Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1T0Y8

Protein Details
Accession A0A1V1T0Y8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-302PDVMIVKKHYPNRRRNRKRQWKVKRMAKDEGEBasic
331-351RAGVQLYKQPKRKPQPDEMSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-298KHYPNRRRNRKRQWKVKRMAK
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 11, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MQQALEVTYVVAYQQCPECAKSYTANVWRASVQVRQKVLHKRTFLYLEQLILKHGAHRDTINIKEAKDGIDFFYSARNQAEKFVDFLNSVVPIRLKKSSELISQDSHTAKKSFKFTFSVELIPICKDDLVAIPISLAKQAGNISPLSICYKIGTSVYLLDPSTLQTADISSPIYWRAPFGALAEAKDLVEFIVMDCELVGPTKGKWVLAEVEVARATDLGINNKTYWARTHLGGLLHAGDSVMGYMLSGTIFNNPEFEAIEQSNTYSSRIPDVMIVKKHYPNRRRNRKRQWKVKRMAKDEGELLPKKADQERMDREFEQFLQDIEQDDDFRAGVQLYKQPKRKPQPDEMSMATTDDGDDDGPQVNMDELLDDFDELTMEDGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.2
4 0.23
5 0.25
6 0.27
7 0.29
8 0.29
9 0.32
10 0.38
11 0.43
12 0.47
13 0.45
14 0.44
15 0.41
16 0.4
17 0.38
18 0.36
19 0.37
20 0.38
21 0.41
22 0.42
23 0.49
24 0.57
25 0.63
26 0.63
27 0.59
28 0.55
29 0.58
30 0.6
31 0.54
32 0.5
33 0.42
34 0.38
35 0.37
36 0.34
37 0.29
38 0.25
39 0.24
40 0.21
41 0.23
42 0.22
43 0.2
44 0.21
45 0.25
46 0.29
47 0.32
48 0.35
49 0.34
50 0.32
51 0.34
52 0.34
53 0.3
54 0.26
55 0.25
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.16
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.24
67 0.28
68 0.22
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.17
81 0.21
82 0.21
83 0.22
84 0.27
85 0.3
86 0.33
87 0.36
88 0.36
89 0.34
90 0.34
91 0.36
92 0.33
93 0.3
94 0.27
95 0.25
96 0.24
97 0.26
98 0.32
99 0.31
100 0.32
101 0.34
102 0.33
103 0.37
104 0.37
105 0.34
106 0.27
107 0.26
108 0.23
109 0.2
110 0.19
111 0.13
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.14
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.16
212 0.14
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.18
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.08
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.02
232 0.02
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.16
259 0.21
260 0.25
261 0.27
262 0.31
263 0.32
264 0.38
265 0.46
266 0.52
267 0.56
268 0.61
269 0.69
270 0.77
271 0.83
272 0.89
273 0.93
274 0.94
275 0.96
276 0.96
277 0.96
278 0.96
279 0.95
280 0.94
281 0.92
282 0.87
283 0.85
284 0.77
285 0.69
286 0.62
287 0.56
288 0.55
289 0.46
290 0.4
291 0.34
292 0.31
293 0.31
294 0.32
295 0.35
296 0.31
297 0.39
298 0.46
299 0.49
300 0.53
301 0.5
302 0.48
303 0.44
304 0.4
305 0.35
306 0.26
307 0.22
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.18
323 0.27
324 0.36
325 0.44
326 0.51
327 0.62
328 0.71
329 0.77
330 0.79
331 0.8
332 0.82
333 0.8
334 0.78
335 0.71
336 0.64
337 0.54
338 0.47
339 0.36
340 0.26
341 0.2
342 0.14
343 0.11
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.08