FuNGI

A0A1V1SQC3

Protein Details

Accession

A0A1V1SQC3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
446-465	QSGRFEKWKKEQRVGRLPRI	Hydrophilic
482-506	TIGGGPRYKHKQEKAPKAADKYRDD	Basic
538-561	ADDVRKERKLKELRRQKNARPSRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-561	EKWKKEQRVGRLPRIGEAERRGPGSGARGGNTIGGGPRYKHKQEKAPKAADKYRDDYHVRKKRVAEAKDKRVGRFRDGDGNKKELKNADDVRKERKLKELRRQKNARPSRK

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, nucl 10, cyto_mito 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012541 DBP10_C IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity
Pfam	View protein in Pfam PF08147 DBP10CT PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MLTHAGFAVSYVYGSLDQTARKSQVENFRRGMTNILVVTDVAARGIDIPLLSNAINYSFPATPKLYIHRVGRVARAGMRGWAYSLVKATDVPYLLDLQLFLGQKLVLGKEGKGAPSFTTDMIVGAPVRSQVENYSEWLNKLLADEVDLTAQQRVSDKAEKLYLKTRNSASSQSARRSREVISSKGFSQVHPLYGDEVSAAEDNRAEMLAKVSGFKPQETIFEIGRATKGGRNKQAEVMKTIRDRFGPRRTTNRDEDNEELGSDEDEDDPAAEVFDVEIDEDEKEASDNAQVEEEDEEDDDDEELADSDSEMEVTISNHNDDNAKARKASGRASGTHDFRDPEFMAYEPRTVNAAETRGYGVHSGGQSNSSGNFFEAARSATFDLTNDEGAKSFGAPTRAGMRWDKKNSKYVSRTNDEDGSRSQAKGKGGVKMVRGESGVKIASSFQSGRFEKWKKEQRVGRLPRIGEAERRGPGSGARGGNTIGGGPRYKHKQEKAPKAADKYRDDYHVRKKRVAEAKDKRVGRFRDGDGNKKELKNADDVRKERKLKELRRQKNARPSRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.12
3	0.13
4	0.15
5	0.18
6	0.24
7	0.26
8	0.27
9	0.3
10	0.34
11	0.43
12	0.48
13	0.52
14	0.5
15	0.53
16	0.54
17	0.52
18	0.49
19	0.4
20	0.38
21	0.31
22	0.27
23	0.22
24	0.19
25	0.19
26	0.16
27	0.14
28	0.08
29	0.08
30	0.07
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.06
35	0.08
36	0.08
37	0.1
38	0.1
39	0.09
40	0.1
41	0.1
42	0.11
43	0.1
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.19
48	0.21
49	0.22
50	0.25
51	0.31
52	0.32
53	0.37
54	0.4
55	0.43
56	0.48
57	0.48
58	0.49
59	0.46
60	0.44
61	0.41
62	0.4
63	0.34
64	0.31
65	0.3
66	0.25
67	0.22
68	0.24
69	0.22
70	0.2
71	0.21
72	0.18
73	0.17
74	0.17
75	0.18
76	0.16
77	0.15
78	0.14
79	0.14
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.12
84	0.1
85	0.14
86	0.14
87	0.12
88	0.12
89	0.11
90	0.12
91	0.14
92	0.14
93	0.13
94	0.14
95	0.14
96	0.19
97	0.21
98	0.22
99	0.22
100	0.22
101	0.19
102	0.22
103	0.23
104	0.18
105	0.17
106	0.15
107	0.14
108	0.13
109	0.13
110	0.09
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.1
115	0.09
116	0.1
117	0.11
118	0.14
119	0.15
120	0.17
121	0.21
122	0.2
123	0.21
124	0.22
125	0.2
126	0.16
127	0.16
128	0.16
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.11
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.12
141	0.16
142	0.22
143	0.22
144	0.24
145	0.3
146	0.31
147	0.33
148	0.39
149	0.41
150	0.38
151	0.42
152	0.42
153	0.4
154	0.42
155	0.42
156	0.4
157	0.41
158	0.44
159	0.47
160	0.51
161	0.49
162	0.49
163	0.47
164	0.43
165	0.44
166	0.43
167	0.39
168	0.37
169	0.36
170	0.35
171	0.39
172	0.38
173	0.29
174	0.32
175	0.29
176	0.26
177	0.25
178	0.24
179	0.19
180	0.19
181	0.19
182	0.11
183	0.09
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.09
198	0.09
199	0.14
200	0.15
201	0.15
202	0.16
203	0.15
204	0.17
205	0.19
206	0.21
207	0.16
208	0.17
209	0.17
210	0.15
211	0.15
212	0.13
213	0.11
214	0.12
215	0.18
216	0.23
217	0.31
218	0.34
219	0.36
220	0.42
221	0.45
222	0.43
223	0.42
224	0.38
225	0.34
226	0.34
227	0.34
228	0.29
229	0.28
230	0.32
231	0.35
232	0.41
233	0.45
234	0.45
235	0.54
236	0.59
237	0.63
238	0.63
239	0.63
240	0.57
241	0.53
242	0.51
243	0.44
244	0.36
245	0.3
246	0.25
247	0.17
248	0.14
249	0.1
250	0.08
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.04
300	0.05
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.16
309	0.18
310	0.19
311	0.18
312	0.2
313	0.23
314	0.25
315	0.28
316	0.28
317	0.27
318	0.28
319	0.35
320	0.39
321	0.37
322	0.36
323	0.34
324	0.28
325	0.25
326	0.28
327	0.22
328	0.18
329	0.16
330	0.15
331	0.17
332	0.17
333	0.19
334	0.14
335	0.13
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.13
341	0.11
342	0.12
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.09
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.09
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.09
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.12
382	0.12
383	0.13
384	0.18
385	0.2
386	0.23
387	0.28
388	0.33
389	0.4
390	0.5
391	0.57
392	0.56
393	0.63
394	0.65
395	0.67
396	0.69
397	0.67
398	0.66
399	0.63
400	0.62
401	0.58
402	0.59
403	0.5
404	0.45
405	0.38
406	0.36
407	0.33
408	0.3
409	0.29
410	0.27
411	0.28
412	0.33
413	0.34
414	0.33
415	0.37
416	0.4
417	0.39
418	0.4
419	0.4
420	0.34
421	0.33
422	0.28
423	0.23
424	0.23
425	0.2
426	0.15
427	0.14
428	0.13
429	0.13
430	0.16
431	0.16
432	0.15
433	0.24
434	0.25
435	0.28
436	0.37
437	0.41
438	0.44
439	0.54
440	0.61
441	0.6
442	0.69
443	0.71
444	0.72
445	0.78
446	0.8
447	0.79
448	0.76
449	0.69
450	0.64
451	0.63
452	0.55
453	0.5
454	0.47
455	0.43
456	0.39
457	0.4
458	0.36
459	0.3
460	0.29
461	0.28
462	0.29
463	0.25
464	0.24
465	0.23
466	0.23
467	0.23
468	0.22
469	0.18
470	0.13
471	0.14
472	0.15
473	0.16
474	0.23
475	0.31
476	0.38
477	0.46
478	0.52
479	0.59
480	0.68
481	0.78
482	0.8
483	0.82
484	0.82
485	0.81
486	0.82
487	0.8
488	0.76
489	0.7
490	0.64
491	0.61
492	0.6
493	0.6
494	0.64
495	0.65
496	0.64
497	0.65
498	0.65
499	0.68
500	0.72
501	0.71
502	0.71
503	0.71
504	0.76
505	0.79
506	0.79
507	0.74
508	0.74
509	0.71
510	0.67
511	0.64
512	0.57
513	0.59
514	0.61
515	0.65
516	0.61
517	0.64
518	0.63
519	0.58
520	0.58
521	0.53
522	0.5
523	0.5
524	0.53
525	0.56
526	0.59
527	0.62
528	0.66
529	0.7
530	0.73
531	0.67
532	0.69
533	0.69
534	0.7
535	0.77
536	0.79
537	0.8
538	0.84
539	0.91
540	0.9
541	0.91

A0A1V1SQC3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer