Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1T1Y7

Protein Details
Accession A0A1V1T1Y7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
499-523QSAEEGRLKKRQKRLEKLAEKDKEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
505-518RLKKRQKRLEKLAE
553-559KKEGKKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.333, mito 4.5, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSHPQPSIAQRQFSPPQATSPSPSNATGAGGFSAPPPAKRPKVSLAPQPSQPNSPYGNSTPYAASPTPGVVTPTAATGVSSPLGNMAATTTTTTTTVTQQSQAPQGQYNPSHQPNGRPASMAPVQPSLVQSPTPTPTPSQPPAQPLQQPFPAIQSPHQILTPATNHSPHQYSHAQLALNHPNAMPATSDMPPPTMHASNAFSAASDVAKQPSRPGGSNKTTAYEMNDMLMGTGIDLEEEAEYMNNLETRTGFPHLPSGGRDSFYGAGPANQSAEPIDEKSQEEYAVIAADRAWNEAAHRLAVTRSQEMRQHLLEPGILHKRMHEVAQKFGLGLNLDLKPDGRSQYMGKFAHPTEFPKPELRVTSSPAPDNTGAMVRTLGSFIPKEAFLVDQIALLSIGTKERLRDLLGDANKIAGTRQKSSHGAVPTEWIDAAAPLSPQVNGTHDEGTRIGGESAVSPRTNPLKRPLDELNNGLPTPVSEVSTPNYLIESLLEIGKQSQSAEEGRLKKRQKRLEKLAEKDKEGAEASSRSGSVAPGTPGSIAPDGGDGKSLSKKEGKKAAAKAAESSSGTTVNATLSLFTGGKKKKYSWMNSGAGSGASTPRPQSNSGAPSAAGGSAAKAGRGPLTRAGVQHLGQFREDSEKGKNIQLRDWIVVLEDRGLDPRSLQIAYDKVDRSDTGEKVATEKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.46
3 0.47
4 0.49
5 0.5
6 0.46
7 0.46
8 0.43
9 0.4
10 0.39
11 0.35
12 0.29
13 0.28
14 0.25
15 0.2
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.24
24 0.33
25 0.4
26 0.44
27 0.49
28 0.5
29 0.59
30 0.64
31 0.68
32 0.68
33 0.66
34 0.69
35 0.71
36 0.66
37 0.61
38 0.55
39 0.51
40 0.45
41 0.43
42 0.41
43 0.35
44 0.37
45 0.33
46 0.33
47 0.29
48 0.26
49 0.3
50 0.24
51 0.22
52 0.18
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.18
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.15
83 0.2
84 0.2
85 0.22
86 0.24
87 0.27
88 0.33
89 0.34
90 0.32
91 0.31
92 0.32
93 0.36
94 0.36
95 0.38
96 0.4
97 0.4
98 0.45
99 0.44
100 0.47
101 0.49
102 0.53
103 0.48
104 0.41
105 0.38
106 0.38
107 0.41
108 0.36
109 0.29
110 0.26
111 0.25
112 0.25
113 0.27
114 0.22
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.18
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.25
124 0.33
125 0.35
126 0.37
127 0.37
128 0.41
129 0.43
130 0.46
131 0.47
132 0.44
133 0.45
134 0.42
135 0.4
136 0.35
137 0.35
138 0.33
139 0.28
140 0.26
141 0.28
142 0.27
143 0.27
144 0.26
145 0.23
146 0.2
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.25
154 0.27
155 0.23
156 0.27
157 0.26
158 0.25
159 0.27
160 0.29
161 0.26
162 0.24
163 0.31
164 0.33
165 0.31
166 0.3
167 0.26
168 0.25
169 0.24
170 0.24
171 0.17
172 0.11
173 0.13
174 0.13
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.17
184 0.19
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.2
199 0.23
200 0.25
201 0.3
202 0.35
203 0.38
204 0.43
205 0.42
206 0.38
207 0.37
208 0.34
209 0.32
210 0.26
211 0.21
212 0.16
213 0.16
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.07
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.11
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.2
245 0.19
246 0.19
247 0.19
248 0.18
249 0.18
250 0.16
251 0.17
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.08
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.1
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.18
293 0.22
294 0.24
295 0.27
296 0.24
297 0.24
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.14
302 0.16
303 0.18
304 0.18
305 0.16
306 0.16
307 0.18
308 0.18
309 0.21
310 0.23
311 0.2
312 0.22
313 0.23
314 0.23
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.15
332 0.22
333 0.21
334 0.2
335 0.22
336 0.22
337 0.23
338 0.23
339 0.24
340 0.22
341 0.24
342 0.25
343 0.26
344 0.27
345 0.26
346 0.27
347 0.28
348 0.24
349 0.26
350 0.3
351 0.28
352 0.28
353 0.26
354 0.27
355 0.22
356 0.21
357 0.17
358 0.13
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.13
393 0.19
394 0.2
395 0.2
396 0.19
397 0.19
398 0.18
399 0.17
400 0.15
401 0.12
402 0.14
403 0.16
404 0.18
405 0.22
406 0.24
407 0.26
408 0.31
409 0.29
410 0.27
411 0.24
412 0.25
413 0.22
414 0.2
415 0.18
416 0.13
417 0.1
418 0.08
419 0.09
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.07
427 0.09
428 0.1
429 0.12
430 0.15
431 0.14
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.12
437 0.1
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.15
446 0.23
447 0.26
448 0.27
449 0.34
450 0.41
451 0.42
452 0.47
453 0.49
454 0.48
455 0.48
456 0.49
457 0.44
458 0.38
459 0.36
460 0.31
461 0.25
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.12
466 0.1
467 0.12
468 0.14
469 0.16
470 0.17
471 0.13
472 0.12
473 0.11
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.09
487 0.11
488 0.15
489 0.21
490 0.28
491 0.32
492 0.41
493 0.48
494 0.54
495 0.62
496 0.68
497 0.72
498 0.75
499 0.81
500 0.83
501 0.85
502 0.86
503 0.87
504 0.81
505 0.73
506 0.66
507 0.55
508 0.47
509 0.38
510 0.31
511 0.24
512 0.2
513 0.19
514 0.17
515 0.16
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.12
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.15
527 0.13
528 0.11
529 0.1
530 0.12
531 0.13
532 0.12
533 0.13
534 0.11
535 0.13
536 0.18
537 0.19
538 0.2
539 0.27
540 0.32
541 0.38
542 0.47
543 0.5
544 0.53
545 0.58
546 0.64
547 0.62
548 0.58
549 0.54
550 0.47
551 0.45
552 0.37
553 0.33
554 0.25
555 0.2
556 0.19
557 0.16
558 0.14
559 0.1
560 0.1
561 0.09
562 0.08
563 0.07
564 0.1
565 0.1
566 0.11
567 0.2
568 0.24
569 0.3
570 0.34
571 0.36
572 0.42
573 0.51
574 0.58
575 0.58
576 0.62
577 0.61
578 0.58
579 0.56
580 0.48
581 0.39
582 0.31
583 0.23
584 0.17
585 0.14
586 0.15
587 0.16
588 0.2
589 0.23
590 0.25
591 0.28
592 0.33
593 0.36
594 0.36
595 0.35
596 0.3
597 0.28
598 0.27
599 0.22
600 0.15
601 0.1
602 0.09
603 0.12
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.12
608 0.17
609 0.19
610 0.22
611 0.23
612 0.28
613 0.31
614 0.31
615 0.36
616 0.35
617 0.33
618 0.36
619 0.36
620 0.33
621 0.31
622 0.31
623 0.27
624 0.3
625 0.31
626 0.28
627 0.29
628 0.33
629 0.34
630 0.41
631 0.44
632 0.39
633 0.42
634 0.47
635 0.45
636 0.41
637 0.39
638 0.32
639 0.3
640 0.29
641 0.25
642 0.19
643 0.16
644 0.14
645 0.17
646 0.18
647 0.17
648 0.15
649 0.19
650 0.2
651 0.19
652 0.19
653 0.21
654 0.23
655 0.26
656 0.33
657 0.31
658 0.29
659 0.31
660 0.31
661 0.33
662 0.36
663 0.34
664 0.32
665 0.33
666 0.32