Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V1SRC1

Protein Details
Accession A0A1V1SRC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-275LKRAEDARLRKRRERMAQNGDDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPIAKRRKTPPASEQTSEEPMQSNTEPQEKAPGDNDAETSHQHEDEPVDTSDDTTAPSSSIKADTANKAKDRLARFRALQARAKTSSDQNLKEAAKESQRLATDPSALTALHRRRDIAAHKLLKAETEEGGEDFERKRAWDWTAEESERWDKRVKKKAAHRDNNAFQDYRAESNKIYKRQLQNLAPDMERYEKDKMKAIEKAAASGGLEILETDEGELIAVDKDGSFYSTADSTTFHENRPDKAAVDRLVDDLKRAEDARLRKRRERMAQNGDDDDITYINEKNKQFNQKLSRFYNKYTAEIRDSFERGTRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.63
3 0.62
4 0.54
5 0.44
6 0.36
7 0.29
8 0.31
9 0.27
10 0.26
11 0.24
12 0.29
13 0.29
14 0.27
15 0.36
16 0.32
17 0.34
18 0.32
19 0.33
20 0.29
21 0.3
22 0.3
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.23
27 0.21
28 0.19
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.16
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.19
51 0.26
52 0.33
53 0.39
54 0.39
55 0.41
56 0.43
57 0.46
58 0.48
59 0.5
60 0.48
61 0.47
62 0.46
63 0.52
64 0.57
65 0.56
66 0.57
67 0.51
68 0.52
69 0.49
70 0.49
71 0.43
72 0.4
73 0.43
74 0.43
75 0.41
76 0.36
77 0.4
78 0.38
79 0.37
80 0.35
81 0.3
82 0.28
83 0.28
84 0.28
85 0.26
86 0.26
87 0.26
88 0.27
89 0.24
90 0.22
91 0.19
92 0.19
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.25
102 0.31
103 0.34
104 0.34
105 0.38
106 0.37
107 0.38
108 0.39
109 0.37
110 0.33
111 0.3
112 0.23
113 0.15
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.14
127 0.17
128 0.2
129 0.23
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.26
134 0.31
135 0.27
136 0.26
137 0.27
138 0.29
139 0.38
140 0.48
141 0.51
142 0.52
143 0.61
144 0.7
145 0.76
146 0.78
147 0.76
148 0.74
149 0.74
150 0.72
151 0.64
152 0.53
153 0.42
154 0.37
155 0.32
156 0.26
157 0.22
158 0.18
159 0.17
160 0.25
161 0.31
162 0.32
163 0.34
164 0.38
165 0.42
166 0.48
167 0.55
168 0.51
169 0.5
170 0.5
171 0.49
172 0.42
173 0.37
174 0.31
175 0.26
176 0.23
177 0.2
178 0.22
179 0.22
180 0.23
181 0.29
182 0.3
183 0.31
184 0.35
185 0.33
186 0.33
187 0.3
188 0.3
189 0.25
190 0.23
191 0.18
192 0.14
193 0.12
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.19
222 0.21
223 0.2
224 0.28
225 0.3
226 0.32
227 0.36
228 0.36
229 0.28
230 0.3
231 0.35
232 0.29
233 0.3
234 0.29
235 0.25
236 0.28
237 0.27
238 0.24
239 0.2
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.21
245 0.3
246 0.4
247 0.48
248 0.55
249 0.6
250 0.68
251 0.75
252 0.79
253 0.8
254 0.8
255 0.81
256 0.8
257 0.78
258 0.71
259 0.62
260 0.52
261 0.42
262 0.32
263 0.22
264 0.15
265 0.12
266 0.13
267 0.16
268 0.23
269 0.24
270 0.31
271 0.38
272 0.48
273 0.51
274 0.59
275 0.65
276 0.66
277 0.73
278 0.74
279 0.76
280 0.7
281 0.7
282 0.7
283 0.63
284 0.61
285 0.57
286 0.54
287 0.5
288 0.48
289 0.48
290 0.44
291 0.43
292 0.4