43 0.67
44 0.57
45 0.48
46 0.38
47 0.33
48 0.23
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.2
53 0.26
54 0.32
55 0.37
56 0.41
57 0.5
58 0.58
59 0.67
60 0.69
61 0.71
62 0.72
63 0.76
64 0.74
65 0.68
66 0.63
67 0.59
68 0.52
69 0.43
70 0.35
71 0.27
72 0.23
73 0.23
74 0.19
75 0.15
76 0.13
77 0.11
78 0.15
79 0.19
80 0.21
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.21
85 0.22
86 0.19
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.18
107 0.19
108 0.24
109 0.28
110 0.34
111 0.39
112 0.48
113 0.51
114 0.54
115 0.59
116 0.6
117 0.62
118 0.57
119 0.6
120 0.51
121 0.49
122 0.44
123 0.35
124 0.28
125 0.23
126 0.21
127 0.14
128 0.17
129 0.15
130 0.16
131 0.19
132 0.2
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.17
140 0.18
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.19
145 0.2
146 0.22
147 0.25
148 0.27
149 0.28
150 0.34
151 0.36
152 0.32
153 0.34
154 0.32
155 0.35
156 0.37
157 0.4
158 0.36
159 0.37
160 0.37
161 0.34
162 0.33
163 0.27
164 0.24
165 0.19
166 0.18
167 0.14
168 0.11
169 0.13
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.21
174 0.26
175 0.29
176 0.32
177 0.31
178 0.29
179 0.33
180 0.33
181 0.3
182 0.26
183 0.24
184 0.22
185 0.21
186 0.2
187 0.16
188 0.16
189 0.14
190 0.12
191 0.13
192 0.17
193 0.19
194 0.22
195 0.22
196 0.22
197 0.21
198 0.22
199 0.2
200 0.15
201 0.15
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.16
212 0.22
213 0.25
214 0.3
215 0.32
216 0.36
217 0.37
218 0.35
219 0.34
220 0.33
221 0.37
222 0.36
223 0.37
224 0.37
225 0.37
226 0.36
227 0.3
228 0.26
229 0.24
230 0.21
231 0.19
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.18
238 0.21
239 0.24
240 0.3
241 0.29
242 0.35
243 0.36
244 0.37
245 0.37
246 0.42
247 0.4
248 0.37
249 0.4
250 0.35
251 0.36
252 0.36
253 0.32
254 0.27
255 0.25
256 0.23
257 0.22
258 0.22
259 0.24
260 0.27
261 0.34
262 0.34
263 0.36
264 0.37
265 0.37
266 0.35
267 0.32
268 0.26
269 0.17
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.11
279 0.13
280 0.22
281 0.3
282 0.34
283 0.4
284 0.42
285 0.45
286 0.5
287 0.55
288 0.5
289 0.45
290 0.47
291 0.42
292 0.4
293 0.38
294 0.31
295 0.29
296 0.31
297 0.29
298 0.24
299 0.28
300 0.28
301 0.35
302 0.39
303 0.37
304 0.34
305 0.34
306 0.35
307 0.33
308 0.31
309 0.25
310 0.25
311 0.22
312 0.18
313 0.18
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.15
322 0.16
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.13
328 0.12
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.1
336 0.11
337 0.13
338 0.13
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.13
344 0.15
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.15
352 0.13
353 0.17
354 0.17
355 0.17
356 0.18
357 0.19
358 0.23
359 0.23
360 0.24
361 0.26
362 0.28
363 0.28
364 0.26
365 0.26
366 0.22
367 0.23
368 0.27
369 0.26
370 0.3
371 0.3
372 0.34