Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1TH40

Protein Details
Accession A0A1V1TH40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
452-471HDSGWNPRNRHDHRGRGRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-470RRRGDLGPEPRAPPREPRGDLGPEPRAPPREPRGSRGHRGHSRGRGRGHGGRGGHDSGWNPRNRHDHRGRGRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8, nucl 7, cyto 7, cysk 7, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR043198  Cyclin/Ssn8  
IPR006671  Cyclin_N  
Gene Ontology GO:0016538  F:cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00134  Cyclin_N  
Amino Acid Sequences MALTDSQMEDASDADVACTSRSGSGVGSGSGSGGPSIGVIKSGRPYLHESTIRRKLAKLDLDLSRDEAARLQGVQLIDDVRNFLQLPIITYIAACGYYHRFRLEFDPKEYQWTDAALTCLFVACKSEDTLKKSREILCANHNIKNPDRITTPDDKLFDQGSKMLISLERQVIETLRFDFQVRNPFKILAKIVKAVLGSDQPAIDFFIEAYKVGTDMYKTFAPLKHTTFTCAFAIARLTALITGLSEDVFVNLDPTEYYTYEEWVAEVMLDVLDLYTDHSRSTLLGQEINPQAFIDVKIKVNKQIEAAQIPRYQKFCNECEREGFPSPSFAGSATSPASPTGTNSTIKRGPKGHEGTYRFLFDAAEVRQERTAYEEHTKDEWEEWEEEVEEVIPERESRRRGDLGPEPRAPPREPRGDLGPEPRAPPREPRGSRGHRGHSRGRGRGHGGRGGHDSGWNPRNRHDHRGRGRGGSGSGSSFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.12
28 0.16
29 0.2
30 0.2
31 0.22
32 0.29
33 0.32
34 0.4
35 0.45
36 0.47
37 0.53
38 0.62
39 0.64
40 0.59
41 0.55
42 0.53
43 0.55
44 0.57
45 0.52
46 0.49
47 0.48
48 0.5
49 0.49
50 0.45
51 0.37
52 0.31
53 0.26
54 0.21
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.15
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.11
80 0.11
81 0.08
82 0.08
83 0.14
84 0.17
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.23
89 0.32
90 0.39
91 0.38
92 0.41
93 0.47
94 0.45
95 0.52
96 0.5
97 0.43
98 0.34
99 0.3
100 0.26
101 0.19
102 0.2
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.11
113 0.18
114 0.22
115 0.29
116 0.37
117 0.37
118 0.4
119 0.44
120 0.47
121 0.47
122 0.46
123 0.44
124 0.43
125 0.51
126 0.51
127 0.51
128 0.5
129 0.47
130 0.46
131 0.5
132 0.43
133 0.36
134 0.34
135 0.32
136 0.35
137 0.37
138 0.39
139 0.35
140 0.36
141 0.34
142 0.34
143 0.32
144 0.26
145 0.2
146 0.18
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.17
167 0.26
168 0.27
169 0.27
170 0.27
171 0.29
172 0.29
173 0.3
174 0.3
175 0.25
176 0.25
177 0.24
178 0.23
179 0.22
180 0.21
181 0.18
182 0.16
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.09
204 0.08
205 0.1
206 0.12
207 0.14
208 0.2
209 0.22
210 0.24
211 0.26
212 0.26
213 0.28
214 0.27
215 0.27
216 0.22
217 0.19
218 0.16
219 0.13
220 0.14
221 0.1
222 0.09
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.07
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.19
274 0.21
275 0.21
276 0.2
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.14
281 0.1
282 0.11
283 0.14
284 0.18
285 0.2
286 0.26
287 0.27
288 0.27
289 0.27
290 0.3
291 0.29
292 0.29
293 0.3
294 0.28
295 0.31
296 0.32
297 0.33
298 0.31
299 0.29
300 0.3
301 0.33
302 0.33
303 0.38
304 0.41
305 0.39
306 0.41
307 0.44
308 0.43
309 0.42
310 0.4
311 0.3
312 0.27
313 0.26
314 0.23
315 0.2
316 0.15
317 0.13
318 0.1
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.1
326 0.11
327 0.14
328 0.16
329 0.19
330 0.2
331 0.26
332 0.31
333 0.33
334 0.36
335 0.36
336 0.37
337 0.43
338 0.48
339 0.49
340 0.52
341 0.54
342 0.54
343 0.52
344 0.5
345 0.4
346 0.35
347 0.28
348 0.2
349 0.21
350 0.16
351 0.21
352 0.2
353 0.22
354 0.23
355 0.23
356 0.22
357 0.21
358 0.22
359 0.18
360 0.25
361 0.25
362 0.27
363 0.28
364 0.29
365 0.27
366 0.27
367 0.24
368 0.21
369 0.2
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.16
374 0.14
375 0.12
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.11
382 0.17
383 0.2
384 0.24
385 0.3
386 0.33
387 0.34
388 0.41
389 0.47
390 0.51
391 0.55
392 0.56
393 0.53
394 0.54
395 0.57
396 0.52
397 0.51
398 0.5
399 0.52
400 0.5
401 0.51
402 0.53
403 0.54
404 0.56
405 0.55
406 0.53
407 0.47
408 0.47
409 0.48
410 0.46
411 0.43
412 0.47
413 0.48
414 0.52
415 0.53
416 0.57
417 0.62
418 0.66
419 0.74
420 0.74
421 0.75
422 0.73
423 0.77
424 0.79
425 0.79
426 0.8
427 0.77
428 0.73
429 0.7
430 0.69
431 0.7
432 0.66
433 0.62
434 0.54
435 0.51
436 0.51
437 0.46
438 0.39
439 0.35
440 0.32
441 0.35
442 0.42
443 0.44
444 0.41
445 0.46
446 0.56
447 0.58
448 0.67
449 0.67
450 0.7
451 0.74
452 0.82
453 0.79
454 0.75
455 0.72
456 0.65
457 0.57
458 0.5
459 0.42