Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TRM2

Protein Details
Accession A0A1V1TRM2    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-63SLATPHRRVERGRKRARKADEPDEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-55RRVERGRKRARK
89-100REHPSSARGRKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046797  PDDEXK_12  
Pfam View protein in Pfam  
PF20516  PDDEXK_12  
Amino Acid Sequences MNYFQLLSACPIIGDESQIKKWIDGVEPCLEQAAGDDSLATPHRRVERGRKRARKADEPDEDDVDQPCFARLPNTPSPASGSAKKNTPREHPSSARGRKRPGDTIEHGEGAVSSDRAPSGSIPTLRPIAIPHQPSRERSSSISLINSRNDLRRLAKPIHINRLEAPGILPPDVRSLHSEIRDTAQSSLHIVPRELRQQLSTLEGQGSIPEHSFTTETTEGADGILSTLWNIKHKAAISTELERDEQAWANFVHTPLLELAFGSEIDRLLTEQAQDAIAVRLEPVMDAGIARDSVPCLNPRLYSSGGDASSVLAWPVPGSSTEHGTKNVPLVSGRSERKRVDYVLVLDLAETVPLQSTLSDVAQQISIYGDSLAHMNQTSYPPVCNSPIAVSIATKTVSSQRDPVLQLAIWAAAWHKRMADLRSWMLMMQDSITDLSEARHPKLVSLPLIAVTGHDWDVYFACDEGHSLVLRGPAPLGSTKSTLQIFALLASLKAMKKWTVDTFYTGLEAWFLSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.23
4 0.25
5 0.31
6 0.32
7 0.29
8 0.32
9 0.32
10 0.32
11 0.32
12 0.35
13 0.35
14 0.35
15 0.34
16 0.32
17 0.27
18 0.21
19 0.18
20 0.16
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.1
25 0.13
26 0.17
27 0.18
28 0.15
29 0.2
30 0.27
31 0.31
32 0.39
33 0.47
34 0.55
35 0.64
36 0.75
37 0.79
38 0.82
39 0.87
40 0.88
41 0.87
42 0.85
43 0.84
44 0.82
45 0.78
46 0.73
47 0.67
48 0.6
49 0.51
50 0.43
51 0.34
52 0.25
53 0.19
54 0.15
55 0.12
56 0.11
57 0.13
58 0.16
59 0.23
60 0.3
61 0.35
62 0.35
63 0.35
64 0.4
65 0.41
66 0.42
67 0.41
68 0.39
69 0.39
70 0.46
71 0.53
72 0.55
73 0.56
74 0.6
75 0.61
76 0.63
77 0.67
78 0.64
79 0.65
80 0.69
81 0.73
82 0.74
83 0.72
84 0.73
85 0.72
86 0.73
87 0.73
88 0.68
89 0.66
90 0.61
91 0.62
92 0.57
93 0.5
94 0.44
95 0.35
96 0.29
97 0.23
98 0.18
99 0.11
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.08
106 0.12
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.22
111 0.24
112 0.23
113 0.23
114 0.2
115 0.21
116 0.25
117 0.29
118 0.3
119 0.37
120 0.41
121 0.45
122 0.5
123 0.48
124 0.44
125 0.41
126 0.43
127 0.38
128 0.36
129 0.37
130 0.35
131 0.35
132 0.33
133 0.34
134 0.31
135 0.31
136 0.31
137 0.3
138 0.3
139 0.32
140 0.36
141 0.37
142 0.4
143 0.45
144 0.5
145 0.56
146 0.53
147 0.49
148 0.45
149 0.47
150 0.42
151 0.32
152 0.26
153 0.19
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.1
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.18
163 0.23
164 0.24
165 0.25
166 0.22
167 0.24
168 0.25
169 0.23
170 0.2
171 0.16
172 0.15
173 0.17
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.17
178 0.18
179 0.21
180 0.27
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.22
185 0.22
186 0.23
187 0.19
188 0.15
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.14
221 0.16
222 0.15
223 0.18
224 0.19
225 0.2
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.14
233 0.1
234 0.11
235 0.09
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.07
243 0.08
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.18
291 0.19
292 0.17
293 0.17
294 0.16
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.08
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.07
306 0.08
307 0.12
308 0.15
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.19
313 0.19
314 0.19
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.17
319 0.24
320 0.28
321 0.31
322 0.36
323 0.37
324 0.41
325 0.43
326 0.39
327 0.35
328 0.34
329 0.31
330 0.27
331 0.26
332 0.22
333 0.18
334 0.17
335 0.13
336 0.09
337 0.06
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.16
369 0.18
370 0.2
371 0.18
372 0.18
373 0.16
374 0.18
375 0.18
376 0.17
377 0.15
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.12
382 0.11
383 0.16
384 0.19
385 0.21
386 0.24
387 0.25
388 0.3
389 0.32
390 0.32
391 0.28
392 0.24
393 0.22
394 0.19
395 0.16
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.13
401 0.13
402 0.12
403 0.16
404 0.21
405 0.24
406 0.29
407 0.31
408 0.31
409 0.32
410 0.33
411 0.29
412 0.25
413 0.23
414 0.17
415 0.12
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.14
424 0.18
425 0.19
426 0.24
427 0.24
428 0.25
429 0.31
430 0.34
431 0.3
432 0.29
433 0.28
434 0.23
435 0.24
436 0.22
437 0.17
438 0.13
439 0.13
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.12
456 0.15
457 0.16
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.15
462 0.18
463 0.19
464 0.19
465 0.22
466 0.22
467 0.27
468 0.27
469 0.26
470 0.23
471 0.23
472 0.2
473 0.17
474 0.18
475 0.13
476 0.12
477 0.13
478 0.17
479 0.14
480 0.16
481 0.19
482 0.2
483 0.22
484 0.28
485 0.34
486 0.36
487 0.37
488 0.4
489 0.39
490 0.37
491 0.36
492 0.3
493 0.23
494 0.17