FuNGI

A0A0C4F4C6

Protein Details

Accession

A0A0C4F4C6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-73	LPDMTRRTKAKSQKAANLLC	Hydrophilic
257-284	HPEKYQQHLEKQKREREKKKSAMYHTTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-275	KREREKK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.833, cyto 5, cyto_mito 3.833, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MADYESDSSESSLGGKPTMKVPKFSGENFEIWEKKIQMVLSEFNLEHFIDNPPLPDMTRRTKAKSQKAANLLCANLTDGVFNTIVKKDNSNNPYELWQMFKSVYASDSILASYEVWARWEDTQFNDDMAAYIAGIEECLAKFDSLGMIVPDFVICCSIISQITKKRPFLMQSLFGDLNSLGKPKYVINRLREVGRFERTNKRKAPEPAPATSTSTALVTDTGAHGTKRRRPYTPITCPGKKHNPEANHTKDNCWTLHPEKYQQHLEKQKREREKKKSAMYHTTAQTSSEDPGNENIWPSFSYLSGINGMKSQTTILDSGASNHMLTSLGYFKQTSRVSIDIVTGSGSGELVATARGDAVLLLGNGGTLTLKDALYVPNLTRNLVSFVQLMKTKALIHQGADGFAVKIDDGQAFGVDVSNDLLEIKGVLDPTNLAVGLATTVTNKQSDFVKWHNRLGHACSSRITTAVSNSLEMTKTHACEACMQGKVTRLPCKGHFKSANAALEVVHGDLVGPISPSTNGGARYFLTLVDQYTGYIHTTILKEKGQAAEAIQSFRVMFENQTGTKMKTLITDGGGEFCNHKLGDLLQEAGIQHHVSPPYTPQNNGLAERANRTVIEMTRCMLLQSNLAPEWWAEAVKTATATTNSLPSLAKSKKSPIELLFKTKPNMNFFRPFGCWVWIVKPKQYRTEKFGPISWEGVLIGYENDYSLYKVCRLEDKQILTVKHAHFDEQTFPECKALRKSINLSYKDRLPRFNSDPEMPFQDEDDDDELLVVKEAEDEPDEQLELEDILANLRTVNRSSKPNSAANLDEDNEPPAPARAIIGGIDRRNIVDGKRERKQAYTVSVSIEPKNHKQAMTCAESSSWKEAELKEINNMNKHKVWIVRVRVESDDPIPSTWVYRKKLGSETRSLNSRHESVRRASNKLKVSILKQSMRQPESRRLFASYSPLQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.19
4	0.27
5	0.38
6	0.37
7	0.38
8	0.41
9	0.48
10	0.51
11	0.52
12	0.52
13	0.45
14	0.45
15	0.44
16	0.47
17	0.4
18	0.37
19	0.41
20	0.34
21	0.32
22	0.33
23	0.3
24	0.27
25	0.29
26	0.3
27	0.26
28	0.29
29	0.27
30	0.25
31	0.27
32	0.23
33	0.2
34	0.18
35	0.18
36	0.18
37	0.19
38	0.19
39	0.18
40	0.19
41	0.19
42	0.24
43	0.28
44	0.32
45	0.41
46	0.45
47	0.51
48	0.59
49	0.68
50	0.73
51	0.76
52	0.76
53	0.76
54	0.8
55	0.77
56	0.75
57	0.69
58	0.59
59	0.49
60	0.41
61	0.33
62	0.26
63	0.22
64	0.15
65	0.11
66	0.14
67	0.13
68	0.13
69	0.15
70	0.15
71	0.2
72	0.2
73	0.25
74	0.28
75	0.38
76	0.42
77	0.44
78	0.44
79	0.41
80	0.43
81	0.43
82	0.37
83	0.32
84	0.28
85	0.26
86	0.24
87	0.24
88	0.22
89	0.19
90	0.18
91	0.15
92	0.15
93	0.14
94	0.14
95	0.12
96	0.11
97	0.1
98	0.1
99	0.09
100	0.12
101	0.11
102	0.12
103	0.13
104	0.14
105	0.17
106	0.2
107	0.21
108	0.21
109	0.24
110	0.23
111	0.22
112	0.21
113	0.17
114	0.15
115	0.14
116	0.1
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.08
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.08
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.14
147	0.2
148	0.28
149	0.38
150	0.44
151	0.45
152	0.47
153	0.5
154	0.51
155	0.52
156	0.5
157	0.47
158	0.44
159	0.48
160	0.44
161	0.39
162	0.36
163	0.28
164	0.24
165	0.18
166	0.17
167	0.11
168	0.11
169	0.13
170	0.16
171	0.24
172	0.3
173	0.37
174	0.41
175	0.49
176	0.51
177	0.55
178	0.54
179	0.52
180	0.48
181	0.48
182	0.47
183	0.44
184	0.53
185	0.54
186	0.6
187	0.61
188	0.59
189	0.6
190	0.64
191	0.65
192	0.64
193	0.64
194	0.58
195	0.56
196	0.54
197	0.5
198	0.43
199	0.37
200	0.27
201	0.22
202	0.18
203	0.14
204	0.12
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.15
212	0.22
213	0.29
214	0.39
215	0.43
216	0.45
217	0.5
218	0.6
219	0.66
220	0.69
221	0.72
222	0.7
223	0.71
224	0.71
225	0.74
226	0.74
227	0.68
228	0.66
229	0.64
230	0.61
231	0.63
232	0.69
233	0.68
234	0.67
235	0.64
236	0.57
237	0.54
238	0.51
239	0.45
240	0.38
241	0.37
242	0.31
243	0.38
244	0.39
245	0.42
246	0.44
247	0.49
248	0.56
249	0.53
250	0.57
251	0.6
252	0.65
253	0.67
254	0.71
255	0.74
256	0.76
257	0.83
258	0.84
259	0.84
260	0.86
261	0.85
262	0.86
263	0.86
264	0.82
265	0.81
266	0.75
267	0.72
268	0.64
269	0.58
270	0.49
271	0.41
272	0.35
273	0.27
274	0.23
275	0.19
276	0.16
277	0.14
278	0.16
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.13
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.1
287	0.09
288	0.1
289	0.09
290	0.1
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.13
295	0.13
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.1
304	0.1
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.11
318	0.11
319	0.18
320	0.19
321	0.19
322	0.2
323	0.2
324	0.21
325	0.21
326	0.22
327	0.14
328	0.14
329	0.12
330	0.09
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.03
352	0.04
353	0.03
354	0.02
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.14
365	0.15
366	0.15
367	0.15
368	0.14
369	0.17
370	0.16
371	0.17
372	0.13
373	0.13
374	0.15
375	0.17
376	0.17
377	0.13
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.18
382	0.16
383	0.15
384	0.18
385	0.18
386	0.17
387	0.17
388	0.15
389	0.1
390	0.09
391	0.09
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.09
433	0.11
434	0.14
435	0.2
436	0.29
437	0.31
438	0.36
439	0.37
440	0.38
441	0.38
442	0.38
443	0.4
444	0.32
445	0.3
446	0.27
447	0.26
448	0.23
449	0.22
450	0.19
451	0.11
452	0.1
453	0.13
454	0.13
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.14
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.16
467	0.19
468	0.19
469	0.19
470	0.18
471	0.18
472	0.2
473	0.23
474	0.25
475	0.28
476	0.27
477	0.28
478	0.34
479	0.43
480	0.41
481	0.46
482	0.45
483	0.4
484	0.43
485	0.45
486	0.41
487	0.31
488	0.3
489	0.21
490	0.18
491	0.17
492	0.12
493	0.07
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.03
500	0.03
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.06
505	0.07
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.08
516	0.09
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.09
525	0.1
526	0.11
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.16
531	0.17
532	0.14
533	0.14
534	0.13
535	0.15
536	0.15
537	0.15
538	0.14
539	0.13
540	0.12
541	0.12
542	0.13
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.13
547	0.13
548	0.16
549	0.17
550	0.17
551	0.18
552	0.18
553	0.16
554	0.14
555	0.16
556	0.14
557	0.13
558	0.14
559	0.13
560	0.14
561	0.14
562	0.13
563	0.12
564	0.11
565	0.12
566	0.1
567	0.1
568	0.09
569	0.09
570	0.12
571	0.12
572	0.13
573	0.1
574	0.11
575	0.12
576	0.11
577	0.12
578	0.08
579	0.07
580	0.09
581	0.1
582	0.09
583	0.1
584	0.14
585	0.21
586	0.23
587	0.23
588	0.24
589	0.29
590	0.3
591	0.31
592	0.28
593	0.24
594	0.23
595	0.26
596	0.24
597	0.19
598	0.17
599	0.17
600	0.19
601	0.17
602	0.19
603	0.17
604	0.16
605	0.16
606	0.17
607	0.15
608	0.14
609	0.12
610	0.1
611	0.11
612	0.13
613	0.13
614	0.13
615	0.12
616	0.11
617	0.12
618	0.1
619	0.09
620	0.06
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.09
625	0.08
626	0.08
627	0.09
628	0.11
629	0.1
630	0.12
631	0.12
632	0.13
633	0.12
634	0.12
635	0.2
636	0.21
637	0.24
638	0.23
639	0.3
640	0.34
641	0.37
642	0.41
643	0.38
644	0.45
645	0.44
646	0.5
647	0.49
648	0.48
649	0.46
650	0.46
651	0.46
652	0.44
653	0.47
654	0.44
655	0.45
656	0.43
657	0.45
658	0.42
659	0.41
660	0.35
661	0.32
662	0.28
663	0.23
664	0.28
665	0.32
666	0.32
667	0.35
668	0.41
669	0.42
670	0.51
671	0.59
672	0.57
673	0.57
674	0.64
675	0.64
676	0.59
677	0.59
678	0.54
679	0.46
680	0.43
681	0.35
682	0.26
683	0.19
684	0.17
685	0.13
686	0.09
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.05
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.08
695	0.1
696	0.12
697	0.14
698	0.16
699	0.23
700	0.26
701	0.32
702	0.37
703	0.39
704	0.42
705	0.46
706	0.45
707	0.4
708	0.45
709	0.38
710	0.37
711	0.34
712	0.3
713	0.26
714	0.28
715	0.3
716	0.26
717	0.29
718	0.25
719	0.25
720	0.28
721	0.28
722	0.29
723	0.3
724	0.34
725	0.34
726	0.39
727	0.44
728	0.48
729	0.56
730	0.57
731	0.56
732	0.53
733	0.57
734	0.6
735	0.58
736	0.56
737	0.53
738	0.55
739	0.55
740	0.59
741	0.56
742	0.52
743	0.51
744	0.47
745	0.48
746	0.41
747	0.36
748	0.29
749	0.26
750	0.21
751	0.21
752	0.2
753	0.15
754	0.13
755	0.12
756	0.12
757	0.1
758	0.1
759	0.07
760	0.05
761	0.07
762	0.07
763	0.08
764	0.09
765	0.1
766	0.11
767	0.12
768	0.12
769	0.11
770	0.1
771	0.1
772	0.08
773	0.07
774	0.07
775	0.06
776	0.06
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.09
781	0.11
782	0.12
783	0.19
784	0.22
785	0.29
786	0.34
787	0.41
788	0.45
789	0.48
790	0.48
791	0.46
792	0.44
793	0.41
794	0.4
795	0.34
796	0.31
797	0.26
798	0.26
799	0.23
800	0.2
801	0.17
802	0.14
803	0.13
804	0.11
805	0.11
806	0.09
807	0.1
808	0.11
809	0.16
810	0.2
811	0.21
812	0.22
813	0.22
814	0.22
815	0.23
816	0.24
817	0.2
818	0.25
819	0.32
820	0.39
821	0.46
822	0.54
823	0.54
824	0.55
825	0.6
826	0.57
827	0.55
828	0.53
829	0.47
830	0.44
831	0.47
832	0.46
833	0.43
834	0.43
835	0.41
836	0.41
837	0.49
838	0.48
839	0.44
840	0.44
841	0.48
842	0.49
843	0.5
844	0.44
845	0.37
846	0.35
847	0.38
848	0.38
849	0.36
850	0.29
851	0.23
852	0.27
853	0.26
854	0.33
855	0.34
856	0.32
857	0.34
858	0.4
859	0.44
860	0.48
861	0.5
862	0.48
863	0.46
864	0.46
865	0.45
866	0.43
867	0.46
868	0.48
869	0.53
870	0.55
871	0.55
872	0.56
873	0.55
874	0.52
875	0.48
876	0.42
877	0.38
878	0.31
879	0.29
880	0.27
881	0.24
882	0.25
883	0.29
884	0.35
885	0.35
886	0.4
887	0.43
888	0.47
889	0.56
890	0.61
891	0.61
892	0.61
893	0.64
894	0.63
895	0.66
896	0.62
897	0.58
898	0.55
899	0.53
900	0.51
901	0.51
902	0.51
903	0.5
904	0.58
905	0.59
906	0.61
907	0.62
908	0.63
909	0.64
910	0.63
911	0.64
912	0.6
913	0.59
914	0.61
915	0.63
916	0.61
917	0.59
918	0.63
919	0.66
920	0.65
921	0.67
922	0.64
923	0.66
924	0.68
925	0.68
926	0.61
927	0.56
928	0.54
929	0.5

A0A0C4F4C6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer