FuNGI

A0A1V1TCN0

Protein Details

Accession

A0A1V1TCN0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-75	DFGTQGRVSRKKKEARQKVAVKLTGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-63	RKKKE
533-551	KANGKGKGKGKAKAFGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 7, mito 5, cyto 4.5, pero 3, plas 2, vacu 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033599 TAF1B/Rrn7
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding

Amino Acid Sequences

MARTKYHKFRGGERCDECGVRHWFAQDALRYCRNGHRLEGFANHEADEDDFGTQGRVSRKKKEARQKVAVKLTGDEGRELYLEVIQLILIRQVRWLVDKQGFPDDFTELVRALWALRVRNLPLRQRGEGKGSSTGKGDESDGATSSAWFSSQSETGESSGVDLSDATTATWAPDARRRWKLPKLIDTLALCYLGCLIRRLPVSTGDFCNWVQKGDLEFLATLNQIPRNARDRLPPEYHRALEVRDHLSAGRLHNTVQQLVISYKVNFDMTIPPLNYVPIALRFITDLVLPVDVYIAVKHIGEILKTEFSYPIGGKRIRTMDNPEILLASLVVVSTKLLYSLDGVERPPISQQDPRRTKIDWRKWQKLTAEQPAEECTNLPRGEEHKVTADNILTMDKTKLDDYMDWFERMWLCDGEPRTPERVRSLFEQKRSSPVTNQSTNPEENRGDQIEKRYERLAQSIGPVVPVLESTKNEETEPRNLCPIWRRETDLPDAAKVLYSKTAQLAAIPLATLVRGAAQVERQLELWCVQKTKANGKGKGKGKAKAFGKGKAVEASDDSED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.62
3	0.6
4	0.51
5	0.49
6	0.47
7	0.4
8	0.38
9	0.34
10	0.32
11	0.33
12	0.38
13	0.36
14	0.35
15	0.39
16	0.42
17	0.42
18	0.43
19	0.49
20	0.5
21	0.46
22	0.46
23	0.45
24	0.43
25	0.45
26	0.48
27	0.46
28	0.42
29	0.4
30	0.34
31	0.29
32	0.26
33	0.24
34	0.19
35	0.14
36	0.11
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.14
42	0.21
43	0.3
44	0.35
45	0.44
46	0.54
47	0.63
48	0.72
49	0.79
50	0.82
51	0.82
52	0.88
53	0.87
54	0.87
55	0.86
56	0.8
57	0.71
58	0.61
59	0.56
60	0.5
61	0.42
62	0.33
63	0.25
64	0.21
65	0.2
66	0.19
67	0.14
68	0.11
69	0.1
70	0.08
71	0.08
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.12
79	0.13
80	0.15
81	0.18
82	0.21
83	0.23
84	0.28
85	0.3
86	0.31
87	0.38
88	0.38
89	0.35
90	0.34
91	0.29
92	0.24
93	0.23
94	0.21
95	0.13
96	0.12
97	0.11
98	0.1
99	0.08
100	0.11
101	0.14
102	0.14
103	0.18
104	0.21
105	0.24
106	0.32
107	0.38
108	0.42
109	0.48
110	0.51
111	0.52
112	0.54
113	0.54
114	0.53
115	0.49
116	0.44
117	0.44
118	0.41
119	0.38
120	0.34
121	0.32
122	0.26
123	0.24
124	0.23
125	0.16
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.11
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.1
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.11
146	0.1
147	0.09
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.06
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.16
161	0.23
162	0.3
163	0.39
164	0.44
165	0.51
166	0.58
167	0.64
168	0.66
169	0.68
170	0.67
171	0.6
172	0.6
173	0.52
174	0.47
175	0.38
176	0.31
177	0.21
178	0.15
179	0.14
180	0.11
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.13
185	0.14
186	0.16
187	0.15
188	0.19
189	0.23
190	0.24
191	0.27
192	0.23
193	0.25
194	0.23
195	0.27
196	0.23
197	0.19
198	0.16
199	0.15
200	0.16
201	0.15
202	0.15
203	0.11
204	0.11
205	0.1
206	0.11
207	0.09
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.16
214	0.19
215	0.22
216	0.23
217	0.29
218	0.31
219	0.36
220	0.42
221	0.41
222	0.43
223	0.45
224	0.44
225	0.38
226	0.35
227	0.29
228	0.26
229	0.27
230	0.23
231	0.19
232	0.19
233	0.16
234	0.18
235	0.19
236	0.17
237	0.16
238	0.14
239	0.14
240	0.18
241	0.19
242	0.17
243	0.15
244	0.14
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.1
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.08
254	0.09
255	0.11
256	0.12
257	0.15
258	0.15
259	0.14
260	0.14
261	0.15
262	0.13
263	0.1
264	0.09
265	0.07
266	0.08
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.05
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.09
295	0.09
296	0.11
297	0.1
298	0.12
299	0.17
300	0.18
301	0.18
302	0.22
303	0.26
304	0.26
305	0.28
306	0.32
307	0.32
308	0.33
309	0.33
310	0.29
311	0.25
312	0.22
313	0.2
314	0.12
315	0.07
316	0.04
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.07
328	0.09
329	0.09
330	0.1
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.15
337	0.2
338	0.27
339	0.36
340	0.43
341	0.45
342	0.47
343	0.46
344	0.53
345	0.58
346	0.62
347	0.61
348	0.64
349	0.71
350	0.72
351	0.76
352	0.7
353	0.68
354	0.65
355	0.64
356	0.59
357	0.49
358	0.47
359	0.44
360	0.4
361	0.31
362	0.24
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.16
367	0.16
368	0.17
369	0.23
370	0.24
371	0.24
372	0.22
373	0.23
374	0.23
375	0.23
376	0.2
377	0.15
378	0.14
379	0.14
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.14
389	0.17
390	0.24
391	0.25
392	0.24
393	0.24
394	0.25
395	0.24
396	0.24
397	0.22
398	0.15
399	0.14
400	0.18
401	0.2
402	0.21
403	0.23
404	0.24
405	0.28
406	0.29
407	0.31
408	0.33
409	0.35
410	0.34
411	0.38
412	0.45
413	0.46
414	0.51
415	0.55
416	0.5
417	0.54
418	0.57
419	0.53
420	0.48
421	0.51
422	0.52
423	0.5
424	0.51
425	0.49
426	0.48
427	0.49
428	0.45
429	0.41
430	0.34
431	0.32
432	0.34
433	0.32
434	0.31
435	0.3
436	0.36
437	0.4
438	0.4
439	0.41
440	0.38
441	0.39
442	0.38
443	0.39
444	0.34
445	0.26
446	0.27
447	0.29
448	0.26
449	0.22
450	0.2
451	0.16
452	0.14
453	0.13
454	0.13
455	0.12
456	0.13
457	0.19
458	0.23
459	0.24
460	0.25
461	0.3
462	0.31
463	0.37
464	0.4
465	0.36
466	0.37
467	0.36
468	0.4
469	0.43
470	0.46
471	0.44
472	0.43
473	0.48
474	0.49
475	0.54
476	0.56
477	0.54
478	0.49
479	0.43
480	0.41
481	0.34
482	0.31
483	0.26
484	0.21
485	0.18
486	0.18
487	0.18
488	0.19
489	0.21
490	0.19
491	0.19
492	0.2
493	0.16
494	0.15
495	0.13
496	0.11
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.09
505	0.12
506	0.16
507	0.18
508	0.19
509	0.19
510	0.19
511	0.2
512	0.21
513	0.24
514	0.24
515	0.24
516	0.25
517	0.29
518	0.34
519	0.42
520	0.49
521	0.53
522	0.58
523	0.65
524	0.73
525	0.75
526	0.79
527	0.77
528	0.74
529	0.71
530	0.71
531	0.67
532	0.67
533	0.65
534	0.62
535	0.62
536	0.59
537	0.56
538	0.52
539	0.49
540	0.41
541	0.38

A0A1V1TCN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer