Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V1SWD2

Protein Details
Accession A0A1V1SWD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-275PTVPRKPKTNSRTDRDRRRELEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-261RKPK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022190  DUF3716  
Pfam View protein in Pfam  
PF12511  DUF3716  
Amino Acid Sequences MAEDAPPAHFQSIAEAATASWYAHRASSPNSGQSPFIHQDSTQRQTPASTVAASASASAPPTSPAPQPPHPLAASTSASMDPGASSPSSPTSSRRESEARVAGEVGIRSDITAWQSALQSLPFEFANSQQPIHPLAQALIHQPTLRPVEWNQYRQQGGFVPRTAHDYSSLMIYISGQVNPNPCRNCLLRNGPFARCVVSPPAVLAITTLRHACANCTYQNQYKKCTNEPISEQEKARSEMARSITRSKNPTSRPTVPRKPKTNSRTDRDRRRELELQRLLQEQQQHKQQLEDLRDVPMTQSPATLGAGLGDNLASFDEKLRYIRARSPRSRLRIAAEMLQWQAAIATVEAEKPAPTPDLSVPSPIREATLNHHLRAPLNNYTPSQLISTSSAATTAHAFAMNPPDRARTINYSVENTYEPMDEDESESDEEDYEGTPWVGPNQPDSIIKAPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.14
4 0.15
5 0.16
6 0.11
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.19
14 0.28
15 0.32
16 0.37
17 0.4
18 0.4
19 0.4
20 0.39
21 0.43
22 0.38
23 0.35
24 0.3
25 0.27
26 0.35
27 0.41
28 0.44
29 0.41
30 0.39
31 0.37
32 0.37
33 0.38
34 0.33
35 0.26
36 0.22
37 0.17
38 0.16
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.15
50 0.18
51 0.24
52 0.3
53 0.36
54 0.42
55 0.44
56 0.46
57 0.44
58 0.42
59 0.36
60 0.35
61 0.3
62 0.25
63 0.23
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.1
69 0.08
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.13
75 0.16
76 0.16
77 0.2
78 0.26
79 0.32
80 0.33
81 0.37
82 0.38
83 0.39
84 0.46
85 0.48
86 0.42
87 0.37
88 0.36
89 0.31
90 0.29
91 0.25
92 0.17
93 0.12
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.1
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.21
118 0.23
119 0.23
120 0.22
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.17
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.27
136 0.34
137 0.38
138 0.37
139 0.39
140 0.4
141 0.38
142 0.38
143 0.33
144 0.32
145 0.31
146 0.29
147 0.25
148 0.24
149 0.29
150 0.29
151 0.24
152 0.21
153 0.18
154 0.16
155 0.15
156 0.15
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.16
166 0.18
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.26
171 0.26
172 0.28
173 0.3
174 0.37
175 0.36
176 0.42
177 0.46
178 0.43
179 0.43
180 0.4
181 0.36
182 0.27
183 0.23
184 0.19
185 0.16
186 0.15
187 0.13
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.22
205 0.27
206 0.35
207 0.36
208 0.37
209 0.39
210 0.41
211 0.41
212 0.46
213 0.43
214 0.39
215 0.4
216 0.43
217 0.42
218 0.42
219 0.39
220 0.34
221 0.32
222 0.3
223 0.28
224 0.22
225 0.18
226 0.2
227 0.24
228 0.25
229 0.25
230 0.3
231 0.32
232 0.36
233 0.39
234 0.38
235 0.42
236 0.42
237 0.47
238 0.48
239 0.53
240 0.57
241 0.63
242 0.69
243 0.72
244 0.76
245 0.77
246 0.76
247 0.77
248 0.77
249 0.78
250 0.76
251 0.73
252 0.75
253 0.76
254 0.81
255 0.79
256 0.81
257 0.72
258 0.71
259 0.72
260 0.65
261 0.66
262 0.61
263 0.54
264 0.48
265 0.47
266 0.4
267 0.34
268 0.38
269 0.31
270 0.3
271 0.35
272 0.36
273 0.34
274 0.34
275 0.36
276 0.35
277 0.34
278 0.33
279 0.27
280 0.26
281 0.26
282 0.25
283 0.22
284 0.18
285 0.17
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.08
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.15
308 0.18
309 0.21
310 0.28
311 0.37
312 0.45
313 0.51
314 0.59
315 0.64
316 0.68
317 0.7
318 0.66
319 0.6
320 0.57
321 0.52
322 0.48
323 0.4
324 0.36
325 0.31
326 0.28
327 0.23
328 0.16
329 0.14
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.13
344 0.15
345 0.2
346 0.21
347 0.26
348 0.26
349 0.26
350 0.28
351 0.24
352 0.23
353 0.19
354 0.2
355 0.2
356 0.3
357 0.31
358 0.31
359 0.33
360 0.34
361 0.34
362 0.38
363 0.37
364 0.34
365 0.36
366 0.38
367 0.36
368 0.37
369 0.36
370 0.32
371 0.28
372 0.21
373 0.18
374 0.18
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.23
388 0.25
389 0.26
390 0.26
391 0.28
392 0.29
393 0.32
394 0.34
395 0.31
396 0.34
397 0.39
398 0.41
399 0.42
400 0.42
401 0.41
402 0.38
403 0.32
404 0.28
405 0.21
406 0.18
407 0.17
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.17
412 0.18
413 0.18
414 0.17
415 0.15
416 0.14
417 0.13
418 0.11
419 0.11
420 0.09
421 0.1
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.14
426 0.18
427 0.19
428 0.21
429 0.23
430 0.26
431 0.27
432 0.32