FuNGI

A0A1Q3EF80

Protein Details

Accession

A0A1Q3EF80

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
220-248	PSEDSLSKSARRRRKQRNRRRELASADNK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-240	LSKSARRRRKQRNRRR

Subcellular Location(s)

nucl 6, plas 6, mito 5, cyto 3, extr 2, vacu 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MSFGRLRRDGTFTIEHSFAGKIHCDLVRRRLVVTLIIRRRHDPFPNILVLFLFCPSAIFEQPHAASFLNRQQSSQRLTVTGLPGCNFMPLVSQNLRIIFSNDDELLQFLTRAHNIQLPPARFIAISTIDVRVYNNDRFDELMTFTRTLPFPLGFQLEKSVWDGIIEPSELYEKNMRQAILKVQEDHPEIAAPIFRYFVSTLQIPTFRDPPRSPPRPRSEPSEDSLSKSARRRRKQRNRRRELASADNKGLELHEQLAQAAHAYVLDSQRPQRRYASSPNPALYEAYHVSITPSRQVLEGPLPDLSNGILRLYEDFQDCFLRVSFQDEDGGKPRRDNNVAIDKLLDQRYKPALLNGVTVAGRHFKFLGYSMSSLKDYTFIFVTAFSRQGELMDAETIRKRFGNIPKASHRPALLGARWGQMFSASTPSVALSLSQLHKIPDRISSNSNGQNASFEVHPKLYLHASNSVSEEQKASFSRIHSSMTRPLIALLEHHGVPEQNFIKLQDLAIRDTQRIRSSLTEAATTFAQHGLGSSFQLESLFKNIAQILHLEIAQHASERNSSTAQLVILKIAVAHGITHILREIKHRGRIRVPGSYTLLGVSDEWDCLEEGEIFAQVYDPRTQKLTPIEGRVLITRSPQIHPGDCQFVEAVRRKELDHLKNVVVFSCKGARSLPSMLGGGDLDGDIYNLILDDKFHPPKRFTADAGAYEPLPPTLTPHICGVRDVVDFVINYIKSDLVGYISTTHLRISDVNGLDCPDCLRLAKAASHAVDFPKVGTAVDFKTLPKAPEGPRPDYLSGEGYRPKPGDNRYYPSVKVLGQLFRRVPTDEYEVEMEDYDDPIEFMKIDNAMGLAARRCLRKLQMGRFGAFSATLEMNPDEDLIDEMHHVFEDYREQLIVIAKTHTASKKANTWLSEEELISGAIMERYPDPKRRREVTTAMNLQTQELTRKIRLEFYRQDNDLDDFEMDGYFDPIDYEEDPDIGRLCNKFNYARAAWIAASEVGYDKFGAQSFAMIALGSMLNAIKDLGREANAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.33
3	0.29
4	0.28
5	0.23
6	0.2
7	0.2
8	0.16
9	0.2
10	0.23
11	0.27
12	0.32
13	0.4
14	0.45
15	0.44
16	0.44
17	0.43
18	0.42
19	0.44
20	0.47
21	0.48
22	0.48
23	0.54
24	0.56
25	0.56
26	0.6
27	0.6
28	0.6
29	0.56
30	0.55
31	0.54
32	0.58
33	0.53
34	0.49
35	0.41
36	0.34
37	0.29
38	0.22
39	0.16
40	0.09
41	0.09
42	0.11
43	0.14
44	0.15
45	0.17
46	0.18
47	0.24
48	0.25
49	0.25
50	0.25
51	0.22
52	0.21
53	0.24
54	0.31
55	0.34
56	0.33
57	0.34
58	0.37
59	0.44
60	0.48
61	0.47
62	0.42
63	0.34
64	0.36
65	0.39
66	0.39
67	0.36
68	0.32
69	0.28
70	0.28
71	0.26
72	0.25
73	0.2
74	0.15
75	0.15
76	0.14
77	0.2
78	0.21
79	0.24
80	0.25
81	0.27
82	0.28
83	0.25
84	0.26
85	0.21
86	0.21
87	0.22
88	0.19
89	0.19
90	0.17
91	0.17
92	0.16
93	0.14
94	0.12
95	0.09
96	0.13
97	0.14
98	0.15
99	0.17
100	0.2
101	0.2
102	0.28
103	0.35
104	0.34
105	0.35
106	0.34
107	0.33
108	0.28
109	0.28
110	0.24
111	0.19
112	0.19
113	0.18
114	0.19
115	0.19
116	0.19
117	0.2
118	0.21
119	0.23
120	0.25
121	0.27
122	0.27
123	0.27
124	0.28
125	0.29
126	0.25
127	0.22
128	0.23
129	0.23
130	0.23
131	0.22
132	0.25
133	0.24
134	0.23
135	0.23
136	0.2
137	0.17
138	0.2
139	0.24
140	0.2
141	0.2
142	0.23
143	0.21
144	0.21
145	0.23
146	0.2
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.13
151	0.14
152	0.13
153	0.11
154	0.1
155	0.13
156	0.13
157	0.15
158	0.2
159	0.19
160	0.24
161	0.27
162	0.27
163	0.26
164	0.29
165	0.34
166	0.36
167	0.38
168	0.36
169	0.36
170	0.41
171	0.42
172	0.4
173	0.33
174	0.25
175	0.22
176	0.2
177	0.19
178	0.15
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.13
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.19
189	0.22
190	0.21
191	0.24
192	0.3
193	0.29
194	0.36
195	0.36
196	0.42
197	0.5
198	0.58
199	0.62
200	0.66
201	0.73
202	0.74
203	0.75
204	0.74
205	0.73
206	0.68
207	0.64
208	0.63
209	0.54
210	0.49
211	0.51
212	0.44
213	0.41
214	0.45
215	0.5
216	0.51
217	0.6
218	0.67
219	0.74
220	0.83
221	0.88
222	0.92
223	0.94
224	0.94
225	0.93
226	0.89
227	0.85
228	0.81
229	0.8
230	0.78
231	0.71
232	0.63
233	0.54
234	0.46
235	0.39
236	0.32
237	0.22
238	0.15
239	0.11
240	0.13
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.09
247	0.08
248	0.05
249	0.05
250	0.07
251	0.09
252	0.11
253	0.13
254	0.2
255	0.27
256	0.29
257	0.31
258	0.35
259	0.38
260	0.42
261	0.5
262	0.53
263	0.54
264	0.57
265	0.56
266	0.52
267	0.48
268	0.42
269	0.33
270	0.28
271	0.21
272	0.17
273	0.15
274	0.14
275	0.15
276	0.17
277	0.17
278	0.16
279	0.16
280	0.15
281	0.15
282	0.15
283	0.16
284	0.18
285	0.18
286	0.16
287	0.16
288	0.16
289	0.15
290	0.15
291	0.13
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.09
298	0.11
299	0.13
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.12
308	0.11
309	0.16
310	0.15
311	0.14
312	0.19
313	0.18
314	0.2
315	0.25
316	0.31
317	0.26
318	0.28
319	0.32
320	0.35
321	0.37
322	0.37
323	0.38
324	0.42
325	0.42
326	0.39
327	0.36
328	0.31
329	0.33
330	0.35
331	0.29
332	0.19
333	0.23
334	0.26
335	0.27
336	0.26
337	0.23
338	0.23
339	0.22
340	0.23
341	0.18
342	0.18
343	0.15
344	0.15
345	0.14
346	0.14
347	0.13
348	0.13
349	0.13
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.16
354	0.13
355	0.15
356	0.16
357	0.17
358	0.18
359	0.17
360	0.16
361	0.14
362	0.12
363	0.12
364	0.11
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.11
369	0.1
370	0.12
371	0.1
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.13
386	0.19
387	0.27
388	0.36
389	0.37
390	0.43
391	0.5
392	0.56
393	0.56
394	0.52
395	0.44
396	0.35
397	0.34
398	0.32
399	0.26
400	0.23
401	0.22
402	0.22
403	0.21
404	0.2
405	0.16
406	0.12
407	0.12
408	0.09
409	0.12
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.08
417	0.05
418	0.09
419	0.1
420	0.11
421	0.12
422	0.13
423	0.15
424	0.16
425	0.16
426	0.19
427	0.22
428	0.23
429	0.25
430	0.27
431	0.31
432	0.34
433	0.34
434	0.28
435	0.24
436	0.23
437	0.21
438	0.19
439	0.14
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.13
448	0.13
449	0.17
450	0.18
451	0.18
452	0.2
453	0.2
454	0.19
455	0.18
456	0.17
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.14
462	0.14
463	0.17
464	0.17
465	0.2
466	0.19
467	0.21
468	0.25
469	0.25
470	0.24
471	0.21
472	0.2
473	0.18
474	0.16
475	0.14
476	0.1
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.14
484	0.12
485	0.1
486	0.11
487	0.11
488	0.13
489	0.13
490	0.13
491	0.12
492	0.13
493	0.14
494	0.17
495	0.18
496	0.17
497	0.18
498	0.21
499	0.19
500	0.19
501	0.18
502	0.16
503	0.18
504	0.2
505	0.19
506	0.18
507	0.16
508	0.16
509	0.15
510	0.13
511	0.11
512	0.08
513	0.07
514	0.05
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.08
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.07
544	0.08
545	0.1
546	0.09
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.03
561	0.03
562	0.05
563	0.05
564	0.06
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.12
569	0.2
570	0.23
571	0.31
572	0.35
573	0.38
574	0.42
575	0.49
576	0.48
577	0.47
578	0.44
579	0.4
580	0.4
581	0.36
582	0.31
583	0.23
584	0.2
585	0.14
586	0.12
587	0.09
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.07
604	0.11
605	0.12
606	0.13
607	0.15
608	0.15
609	0.18
610	0.22
611	0.27
612	0.26
613	0.29
614	0.29
615	0.28
616	0.29
617	0.27
618	0.24
619	0.18
620	0.17
621	0.17
622	0.18
623	0.18
624	0.23
625	0.24
626	0.23
627	0.24
628	0.25
629	0.27
630	0.24
631	0.23
632	0.18
633	0.16
634	0.22
635	0.26
636	0.26
637	0.23
638	0.24
639	0.24
640	0.32
641	0.4
642	0.39
643	0.39
644	0.4
645	0.39
646	0.41
647	0.4
648	0.34
649	0.27
650	0.22
651	0.17
652	0.19
653	0.18
654	0.16
655	0.17
656	0.17
657	0.19
658	0.21
659	0.2
660	0.16
661	0.16
662	0.15
663	0.15
664	0.13
665	0.09
666	0.07
667	0.06
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.03
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.04
676	0.03
677	0.04
678	0.08
679	0.15
680	0.22
681	0.28
682	0.31
683	0.33
684	0.38
685	0.44
686	0.44
687	0.39
688	0.39
689	0.37
690	0.35
691	0.36
692	0.31
693	0.25
694	0.23
695	0.21
696	0.14
697	0.11
698	0.09
699	0.1
700	0.16
701	0.17
702	0.17
703	0.21
704	0.25
705	0.24
706	0.25
707	0.23
708	0.19
709	0.18
710	0.17
711	0.14
712	0.12
713	0.12
714	0.12
715	0.15
716	0.12
717	0.12
718	0.12
719	0.12
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.1
728	0.11
729	0.11
730	0.11
731	0.1
732	0.11
733	0.11
734	0.12
735	0.18
736	0.19
737	0.19
738	0.19
739	0.2
740	0.19
741	0.19
742	0.16
743	0.1
744	0.1
745	0.1
746	0.1
747	0.11
748	0.12
749	0.14
750	0.16
751	0.19
752	0.19
753	0.2
754	0.21
755	0.2
756	0.2
757	0.18
758	0.16
759	0.13
760	0.13
761	0.11
762	0.11
763	0.12
764	0.11
765	0.14
766	0.15
767	0.13
768	0.19
769	0.21
770	0.21
771	0.21
772	0.27
773	0.28
774	0.36
775	0.42
776	0.42
777	0.43
778	0.47
779	0.46
780	0.41
781	0.39
782	0.35
783	0.3
784	0.29
785	0.3
786	0.26
787	0.3
788	0.29
789	0.3
790	0.32
791	0.37
792	0.43
793	0.44
794	0.49
795	0.49
796	0.53
797	0.51
798	0.48
799	0.45
800	0.35
801	0.33
802	0.3
803	0.32
804	0.31
805	0.37
806	0.35
807	0.35
808	0.36
809	0.34
810	0.31
811	0.29
812	0.31
813	0.26
814	0.26
815	0.25
816	0.24
817	0.22
818	0.21
819	0.17
820	0.12
821	0.12
822	0.09
823	0.08
824	0.07
825	0.07
826	0.07
827	0.06
828	0.06
829	0.08
830	0.08
831	0.08
832	0.08
833	0.08
834	0.07
835	0.08
836	0.1
837	0.09
838	0.13
839	0.17
840	0.18
841	0.2
842	0.24
843	0.28
844	0.36
845	0.44
846	0.49
847	0.56
848	0.58
849	0.58
850	0.55
851	0.51
852	0.41
853	0.32
854	0.23
855	0.17
856	0.14
857	0.12
858	0.13
859	0.13
860	0.13
861	0.12
862	0.12
863	0.09
864	0.08
865	0.09
866	0.07
867	0.08
868	0.08
869	0.08
870	0.08
871	0.08
872	0.08
873	0.08
874	0.08
875	0.13
876	0.14
877	0.14
878	0.14
879	0.14
880	0.16
881	0.2
882	0.2
883	0.17
884	0.17
885	0.16
886	0.17
887	0.23
888	0.24
889	0.25
890	0.27
891	0.31
892	0.37
893	0.44
894	0.48
895	0.44
896	0.46
897	0.45
898	0.45
899	0.43
900	0.36
901	0.29
902	0.24
903	0.22
904	0.17
905	0.13
906	0.09
907	0.07
908	0.07
909	0.08
910	0.1
911	0.15
912	0.21
913	0.31
914	0.37
915	0.45
916	0.54
917	0.59
918	0.64
919	0.66
920	0.68
921	0.68
922	0.71
923	0.7
924	0.63
925	0.61
926	0.54
927	0.47
928	0.42
929	0.35
930	0.29
931	0.26
932	0.29
933	0.29
934	0.33
935	0.34
936	0.4
937	0.43
938	0.47
939	0.51
940	0.54
941	0.6
942	0.57
943	0.57
944	0.51
945	0.49
946	0.41
947	0.34
948	0.26
949	0.18
950	0.17
951	0.15
952	0.12
953	0.1
954	0.1
955	0.08
956	0.07
957	0.07
958	0.08
959	0.1
960	0.11
961	0.13
962	0.13
963	0.14
964	0.14
965	0.15
966	0.15
967	0.14
968	0.18
969	0.16
970	0.19
971	0.23
972	0.28
973	0.3
974	0.33
975	0.4
976	0.37
977	0.4
978	0.39
979	0.37
980	0.32
981	0.29
982	0.26
983	0.19
984	0.18
985	0.14
986	0.14
987	0.12
988	0.12
989	0.12
990	0.11
991	0.13
992	0.13
993	0.14
994	0.12
995	0.12
996	0.12
997	0.13
998	0.12
999	0.1
1000	0.09
1001	0.09
1002	0.08
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.06
1007	0.07
1008	0.08
1009	0.07
1010	0.08
1011	0.11
1012	0.13

A0A1Q3EF80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer