Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TSA2

Protein Details
Accession A0A1V1TSA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-60QARTSLVPRHEREKRRREKEAQRDYGRGRGVNTRNIKDKKLRRNLQALEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-54RHEREKRRREKEAQRDYGRGRGVNTRNIKDKKLRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Amino Acid Sequences METDNGARVVDQARTSLVPRHEREKRRREKEAQRDYGRGRGVNTRNIKDKKLRRNLQALESKYKAATLKAKDAEILLEGTSGYLEPETELERTYKVRQDEIQDSVSVATAQKRFDLTLNELGPYVFDYSRNGRDLLLGGRKGHIASMDWRQGKLNCEFQVNEIVRDVRWLHTNQYMAVAQKKNVYIYDGSGVELHCLNQHREVSHLEFLPYHFLLVTLGASGHLKYQDVSTGKLVTEIATKLGPPASLAQNPYNAVCFSGHNNGQIQLWSPSCSSSNGPLVKLLAHKGPVRSMSIDRGMFICLPIYNNTCLLKQRDGIWYLPVRTVRWLFGIYVNFAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.26
4 0.31
5 0.37
6 0.4
7 0.49
8 0.57
9 0.65
10 0.74
11 0.79
12 0.82
13 0.82
14 0.88
15 0.89
16 0.9
17 0.91
18 0.91
19 0.9
20 0.85
21 0.84
22 0.77
23 0.74
24 0.67
25 0.57
26 0.49
27 0.48
28 0.47
29 0.49
30 0.54
31 0.53
32 0.58
33 0.61
34 0.65
35 0.65
36 0.7
37 0.72
38 0.74
39 0.77
40 0.75
41 0.81
42 0.79
43 0.78
44 0.77
45 0.71
46 0.68
47 0.61
48 0.55
49 0.44
50 0.42
51 0.34
52 0.3
53 0.33
54 0.3
55 0.37
56 0.37
57 0.38
58 0.35
59 0.34
60 0.3
61 0.23
62 0.19
63 0.11
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.15
80 0.18
81 0.22
82 0.22
83 0.25
84 0.27
85 0.32
86 0.35
87 0.35
88 0.33
89 0.28
90 0.27
91 0.23
92 0.2
93 0.15
94 0.11
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.2
103 0.2
104 0.24
105 0.24
106 0.23
107 0.23
108 0.21
109 0.19
110 0.17
111 0.15
112 0.08
113 0.08
114 0.11
115 0.15
116 0.18
117 0.2
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.17
130 0.13
131 0.09
132 0.11
133 0.16
134 0.22
135 0.23
136 0.23
137 0.25
138 0.26
139 0.29
140 0.29
141 0.29
142 0.23
143 0.25
144 0.24
145 0.23
146 0.3
147 0.27
148 0.24
149 0.19
150 0.18
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.17
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.15
164 0.21
165 0.19
166 0.17
167 0.2
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.19
172 0.13
173 0.13
174 0.15
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.21
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.19
197 0.16
198 0.13
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.16
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.12
233 0.15
234 0.18
235 0.21
236 0.22
237 0.24
238 0.25
239 0.24
240 0.22
241 0.18
242 0.17
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.21
247 0.22
248 0.23
249 0.24
250 0.23
251 0.23
252 0.22
253 0.21
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.17
259 0.17
260 0.19
261 0.19
262 0.2
263 0.27
264 0.27
265 0.28
266 0.27
267 0.26
268 0.26
269 0.27
270 0.25
271 0.2
272 0.23
273 0.26
274 0.26
275 0.3
276 0.3
277 0.31
278 0.32
279 0.31
280 0.32
281 0.35
282 0.34
283 0.3
284 0.28
285 0.28
286 0.24
287 0.22
288 0.18
289 0.12
290 0.14
291 0.17
292 0.2
293 0.19
294 0.23
295 0.25
296 0.26
297 0.31
298 0.33
299 0.34
300 0.33
301 0.36
302 0.39
303 0.4
304 0.39
305 0.4
306 0.41
307 0.39
308 0.42
309 0.4
310 0.34
311 0.39
312 0.4
313 0.34
314 0.32
315 0.31
316 0.27
317 0.3
318 0.32