Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EFR8

Protein Details
Accession A0A1Q3EFR8    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-82DSANLPGPPPKKKRKRTPKSKRDGHGTRPMGBasic
103-138AKPSTQPPKKSSKNKNKKKERKDKKFVSPSERRRLQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-76PPPKKKRKRTPKSKRDGH
109-137PPKKSSKNKNKKKERKDKKFVSPSERRRL
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTRITNFGRKRSYLESSLDSGQNDANMGDINELVRKPPTQEESTQGITIDVDSANLPGPPPKKKRKRTPKSKRDGHGTRPMGSAPEGEESNPVKASEDLSDVAKPSTQPPKKSSKNKNKKKERKDKKFVSPSERRRLQRIAEKNADTTCFSCREKGHCARDCPKNGLAKEGEDGGGGSKQLGICYRCGSTRHTLSRCKKPEDPLNPLPHASCFVCNSKGHLASTCPQNKSKGIYPNGGSCKLCGDITHLARDCAIRQKDTGSLAAVLGVVDEKDLGADEDDFHTIGRTRQQLDRLDKHTEKLQRSMGVKVAAQSGTIIQPFGKLPVPAKKVVIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.45
4 0.47
5 0.44
6 0.38
7 0.32
8 0.28
9 0.23
10 0.19
11 0.15
12 0.11
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.09
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.19
24 0.26
25 0.31
26 0.32
27 0.35
28 0.39
29 0.42
30 0.44
31 0.41
32 0.34
33 0.28
34 0.23
35 0.2
36 0.16
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.13
45 0.18
46 0.27
47 0.36
48 0.47
49 0.57
50 0.68
51 0.79
52 0.85
53 0.91
54 0.93
55 0.95
56 0.95
57 0.95
58 0.94
59 0.9
60 0.9
61 0.86
62 0.83
63 0.82
64 0.75
65 0.66
66 0.58
67 0.51
68 0.41
69 0.34
70 0.26
71 0.17
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.13
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.15
93 0.25
94 0.29
95 0.33
96 0.38
97 0.48
98 0.57
99 0.66
100 0.72
101 0.73
102 0.8
103 0.85
104 0.91
105 0.92
106 0.93
107 0.94
108 0.94
109 0.94
110 0.94
111 0.94
112 0.92
113 0.92
114 0.91
115 0.86
116 0.85
117 0.83
118 0.81
119 0.81
120 0.8
121 0.71
122 0.66
123 0.64
124 0.6
125 0.59
126 0.58
127 0.56
128 0.54
129 0.53
130 0.5
131 0.46
132 0.42
133 0.34
134 0.26
135 0.2
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.2
140 0.23
141 0.31
142 0.38
143 0.44
144 0.46
145 0.51
146 0.54
147 0.6
148 0.59
149 0.55
150 0.51
151 0.48
152 0.43
153 0.41
154 0.35
155 0.28
156 0.25
157 0.21
158 0.17
159 0.11
160 0.11
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.19
176 0.22
177 0.29
178 0.36
179 0.39
180 0.48
181 0.53
182 0.62
183 0.64
184 0.64
185 0.61
186 0.6
187 0.65
188 0.63
189 0.64
190 0.62
191 0.62
192 0.57
193 0.53
194 0.47
195 0.38
196 0.33
197 0.25
198 0.19
199 0.16
200 0.17
201 0.21
202 0.2
203 0.24
204 0.26
205 0.26
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.24
210 0.34
211 0.37
212 0.35
213 0.36
214 0.38
215 0.39
216 0.41
217 0.43
218 0.42
219 0.4
220 0.42
221 0.41
222 0.46
223 0.48
224 0.48
225 0.41
226 0.33
227 0.31
228 0.27
229 0.25
230 0.17
231 0.18
232 0.22
233 0.23
234 0.3
235 0.29
236 0.28
237 0.29
238 0.29
239 0.26
240 0.28
241 0.29
242 0.24
243 0.24
244 0.26
245 0.28
246 0.29
247 0.28
248 0.2
249 0.18
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.19
274 0.22
275 0.25
276 0.3
277 0.37
278 0.44
279 0.52
280 0.58
281 0.56
282 0.61
283 0.59
284 0.57
285 0.58
286 0.58
287 0.53
288 0.51
289 0.52
290 0.49
291 0.49
292 0.49
293 0.46
294 0.41
295 0.38
296 0.33
297 0.32
298 0.26
299 0.24
300 0.21
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.16
305 0.12
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.18
310 0.17
311 0.23
312 0.32
313 0.37
314 0.38