FuNGI

A0A1V1THF0

Protein Details

Accession

A0A1V1THF0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
430-451	AEQLFQRQWRWHKKLKIWLTKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038635 CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf IPR040168 Not2/3/5 IPR007282 NOT2/3/5_C
Gene Ontology	GO:0030015 C:CCR4-NOT core complex GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04153 NOT2_3_5

Amino Acid Sequences

MNRPGAVPQTLRGMPTGFGSQPQQQQPQQPGRAGSNRLPNGKIASNAGGWAFGGNVPMGSGAAASSLQNPPRQLGGNLSFAQSLGSQPTTSLDLSEFPSLSNNSQLSSGNPSSLWAGGSRPMGAAIQRNQPTPHSQPSQQDDFFSSSRMNTNQAAFRFGNQASMSQSSQPQPSSIDEFPPLNNSLRNGDGDISQERGSNLMSTLGFGAQGNAAVGSLQGTRAGNGLLNALSANSRTTDVRSPDGTTALDLSRSQDMRSSNDEARQKPPGFRDDALPSQSPKDPVQPSEGRNPLGAIGTNEIQSGKNKDNEEVQSPAVRDPLTGMTEIDKWGIKGLRTLMTNYPDYAACVTGMDPTGFGLDLSSPAMISTQIWSPFNDTPPRPAIPDFRLPDCYKVNNVQPLRNKISNFNEETLMWIFYSCPGDYQQHLAAEQLFQRQWRWHKKLKIWLTKDDIMHPRILSTQHEEGYYIVWNTEEWRKERRQLTLHYADLETNPNTGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.25
4	0.18
5	0.2
6	0.24
7	0.29
8	0.36
9	0.42
10	0.47
11	0.47
12	0.54
13	0.61
14	0.67
15	0.65
16	0.61
17	0.58
18	0.58
19	0.6
20	0.58
21	0.54
22	0.55
23	0.56
24	0.57
25	0.54
26	0.49
27	0.47
28	0.44
29	0.4
30	0.33
31	0.3
32	0.26
33	0.26
34	0.23
35	0.18
36	0.15
37	0.13
38	0.1
39	0.08
40	0.08
41	0.07
42	0.07
43	0.06
44	0.07
45	0.06
46	0.06
47	0.05
48	0.04
49	0.05
50	0.05
51	0.06
52	0.09
53	0.14
54	0.18
55	0.21
56	0.22
57	0.23
58	0.26
59	0.28
60	0.25
61	0.28
62	0.28
63	0.31
64	0.31
65	0.31
66	0.27
67	0.25
68	0.25
69	0.18
70	0.15
71	0.12
72	0.13
73	0.11
74	0.11
75	0.13
76	0.15
77	0.15
78	0.14
79	0.12
80	0.12
81	0.15
82	0.17
83	0.15
84	0.13
85	0.16
86	0.18
87	0.18
88	0.21
89	0.19
90	0.17
91	0.19
92	0.19
93	0.17
94	0.23
95	0.23
96	0.18
97	0.18
98	0.18
99	0.18
100	0.18
101	0.16
102	0.09
103	0.1
104	0.13
105	0.14
106	0.13
107	0.12
108	0.12
109	0.12
110	0.13
111	0.18
112	0.19
113	0.27
114	0.29
115	0.31
116	0.32
117	0.33
118	0.38
119	0.37
120	0.41
121	0.37
122	0.4
123	0.44
124	0.5
125	0.54
126	0.48
127	0.44
128	0.39
129	0.38
130	0.34
131	0.28
132	0.22
133	0.17
134	0.2
135	0.2
136	0.2
137	0.18
138	0.21
139	0.25
140	0.24
141	0.29
142	0.25
143	0.26
144	0.27
145	0.25
146	0.26
147	0.21
148	0.22
149	0.19
150	0.21
151	0.21
152	0.18
153	0.21
154	0.2
155	0.22
156	0.21
157	0.19
158	0.18
159	0.2
160	0.24
161	0.21
162	0.21
163	0.2
164	0.2
165	0.2
166	0.21
167	0.21
168	0.16
169	0.17
170	0.16
171	0.16
172	0.17
173	0.17
174	0.15
175	0.14
176	0.13
177	0.15
178	0.14
179	0.14
180	0.13
181	0.13
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.09
186	0.09
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.04
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.07
223	0.09
224	0.13
225	0.15
226	0.17
227	0.18
228	0.19
229	0.19
230	0.19
231	0.17
232	0.13
233	0.12
234	0.1
235	0.09
236	0.08
237	0.09
238	0.11
239	0.12
240	0.11
241	0.13
242	0.15
243	0.17
244	0.21
245	0.24
246	0.22
247	0.28
248	0.33
249	0.32
250	0.34
251	0.38
252	0.35
253	0.34
254	0.36
255	0.34
256	0.33
257	0.31
258	0.32
259	0.29
260	0.3
261	0.3
262	0.28
263	0.25
264	0.24
265	0.25
266	0.24
267	0.2
268	0.25
269	0.23
270	0.24
271	0.3
272	0.32
273	0.33
274	0.38
275	0.4
276	0.33
277	0.32
278	0.3
279	0.24
280	0.2
281	0.18
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.12
290	0.15
291	0.17
292	0.21
293	0.22
294	0.23
295	0.28
296	0.29
297	0.3
298	0.28
299	0.26
300	0.23
301	0.23
302	0.23
303	0.19
304	0.17
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.13
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.13
313	0.13
314	0.13
315	0.11
316	0.09
317	0.13
318	0.14
319	0.13
320	0.14
321	0.17
322	0.19
323	0.2
324	0.23
325	0.24
326	0.26
327	0.26
328	0.24
329	0.23
330	0.19
331	0.19
332	0.17
333	0.13
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.1
357	0.13
358	0.14
359	0.15
360	0.2
361	0.22
362	0.27
363	0.33
364	0.3
365	0.32
366	0.36
367	0.37
368	0.34
369	0.34
370	0.35
371	0.33
372	0.41
373	0.4
374	0.38
375	0.44
376	0.43
377	0.45
378	0.43
379	0.41
380	0.36
381	0.38
382	0.41
383	0.44
384	0.46
385	0.47
386	0.51
387	0.57
388	0.6
389	0.59
390	0.55
391	0.53
392	0.58
393	0.58
394	0.54
395	0.48
396	0.43
397	0.38
398	0.4
399	0.33
400	0.26
401	0.18
402	0.14
403	0.13
404	0.14
405	0.17
406	0.13
407	0.13
408	0.16
409	0.19
410	0.2
411	0.24
412	0.25
413	0.23
414	0.23
415	0.23
416	0.21
417	0.21
418	0.22
419	0.23
420	0.21
421	0.21
422	0.24
423	0.31
424	0.41
425	0.49
426	0.55
427	0.59
428	0.67
429	0.74
430	0.81
431	0.84
432	0.85
433	0.8
434	0.8
435	0.78
436	0.75
437	0.68
438	0.66
439	0.63
440	0.54
441	0.52
442	0.43
443	0.36
444	0.34
445	0.34
446	0.3
447	0.29
448	0.32
449	0.3
450	0.31
451	0.3
452	0.27
453	0.26
454	0.25
455	0.18
456	0.13
457	0.11
458	0.11
459	0.15
460	0.22
461	0.26
462	0.27
463	0.35
464	0.42
465	0.51
466	0.56
467	0.62
468	0.62
469	0.64
470	0.7
471	0.7
472	0.65
473	0.6
474	0.55
475	0.48
476	0.42
477	0.4
478	0.31

A0A1V1THF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer