Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TMV3

Protein Details
Accession A0A1V1TMV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-257SLRSAKRRRKLEVSKKKRIQRNKDSGRMLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-258SAKRRRKLEVSKKKRIQRNKDSGRMLK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Amino Acid Sequences MVSKTRLYWDSGDSDEDINISMIPKASTSARPLSPLPVSMQKGDTEISSTASSMTALHTLSSASEAINHVNLEFGVVSEKGCAFVPFKLVRDYPHMYVGKSNQKKVVEFFKEALFKGRTWDFFSQSDPTATHGPLLLVPTIQFELFLNIANHQLGGNLTIPKGSTGERFSLTFGEWDTPLPRFLGRADSASAVDALKARSHMLPADDLSHLAPSCYQRYRDKMDEINTSLRSAKRRRKLEVSKKKRIQRNKDSGRMLKRVQRYLGLRQAISHVPSDSLTTVGWDALKPAPFKPRESVRFVCVDAEAYEKDTRVVTEIGLAVLDTEDLIDTCPGERGENWFPLVQAHHFRVEERRYMVNSKYVQGCPEAFNFGESQMISIKDINQVVGKVFNDEGCEDPRPIIIVGHDIRQDLKYLMRIGYDPWEVPLIVDEVDTKAMFQRIERNLDGRGLGMICAKLGIPGDNYHNAGNDAVYTLRAMITMAIKRTIEGLDKKEDPFAPGTDEWTDGDFDDGGCPKRSAPPANKDTGAQSKDESGNVRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.21
4 0.17
5 0.13
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.12
13 0.16
14 0.19
15 0.24
16 0.29
17 0.3
18 0.33
19 0.34
20 0.37
21 0.36
22 0.33
23 0.33
24 0.34
25 0.36
26 0.35
27 0.35
28 0.31
29 0.3
30 0.29
31 0.25
32 0.2
33 0.17
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.1
50 0.07
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.2
73 0.21
74 0.23
75 0.27
76 0.28
77 0.29
78 0.35
79 0.38
80 0.33
81 0.39
82 0.38
83 0.34
84 0.38
85 0.43
86 0.46
87 0.48
88 0.49
89 0.47
90 0.49
91 0.5
92 0.49
93 0.52
94 0.47
95 0.44
96 0.42
97 0.42
98 0.42
99 0.4
100 0.43
101 0.35
102 0.29
103 0.31
104 0.33
105 0.29
106 0.32
107 0.36
108 0.32
109 0.31
110 0.34
111 0.33
112 0.29
113 0.29
114 0.23
115 0.22
116 0.22
117 0.2
118 0.18
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.12
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.07
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.17
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.15
202 0.18
203 0.22
204 0.25
205 0.3
206 0.37
207 0.39
208 0.41
209 0.41
210 0.42
211 0.42
212 0.4
213 0.4
214 0.34
215 0.31
216 0.3
217 0.28
218 0.31
219 0.35
220 0.41
221 0.46
222 0.51
223 0.56
224 0.63
225 0.71
226 0.76
227 0.78
228 0.79
229 0.81
230 0.83
231 0.86
232 0.83
233 0.83
234 0.82
235 0.81
236 0.83
237 0.8
238 0.81
239 0.79
240 0.78
241 0.74
242 0.69
243 0.61
244 0.56
245 0.53
246 0.48
247 0.43
248 0.41
249 0.38
250 0.39
251 0.42
252 0.37
253 0.32
254 0.29
255 0.3
256 0.26
257 0.24
258 0.19
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.07
272 0.08
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.21
277 0.23
278 0.25
279 0.29
280 0.35
281 0.37
282 0.44
283 0.44
284 0.39
285 0.39
286 0.37
287 0.33
288 0.24
289 0.2
290 0.13
291 0.13
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.03
311 0.02
312 0.02
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.13
323 0.17
324 0.18
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.19
329 0.2
330 0.17
331 0.18
332 0.18
333 0.2
334 0.2
335 0.21
336 0.27
337 0.29
338 0.3
339 0.29
340 0.3
341 0.3
342 0.33
343 0.33
344 0.33
345 0.31
346 0.31
347 0.33
348 0.3
349 0.29
350 0.28
351 0.27
352 0.23
353 0.22
354 0.21
355 0.16
356 0.16
357 0.15
358 0.13
359 0.13
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.14
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.16
374 0.15
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.18
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.15
388 0.13
389 0.1
390 0.15
391 0.16
392 0.19
393 0.2
394 0.19
395 0.2
396 0.2
397 0.21
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.17
406 0.21
407 0.21
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.16
412 0.15
413 0.15
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.22
427 0.26
428 0.32
429 0.34
430 0.33
431 0.32
432 0.34
433 0.32
434 0.24
435 0.2
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.13
448 0.18
449 0.21
450 0.23
451 0.22
452 0.22
453 0.22
454 0.2
455 0.17
456 0.13
457 0.11
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.13
467 0.17
468 0.18
469 0.21
470 0.21
471 0.22
472 0.23
473 0.23
474 0.25
475 0.28
476 0.3
477 0.34
478 0.38
479 0.39
480 0.42
481 0.41
482 0.37
483 0.34
484 0.31
485 0.3
486 0.27
487 0.29
488 0.25
489 0.26
490 0.23
491 0.22
492 0.21
493 0.15
494 0.16
495 0.13
496 0.11
497 0.14
498 0.17
499 0.19
500 0.21
501 0.22
502 0.22
503 0.3
504 0.37
505 0.43
506 0.48
507 0.56
508 0.6
509 0.66
510 0.66
511 0.59
512 0.59
513 0.59
514 0.51
515 0.43
516 0.37
517 0.38
518 0.39
519 0.4