Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TVA4

Protein Details
Accession A0A1V1TVA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
404-427AQGQPGVARRRPPRKPSQAITLTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
Amino Acid Sequences MDTHRDSFDGDEEGAVRYAIALSLQDHNALTSHSTAQNPIEVENSGNEDDDLDNGPKCPPTPKKPIQLIDGNVKAPMTSHSLLVPQTTTSGIQSSGFAALGFDRKKMEEERLARLTKRKAPHDDEIPKRCPQRVKIDRQPGGIPLKTTADTSIGTKSPQLPYLKGVVRKTWASGYPRQDDIKIEEILQKDHLELAVLSSFQWDDEWLLSKIDTKKTKMICIAFASSDYQKEQMRANVPRDRIRFCFPPMMPAGSMHSKLQLLKFPNYLRLVIPTGNLVPYDWGETGIMENMVFLIDLPMTKDSANQLTMFGQELFYFLKASGLDENLINSLSKYDFSETNRYRFIHTIGQSHVGEAWQRTGYCGLGRAVKSLGLATASKIELDFVVASLGSVNTDLTSAIYNAAQGQPGVARRRPPRKPSQAITLTTFVSTSLLTRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.11
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.06
9 0.09
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.16
20 0.19
21 0.2
22 0.22
23 0.23
24 0.25
25 0.24
26 0.23
27 0.21
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.25
46 0.31
47 0.38
48 0.48
49 0.56
50 0.64
51 0.72
52 0.75
53 0.73
54 0.71
55 0.67
56 0.65
57 0.6
58 0.5
59 0.42
60 0.37
61 0.3
62 0.23
63 0.21
64 0.18
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.19
69 0.19
70 0.2
71 0.18
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.2
93 0.22
94 0.27
95 0.3
96 0.33
97 0.39
98 0.45
99 0.47
100 0.47
101 0.51
102 0.52
103 0.51
104 0.54
105 0.55
106 0.57
107 0.6
108 0.64
109 0.67
110 0.7
111 0.72
112 0.72
113 0.68
114 0.65
115 0.62
116 0.6
117 0.57
118 0.53
119 0.55
120 0.58
121 0.63
122 0.68
123 0.75
124 0.73
125 0.7
126 0.64
127 0.58
128 0.54
129 0.45
130 0.36
131 0.27
132 0.26
133 0.23
134 0.22
135 0.17
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.18
144 0.17
145 0.22
146 0.23
147 0.21
148 0.22
149 0.28
150 0.31
151 0.33
152 0.33
153 0.3
154 0.31
155 0.31
156 0.3
157 0.26
158 0.27
159 0.27
160 0.32
161 0.36
162 0.36
163 0.38
164 0.38
165 0.36
166 0.33
167 0.31
168 0.29
169 0.23
170 0.21
171 0.21
172 0.21
173 0.21
174 0.2
175 0.17
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.13
197 0.17
198 0.23
199 0.26
200 0.25
201 0.31
202 0.32
203 0.35
204 0.35
205 0.33
206 0.29
207 0.27
208 0.26
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.22
221 0.26
222 0.32
223 0.35
224 0.37
225 0.43
226 0.44
227 0.44
228 0.41
229 0.41
230 0.38
231 0.35
232 0.4
233 0.33
234 0.35
235 0.33
236 0.32
237 0.27
238 0.24
239 0.25
240 0.19
241 0.21
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.17
246 0.18
247 0.19
248 0.2
249 0.22
250 0.26
251 0.26
252 0.31
253 0.31
254 0.3
255 0.25
256 0.24
257 0.24
258 0.2
259 0.19
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.11
290 0.13
291 0.15
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.1
314 0.11
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.16
323 0.2
324 0.31
325 0.33
326 0.37
327 0.41
328 0.41
329 0.42
330 0.4
331 0.39
332 0.36
333 0.36
334 0.36
335 0.33
336 0.38
337 0.35
338 0.33
339 0.3
340 0.22
341 0.22
342 0.18
343 0.19
344 0.16
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.18
351 0.17
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.22
356 0.21
357 0.21
358 0.18
359 0.17
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.1
369 0.12
370 0.11
371 0.07
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.14
395 0.21
396 0.27
397 0.29
398 0.36
399 0.46
400 0.57
401 0.66
402 0.71
403 0.76
404 0.8
405 0.86
406 0.83
407 0.84
408 0.81
409 0.76
410 0.72
411 0.64
412 0.54
413 0.44
414 0.38
415 0.27
416 0.2
417 0.16